Taksonomia
Taksonomia tai taksonomia on haara luonnontieteen (nimeksi biologia klo XX : nnen vuosisadan), jonka tavoitteena on kuvata monimuotoisuus elävien organismien ja muodostaa näistä yhteisöistä kutsuttu eliösystematiikan tunnistaa (muun muassa tunnuksia ), kuvaamaan niitä , nimi niitä ja luokittelee ne .
Se muodostaa systemaattisen osa-alueen, jonka tavoitteena on ennen kaikkea luetella ja määritellä eri elävien organismien väliset sukulaisuussuhteet ja luokitella ne hierarkkisiin luokkiin (esim. Sukut, perheet, järjestykset). Nämä kaksi tieteenalaa liittyvät niin läheisesti toisiinsa, että ero taksonomian ja systemaattisuuden välillä ei ole aina ilmeistä.
Nykyaikainen taksonomian evoluution, nojautuu täysin fylogeneettiseen lähestymistapa luokitukseen mutta taksonomioita empiiristä näyttöä analyysi pysyi pitkään tuntematon tieteeseen ennen saapumista, toisella puoliskolla XX : nnen vuosisadan löytöjä molekyylibiologian .
Laajemmassa merkityksessä termiä taksonomian käytetään nyt muiden tieteiden, kuten humanististen ja yhteiskuntatieteiden , tieto tieteiden tai tietokoneen tiede .
Sana taksonomia tulee kreikan kielestä τάξις ( taksit ) "sijoitus", "luokittelu", "järjestys" ja νομός ( nomos ), joka tarkoittaa "laki", "sääntö"). Termin loi taksonomian oikeinkirjoituksen nojalla vuonna 1813 sveitsiläinen kasvitieteilijä Augustin Pyrame de Candolle (1778-1841) perustieteellisessä kasvitieteellisessä teoksessa tai luonnollisen luokittelun periaatteiden sekä kasvien kuvaamisen ja tutkimisen taiteessa. , nimeämään "luokitteluteoriassa" sekä menetelmän että sen, minkä hän piti "filosofisen kasvitieteen perustana" ( Mémoires et souvenirs , Book III, § 11). Vuonna 1819 julkaistussa toisessa painoksessa hän piti taksonomian sanan kirjoitusvirhettä alkuperäisessä muodossaan toteamalla: "Oikeampi olisi sanoa taksonomia; mutta ajattelin, että minun täytyi myöntää e: n poistaminen , jotta sana olisi lyhyempi. " . Tämä osoittaa, että De Candolle tosiasiallisesti johti terminsä taksonomia , ei nimellisestä τάξις ( taksit ), vaan sen genitiivistä τάξεως ( taksot ).
Termi taksonomia vahvistettiin vuonna 1836 Ranskan akatemian sanakirjan täydennysosassa .
Taksonomista oikeinkirjoitusta suositeltiin vuonna 1864. Émile Littré , ranskankielisessä sanakirjassaan (versio 1872-1877) täsmensi, että myös taksonomiaa tai taksionomia voidaan käyttää, joka muodostettiin kreikkalaisissa etymon- takseissa (järjestys). Grand Dictionnaire Terminologique vuonna Quebecissä , vahvistaa, että luokittelu on suositeltavaa, useat kirjoittajat harkitsee "taksonomian" kuin "jäljitys Englanti taksonomian ", joka on kuitenkin historiallisesti väärä. Todellakin, taksonomian ei näy Englanti kunnes 1819 vaikutuksen alaisena Ranskan, kuuden vuoden kuluttua se keksi De Candolle. Ranskalaiset sanakirjat levittävät kuitenkin edelleen virhettä, jonka mukaan taksonomian oikeinkirjoitus (De Candolle, 1813) vastaa Englannin taksonomiaa . Päinvastoin, useimmat englantilaiset sanakirjat väittävät oikein, että sana taksonomia on peräisin ranskasta, ja TLFI: n osalta englantilainen taksonomia ilmestyi vasta vuonna 1828 Websterin amerikkalaisessa sanakirjassa .
