Pääsihteeri prefektuurin on virkamies ja Ranskan hallinnon .
Prefektuurin pääsihteeri on osaston prefektin ensimmäinen yhteistyökumppani , jota hän avustaa yleisten tehtäviensä suorittamisessa. Alaisuudessa jälkimmäisen, se johtamisesta vastaa osastojen politiikan hallintaan suurten osastojen muistiinpanot sekä sysäystä toimintamuotoihin valtion osastolla. Se hyötyy suuresta allekirjoitusten delegoinnista. Hän vastaa suhteista prefektuurin edustajiin ja hallinnoi prefektuurin budjettia ja varoja.
Prefektuurin pääsihteeri korvaa prefektin hänen poissaolonsa tai virkansa yhteydessä. Hän on hallintopiirin aliprefekti .
Hän avustaa hallinnollisen palvelujen prefektuurin, ryhmitelty tietty osastoihin, otsikot, jotka vaihtelevat lääninhallituksille. Hänellä on tilauksillaan johtaja, joka vastaa johdon valvonnasta ja arvioinnista.
Prefektuurin pääsihteerin tehtävä perustetaan 28 pluviôse An VIII: n lailla (17. helmikuuta 1800). Tilaus20. joulukuuta 1815päättää taloudellisuuden vuoksi yhdistää lääninpaikkapiirin aliprefektin ja prefektuurin pääsihteerin tehtävät: prefektuurien pääsihteerit rinnastetaan aliprefekteihin. Prefektuurin pääsihteerit poistetaan1 kpl elokuu 1817, jonka jälkeen se palautettiin 1. st toukokuu 1820.