Tupakan mosaiikkivirus
Tupakan mosaiikkivirus TMV-sauvatTyyppi | Virus |
---|---|
Kuningaskunta | Riboviria |
Hallitse | Orthornavirae |
Haara | Kitrinoviricota |
Luokka | Alsuviricetes |
Tilaus | Martellivirales |
Perhe | Virgaviridae |
Ystävällinen | Tobamovirus |
Tupakan mosaiikkivirus (TMV tupakan mosaiikkivirus ) on laji on viruksen ja suvun Tobamovirus ( perhe on virgaviridae ), joista hän on lajille . Tämä on ensimmäinen virus olisi voitu havaita vuoden lopulla XIX : nnen vuosisadan . Tämä kasvivirukset vuonna kosmopoliitti , tartuttaa monia lajeja kasveja , erityisesti yhteisen tupakan ( Nicotiana tabacum ) ja muut perheenjäsenet Solanaceae johonka se aiheuttaa muun valkaisu oireita lehtien muodossa mosaiikit tai aaltoiluvirhettä. Se on positiivinen-, yksijuosteisesta RNA-virus , joka on luokiteltu ryhmään IV ja Baltimoren luokituksen .
Tupakan mosaiikkiviruksen tutkimuksella on suuri kiinnostus perusbiologiaan, virusten biologian ymmärtämiseen, isäntä-patogeeni-vuorovaikutusten tutkimiseen, solubiologiaan . Se kiinnostaa myös biotekniikkaa , tarkemmin sanottuna paristojen kapasiteetin lisäämistä. Se voidaan havaita negatiivisessa värjäyksessä elektronimikroskopialla.
TMV -virioni on sylinterimäinen, jäykkä sauvamainen hiukkasen kierukka-symmetria, 300 nm pitkiä ja 18 nm halkaisijaltaan. Kapsidi koostuu 2300 kapsidiproteiinien ( kapsomeeristä ), kukin kapsomeereja muodostuessa yhden tyyppisen proteiinin, joka koostuu 158 aminohaposta. Yhden - stranded RNA on kierretty helix sisälle kapsidi, jää tyhjä keskeinen kanava 4 nm halkaisijaltaan, nähtävissä elektronimikroskoopilla. Tämän viruksen terminen inaktivoitumispiste on 90 ° C, mikä antaa sen kestää tätä lämpötilaa 10 minuutin ajan.
TMV genomi on yksiosainen, lineaarinen yksijuosteinen RNA- molekyyli, jossa on positiivinen polariteetti, joka on 6395 nukleotidia . Tämä RNA koodaa rajoitettua määrää proteiineja.
Siinä on neljä avointa lukukehystä (ORF), joista kaksi, jotka sijaitsevat genomisen RNA: n 5'-proksimaalisella alueella, koodaavat kahta samanaikaisesti aloitettua proteiinia, jotka ovat vastaavasti 126 kDa ja 183 kDa, joita pidetään replikaasin komponentteina . 183 kDa: n proteiini syntyy lukemalla 126 kDa: n proteiinin UAG- lopetuskodoni .
Muut proteiinit tuotetaan kahdesta subgenomisesta RNA: sta, jotka koodaavat vastaavasti liikkumisproteiinia (MP, 30 kDa), kapsidiproteiinia (CP) ja kolmatta proteiinia nimeltä 54 kDa.
Genomia reunustavat koodaamattomat sekvenssit, 5'-päässä (5'NC) metyloidun nukleotidikannen (m7G5'pppG) ja 3'-päässä (3'NC) samanlainen rakenne kuin siirrä RNA (tRNA), jolla on viisi näennäissolmua.
TMV: llä on laaja isäntävalikoima , koska se voi tartuttaa yli 150 kasvilajia, useimmiten kaksisirkkaisia ruohoja, mukaan lukien monet taloudellisesti erittäin tärkeät kasvit , mukaan lukien vihannes- ja koristekasvit , sekä rikkaruohot . TMV: n tärkeimmät isäntäkasvit kuuluvat Solanaceae- perheisiin : tupakka , tomaatti ), pippuri , munakoiso , peruna , Fabaceae : papu , cowpea , soija , mutta myös muille perheille: kevätsipuli , valkosipuli , selleri , punajuuri , ristiinnaulit .
Tupakan mosaiikkiviruksen (TMV) aiheuttamat oireet vaihtelevat isäntäkasvien mukaan. Lehdet vaalenevat ja niiden pinnalle ilmestyy vihreää mosaiikkia . Kohokuvioiduista esitteistä tulee lankamaisia, palava ulkonäkö ja taipumus käpristyä. Voidaan myös havaita täplityksen, nekroosin, tajunnan, lehtien käpristymisen, kudoksen keltaisuuden oireita. Oireet riippuvat suuresti tartunnan saaneen kasvin iästä, ympäristöolosuhteista, viruskannasta ja isäntäkasvien geneettisestä koostumuksesta. Jotkut TMV-kannat tartuttavat myös tomaatteja aiheuttaen erilaisia oireita, etenkin hedelmille: muodonmuutoksia, viivästynyttä kypsymistä, epätasaista väriä sekä alentunutta saantoa.