Termi taksonomia ei johdu sanasta taksoni, joka on käsite, joka ilmestyi myöhemmin (sana, jonka kasvitieteilijä Herman Johannes Lam loi vuonna 1948 ). Taksonomia ei siis ole etymologisesti taksonien tutkimusta, vaan järjestyslakia, siis luokittelusääntöjä . Jotkut asiantuntijat tekevät eron erityisesti kasvitieteellisessä käytössä taksonomian, joka muodostui Kreikan etymon nómosissa (laki, sääntö), koskee luokittelukysymyksiä, ja taksonomian välillä, joka muodostui kreikkalaisesta etymon ónomasta (nimi), liittyy nimikkeistöasioihin . Muut tutkijat käyttävät termiä taksionomia työssään, erityisesti eläintieteessä , elävien olentojen ryhmien nimeämiseksi. Kuitenkin sanaa taksonomiaa käytetään ja käytetään usein myös taksonien kuvaustieteen nimeämiseen. Jopa kirjoittajat, jotka kannattavat termin "taksonomia" käyttöä, eivät puhu "taksineista", vaan taksoneista, lukuun ottamatta entomologian asiantuntijaa, joka vetoaa ranskankieliseen tiedon levittämiseen ja pahoittelee englannin vaikutusta. Muut kielet käyttävät samankaltaisia termejä kuin "taksonomia", ei "taksonomia"; Niinpä me kirjoittaa Taksonomia saksaksi, taksonomian Englanti, taxonomía espanjaksi (espanjaa), taxonomia portugaliksi ja Katalonian, tassonomia italiaksi, таксономия ( taksonomiya ) venäjäksi jne
Vuonna 1957 Ranskassa tiedeakatemia hyväksyi nimen "taksonomia" luokittelutieteen osoittamiseksi.
Termi tuli yleinen käytäntö XXI th luvulla, joko alkuperäisen käsikirjoituksen, taksonomian, vaikka se on etymologisesti kyseenalaiseksi tai katsotaan väärin, tai alle oikeinkirjoituksen korjattuna Émile Littréstä , taksonomian kanssa "i", vaikka että yksi on tietoisesti vääräksi. Jotkut pitävät o: n korvaamista i: ksi purismina , jotka pitävät parempana termistä "taksonomia", väittäen enemmistön käytön, johdonmukaisuuden ja "prioriteettiperiaatteen".
Sana "taksonomia" käytetään kaksikielisen kansainvälisen eläintieteellisen nimikkeistön (julkaistu ranskaksi ja englanniksi ) liitteissä vuonna 1961 ensimmäisen painoksen osalta ja vuonna 1964 toisen painoksen osalta.
Code International de nomenclature zoologique -lehden (1985) kolmannen painoksen ranskankielisessä tekstissä mainitaan termi "taksonomia". Kun sanasto ”taksonomian” määritellään ”teoria ja käytäntö luokitella organismien osa järjestelmällisyyttä, eliöryhmien ja niiden monimuotoisuuden tutkiminen ”.
Eläintieteellisen nimikkeistön kansainvälisen koodeksin (1999) neljännen painoksen ranskankielisessä tekstissä mainitaan kaksi termiä "taksonomia" ja "taksonomia". Sanastossa "taksonomia tai taksonomia" määritellään "organismien luokittelun teoriaa ja käytäntöä".
Vuonna biologia, taksonomian erottamattomasti systematiikka . Jälkimmäinen määritellään elävien tai fossiilisten organismien monimuotoisuuden ja evoluutio-suhteiden tutkimukseksi, ja se sisältää luonnollisesti kaksi täydentävää komponenttia, jotka ovat filogenetiikka , toisin sanoen ' elämänpuun jälleenrakentamisesta kiinnostunut kurinalaisuus ja taksonomia, joka tuottaa muodolliset luokitukset. Tapa, jolla taksonomian on otettava huomioon filogenetiikan tulokset, on myös vilkkaan metodologian ja ennen kaikkea filosofisten kiistojen lähde.
Käytännössä termi "systemaattinen" tarkoittaa sekä käytettyä menetelmää (sanotaan esimerkiksi "filogeneettinen järjestelmä") että tällä menetelmällä saavutettua tulosta (" Agaricales- järjestelmä "). Tuloksen konkreettisessa mielessä nämä kaksi tiedettä eivät ole kovin erillisiä ja sekoittuvat usein, koska samat ihmiset harjoittavat niitä samanaikaisesti. Taksonomisteja on aina kutsuttu systemaattisiksi, koska tutkittuaan ja kuvattuja organismeja he yrittivät luonnostaan luokitella ne alhaisten lajien tasoon ( alfa-taksonomia tai "primaarinen taksonomia").
Ne, jotka käyttävät pääasiassa menetelmän merkitystä ( erityisesti filogenetikot ), nimeävät tuloksen usein luokitukseksi tai joskus "taksonomiaksi" kielen väärinkäytöllä, etenkin muilla kuin biologisilla aloilla (ks. Taksonomia (erittely) ).
Ensimmäinen luokittelu kasvien johtuu yleensä Theofrastos lopussa on IV : nnen vuosisadan eaa. JKr , vaikka sen kasvien historia vie osittain Pythagorean koulun teorioita . Ensimmäinen tunnettu luokittelija eläimistä oli Aristoteles , traktaatissa Eläinten historia . Se, joka on perinteisesti esitetty "tieteen isänä", lainaa eron Democrituksesta jakamalla eläimet kahteen luokkaan: eläimiin, joilla on verta ja joihin ei ole verta (eläimet, joissa on valkoista tai väritöntä verta ja jotka hän nimeää imusolmukkeiksi). Hän jakaa punasisäiset eläimet viiteen luokkaan (elävät nelijalkaiset, valaat, linnut, munasolut nelijalkaiset ja kalat) ja valkoveripitoiset eläimet neljään (nilviäiset, koet , äyriäiset ja hyönteiset).
Luonnontieteilijä Ruotsin Linnaeus ( 1707 - 1778 ) loi perustan järjestelmällistä , ja oli kirjoittanut luokittelun, jonka keskeiset periaatteet olivat pohjana tieteellisen järjestelmällistä puoliväliin asti XX : nnen vuosisadan .
Vaikka Jussieun menetelmän tapaan siinä käytetään binomisia nimiä ja kannatetaan "luonnollista menetelmää" toisin kuin Carl von Linnén "keinotekoista järjestelmää" , de Candollen ehdottama taksonomia poikkeaa siitä leikkausten tärkeyden vuoksi. Vaikka Linnén ja Jussieun luonne " ei tee harppausta ", Candolle vaatii epäjatkuvuuksia, jotka ovat taksonin , sekä kokonaisuuden että leikkauksen , käsitteen perustana .
Klassisessa systemaattisessa järjestelmässä (joskus kutsutaan nimellä Linnaean) taksonien sisäinen hierarkkinen järjestys perustui alun perin "morfologisen" samankaltaisuuden ja oletettujen yhtäläisyyksien kriteereihin. Vaikka se on voimakkaasti antroposentrinen ja heijastaa elävien olentojen monimuotoisuuden ( Jumalan luomakunnan ) syitä, kuten ajattelimme seuraavat 250 vuotta, se on kuitenkin vielä XXI - luvun alussa , osa kaikkien luonnontieteilijöiden yhteistä kulttuuritausta. Mutta myöhemmin, kun tieto edistyi, erityisesti Jean-Baptiste de Lamarckin ja Charles Darwinin työstä , tällä järjestyksellä oli nopeasti pyrkimys antaa myös kuva evoluutiosta .
Ihmiskeskeisyys hävisi kanssa Charles Darwin , joka suositteli 24. marraskuuta 1859 (vuonna Lajien synty ) puhtaasti genealoginen luokitusta . Jos evoluutio on tapahtunut, lajit olisi luokiteltava niiden evoluutioarvoisuuden mukaan . Mutta kestää melkein vuosisadan, ennen kuin polyfyleettisten taksonien eliminoinnista tulee yksimielinen. Toisaalta termin "sukututkimus" erilaiset tulkinnat Darwinissa patristisen etäisyyden tai viimeisen yhteisen esi-isänsä suhteellisen uusiutumisen vuoksi synnyttivät taksonomiassa kaksi vastakkaista älyllistä virtaa, vastaavasti evoluutio ja kladismi .