Virusta löytyy maaperästä, kasvijätteistä, siemenistä ja pohjavedestä.
Vuonna 1892 saksalainen virologi Adolf Mayer kuvasi tautia, joka on vaikuttanut Wageningenin (Surinamen) ympäristössä tupakanviljelmiin useita vuosia , ja osoittaa, että se tarttuu kasvien välillä, kuten bakteeri-infektiot, ja että saastuttava aine menettää tarttuvuutensa lämpötilassa 70 ° C . Venäläinen kasvitieteilijä Dmitri Ivanovski osoitti samana vuonna, että sairaiden tupakakasvien mehu sisälsi tartunta-ainetta, jota Chamberland- kynttilän suodattimet eivät pidättäneet ; hän ajatteli tuolloin, että se oli toksiini tai hyvin pieni bakteeri. Hollantilainen kemisti Martinus Beijerinck syvensi tätä työtä vuonna 1898. Hän hylkäsi toksiinin hypoteesin osoittamalla, että laimennus ei vaikuttanut tartunnan saaneiden kasvien tarttuvuuteen, ja kutsui ilmiötä Contagium vivum fluidumiksi tai virukseksi; Laimennuksen tehottomuus kontaminaation estämiseksi hyväksyttiin kuitenkin vasta vuonna 1915 Harry Allardin työn jälkeen. Ivanovski osoittaa myös, että virus ei voi lisääntyä tartuttamatta kasvia. Välittäminen VMT mukaan kirvoja ehdotettiin jo vuonna 1914. Ensimmäiset mutaatiot on VMT, myös ensimmäinen mutaatiot havaittua tai virus, kuvattiin vaihteessa 1920-1930 Harold McKinney ja James Jensen. Vuonna 1936 Wendell Meredith Stanley teki siitä ensimmäisen viruksen, joka kiteytyi proteiinikiteiden muodossa ja jota tutkittiin röntgendiffraktiolla , mikä osoittaa, että se koostuu sekä proteiineista että RNA: sta . Risti-immuniteetin ilmiö havaitaan samanaikaisesti ensimmäistä kertaa kasveissa, jotka kohtaavat infektioita VMT: n eri muunnoksilla; rinnakkain Helen Purdy Beale (en) onnistuu tuottamaan spesifisiä vasta-aineita VMT: lle injektoimalla tartunnan saaneita mehuja kaneihin . Vuonna 1939 se oli yksi ensimmäisistä viruksista, joita havaittiin elektronimikroskoopilla . Se oli Rosalind Elsie Franklin, joka vuonna 1953 osoitti, että tällä viruksella on vain yksi säie, ja hän myös määritteli sen sijainnin. Ensimmäinen virusresistentti GMO oli myös TMV-resistentti tupakkakasvi.
Mukaan NCBI (01 tammikuu 2021) :
TMV voivat aiheuttaa merkittäviä saannon menetyksiä tupakan, tomaatin ja pippuri ja chili kasveja ympäri maailmaa. Chilipippurin ja paprikan ( capsicum annuum ) tapauksessa sadon lasku on arvioitu jopa 90%, mikä johtuu TMV: stä yhdessä muiden virusten kanssa. Tomaateissa jopa 34 prosentin tappiot on saatu kokeellisesti. Munakoisoviljelmät vaikuttavat vähemmän vaikuttavan.
Varhainen TMV-tartunta voi vaikuttaa nuoriin tupakakasveihin taimitarhoissa tai avomaalla. Jos suuri osa kasveista on tartunnan saaneita elinsiirron aikana tai pian sen jälkeen, se voi johtaa jopa 50%: n sadonlaskuun. Myöhäiset hyökkäykset kentällä eivät ole harvinaisia ja voivat vahingoittaa keski- ja ylälehtiä.
Teollisuusmaissa TMV: n merkitys on kuitenkin resistenttien lajikkeiden käytön ansiosta vain satunnaista.
Kasviviruksia voidaan käyttää suunniteltaessa virusvektoreita , työkalut, joita käytetään yleisesti molekyylibiologian käyttöön geneettisen materiaalin osaksi kasvisoluun ; ne ovat myös biomateriaalien ja nanoteknologian laitteiden lähteitä. TMV-pohjaiset virusvektorit sisältävät TRBO- ja magnICON-kasvien ilmentämistekniikoiden vektorit. Sylinterimäisen muodon, korkean kuvasuhteen, kyvyn itse koota ja sisällyttää metallipinnoitteet ( nikkeli ja koboltti ) kapsidiin ansiosta TMV on ihanteellinen ehdokas sisällytettäväksi akkuelektrodeihin . TMV: n lisääminen akkuelektrodiin lisää merkittävästi reaktiivista pinta-alaa, mikä voi sallia akun kapasiteetin kasvavan jopa kuusi kertaa tasomaisen elektrodigeometrian avulla saavutetulla
Tupakan mosaiikkiviruksen proteiinin ( Acetylseryltyrosylseryliso ... serine ) nimi , kanta dahlemense , mainitaan yleensä pisimpänä englanninkielisenä julkaistuna sanana 1185 kirjaimella: sitä esiintyy amerikkalaisissa julkaisuissa vuosina 1964 ja 1966.