Vuoden jälkipuoliskolla XX : nnen vuosisadan , ns systemaattista fylogeneettiseen kasvoi rekonstruktion menetelmän, joka oli jättimenestys kehitys: kladistiikka aloittaman Willi Hennig vuonna 1950 . Tämä menetelmä perustuu maailmanlaajuisesti evoluutiosuhteisiin, joiden luokittelun valinnan peruskriteeri on, että sen on heijastettava tiukasti filogeenisuutta, toisin sanoen lajien välisiä sukulaisuussuhteita. Itse tällaisen fylogeenin käsite on seurausta evoluutioteoriasta , ja fylogeneettisten puiden ennustava menestys on yksi tämän teorian todisteista.
Automaattinen geenianalyysi sekä tietokonetyökalujen ja -mallien kehittäminen ovat mahdollistaneet merkittävän edistymisen genomiikassa . Ne asettavat tiettyjä lajeja tai lajien ryhmiä ja mahdollistavat niiden uudelleenmäärittelyn ja mahdollistavat lajien paremman tuntemisen ja seurannan.
Kaikki nykyiset luokitukset ovat muodossa puun (puuvartista luokitus), juuresta lukien kaikki elävän olennot, jotka ovat olemassa tai ovat olleet olemassa, jotta yksilöille . Jokainen puun solmu määrittelee taksonin , joka ryhmitellään kaikki solmun luomat alitaksonit.
Tärkeä ja melko vakaa luokittelukäsite on laji . Tämä ryhmittely on suhteellisen hyvin määritelty, ainakin jalostuslajien osalta .
Laji on määritelty haitallisten elävien olentojen yhteisöksi (tai interfertiiliksi , joka pystyy lisääntymään keskenään), joka kykenee vaihtamaan geneettistä materiaalia ja tuottamaan jälkeläisiä itse hedelmällisiksi (todellakin jotkut saman suvun yksilöt, jotka kuuluvat eri lajeihin, voivat siirtyä antaa hybridihenkilö , mutta tämä on useimmiten steriili). Tiukasti aseksuaalisen lisääntymisen tapauksessa puhumme väärin lajeista sukulinjan sijasta , jolloin ryhmä on puhtaasti filogeneettinen. Elämistä rajoittavien entiteettien ( virukset , prionit ) tapaus on edelleen erilainen; ne eivät yleensä kuulu luokituksiin. Toinen vaikeus mainita on tiukat symbioosit , kuten jäkälät (joissa yhdistyvät sieniluontoinen organismi ja fotosynteesiin kykenevä organismi, kasviluonto), mutta yleensä toinen kumppaneista pystyy elämään ilman s yhdistää toisen, ja voimme luokitella ne kahteen erilliseen lajiin, joiden ominaisuus on, että toinen näistä lajeista ei kykene selviytymään ilman toista.
Taksonomisti suorittaa uuden lajin kuvauksen nykyisen tiedon perusteella käytettävissä olevien tietojen ja analyysityökalujen perusteella. Toinen asiantuntija, jolla ei ole samaa käsitystä, voi kyseenalaistaa tämän kuvauksen tai löytää uusia analyysimenetelmiä.
Laji on nimetty mukaan binomisen järjestelmän käytetty ensimmäisen kerran Guillaume Rondelet ja Pierre Belon vuonna XVI : nnen vuosisadan ja yleistää Carl von Linné vuonna kahdeksastoista th luvulla . Lajin tieteellinen nimi on kahden latinankielisen sanan yhdistelmä tai latinalaisena pidetty (yleensä kolmella tietyillä aloilla, alalajille, lajikkeelle tai muodolle), yleensä kursiivilla kirjoitettu : suvun nimi, jota seuraa yksi tai kaksi tiettyjä epiteettejä.
Sukuarvon alapuolella kaikkia taksonimiä kutsutaan yhdistelmiksi. Yhdistelmiä on useita:
Nykyinen filogeneettinen lähestymistapa käyttää tietoja kladistiikasta , mutta sen vaatimukset rajoittuvat vain monofyleettisten taksonien hyväksymiseen , toisin sanoen tiettyyn kladiin . Se pyytää, että taksot rajoitettaisiin niihin, jotka täyttävät seuraavat kaksi ehtoa:
Puhumme sitten vain monofyleettisestä tai verhotusta taksonista. Tämä rajoitus on johtanut tieteellisen luokittelun perusteellisiin muutoksiin, joista osa kaataa kulttuuriperinnön muokkaaman "terveen järjen". Siksi dinosaurukset eivät ole kadonneet , nykyaikainen systemaattisuus sisällyttää linnut dinosaurusten ryhmään.
Muiden esimerkkien joukossa perinteisillä taksoneilla, kuten matelijoilla , kaloilla , levillä , kaksisirkkaisilla , pongideilla , ei ole oikeutta mainita filogeneettisissä järjestelmissä, koska niitä pidetään polyfyleettisinä (monilähteisinä) tai parafylaattisina (epätäydellisinä) ( kaksisirkkaiset on korvattu kaksisirkkaiset totta ). Toiset selvisivät joillakin jälkivaikutuksilla, kuten sienillä . Lopuksi jotkut ovat selviytyneet myrskystä eläiminä ( metatsoja ) tai nisäkkäinä . Huomaa, ettei ollut mitään ilmeistä, että kaikilla monisoluisilla eläimillä on yhteinen esi-isä, joka erottaa ne kaikista kasveista tai sienistä.
Sen lisäksi sen rakenne pysyy pohjimmiltaan linnaalaisena ja sen nimikkeistö (eli itse nimet).
Fylogeneettisten puiden rakentamiseen on useita teknisiä lähestymistapoja.
Julkaisujen mukaan tähän päivään saakka löytyy kaiken tyyppisiä luokituksia perinteisestä luokituksesta, jota on tuskin tarkistettu, tiukasti kladistisiin luokituksiin ilman taksonomisia rivejä , jotka kulkevat eri seosten läpi, esimerkiksi pitämällä taksonomisia rivejä mutta yhdenmukaistettuina kladeihin , tai fylogeneettiset hoitomenetelmät korostavat automaattisesti kehittyviä arvosanoja .
Käytännöistä kuria kehittyessä kohti integroiva tiede artikuloimalla keräämistä näytteistä alalla, eri puolilla maailmaa, ja työn kuvausta laboratoriossa , liittämällä perinteiset lähestymistavat ( morfologia , ekologia , jne ), ja uudemmat molekyylit ( molekyylinen viivakoodaus ).
Edistysaskeleet genetiikan ja bioinformatiikan myös mahdollistavat etukäteen taksonomian, joka johtaa myös usein korjaukset ja päivitykset, jotka joskus tapahtuu vaihtoehtoisia, yhteistyökykyisiä ja reaktiivisia muotoja tieteellisen julkaisun.
Lisäksi bakteerien biologisen monimuotoisuuden tai maaperässä tai valtamerissä esiintyvien mikrobilajien tutkimus on monimutkaista ja edellyttää - metagenomiikan ( mikrobien DNA-viivakoodaus ) uusien keinojen lisäksi - monien asiantuntijoiden välistä yhteistyötä ympäri maailmaa. maailman.
Luonnontieteilijät ovat kehittäneet työkaluja yhteistyöhön ja jakamiseen esimerkiksi Tela botanican ( kasvitieteilijät ) ja viime aikoina European Journal of Taxonomy (EJT) -lehden kanssa . Se on kansainvälinen tieteellinen julkaisu kuvailevasta taksonomiasta, jota tukee WCY-konsortio ( luonnonhistoriallisista museoista ja kasvitieteellisistä puutarhoista ), julkaistu englanniksi, sähköisessä muodossa, Open Access -lisenssillä, Creative Commons -lisenssillä (3.0), eli avoin pääsy, ilmainen julkaisu ja ilmainen kuuleminen. Se käsittelee eläintieteen , entomologian , kasvitieteen ja paleontologian aloja . Artikkelit ovat omaperäisiä teoksia, joiden on täytettävä tieteellisen sisällön ja muodon (tyyli, piirrokset jne.) Korkeat laatukriteerit. Lehti on eurooppalainen, mutta aiheet voivat koskea kaikkia lajeja niiden alkuperämaasta riippumatta. Taksonomisia versioita, monografioita ja temaattisia tai mielipide-artikkeleita voidaan siten jakaa paremmin ja nopeammin.
: tämän artikkelin lähteenä käytetty asiakirja.