In ihmisgenetiikkaan , haplogroup E (E-M96) on Haploryhmä ja Y-kromosomin . Se on yksi vanhemman haploryhmän DE kahdesta päähaarasta, toinen haploryhmä D. E-M96-kladetti on jaettu kahteen pääalaryhmään: yleisempään E-P147 ja vähiten yhteiseen E-M75.
Se on yleisin haploryhmä Afrikassa , jossa sen uskotaan ilmestyneen ainakin 69 000 tai 73 000 vuotta sitten. Tämä Haploryhmä löytyy etenkin Afrikassa , The Lähi-idässä , mutta myös Euroopassa joukossa albaanien välillä 40 ja 50%, lähinnä Etelä- ja Itä alemmilla taajuuksilla.
Tämän haploryhmän maantieteellisestä alkuperästä keskustellaan, ja on olemassa useita hypoteeseja:
Vuonna 2001 Underhill väitti, että haploryhmä E oli todennäköisesti läsnä Saharan alueella aikana, jolloin se ei ollut autiomaa (eli noin 45 000 vuotta sitten). Kun Sahara alkoi autioitua, alueen asukkaat lähtivät asettumaan suotuisammille alueille. Tuolloin tämä haploryhmä jakautui useisiin alaryhmiin. Underhill ehdotti vuonna 2001 Itä-Afrikkaa tämän haploryhmän lähtöpaikaksi.
Vuonna 2008 Karafetin tekemä tutkimus, jonka mukana oli myös Hammer, väitti, että afrikkalainen alkuperä oli todennäköisempää. Tämä tutkimus järjesti huomattavasti aika-arviot, mikä johti uusiin tulkintoihin vanhojen alaluokkien maantieteellisestä alkuperästä. Tässä artikkelissa ehdotettiin muun muassa paljon vanhempaa haploryhmän E-M96 ikää kuin aiemmin oli harkittu, mikä antoi sille samanlaisen iän kuin itse haploryhmä D ja DE, mikä tarkoittaa, että sitä ei ole enää mitään vahvaa syytä pitää sitä DE: n sivutuotteena, jonka on täytynyt tapahtua kauan sen perustamisen ja Aasiassa saapumisen jälkeen.
Vuonna 2015 Poznik ja Underhill väittivät, että haploryhmä E oli syntynyt Afrikan ulkopuolella. Tämä maantieteellisen erottelun malli CT-kladissa edellyttäisi vain yhtä mannermaisen haploryhmän vaihtoa (E Afrikkaan) kolmen (D, C ja F) sijasta Aasiaan. Tämän oletetun paluun Afrikkaan, haploryhmän E ilmaantumisen ja sen erilaistumisen välillä Afrikassa 58 000 vuodella, on yhdenmukainen ehdotusten kanssa, jotka perustuvat muihin kuin Y-kromosomiin, runsaaseen geenivirtaan Afrikan ja Arabian välillä 50: n välillä. ja 80000 vuotta vanha.
Vuonna 2015 Trobetta ym. ehdotti Itä-Afrikan alkuperää haploryhmälle E ja totesi: "Fylogeografinen analyysimme, joka perustuu tuhansiin näytteisiin ympäri maailmaa, viittaa siihen, että haploryhmän E säteily alkoi noin 58 ka: ssa, jossain Saharan eteläpuolisessa Afrikassa, ja posteriorinen todennäköisyys on suurempi ( 0,73) itäafrikkalaisesta alkuperästä. "
Haploryhmän E euraasialainen alkuperä- ja leviämiskeskus annettiin myös vuonna 2018 perustuen mtDNA: n kladin, DE: n ja haploryhmän L3 samanlaiseen ikään . Tämän hypoteesin mukaan on siis ehdotettu, että sen jälkeen, kun Homo sapiens oli muuttanut Afrikan ulkopuolelta noin 125 000 vuotta sitten, ihmiset, joilla oli Euraasian haploryhmä E, palasivat haploryhmän lähtöpaikasta noin 70 000 vuotta vanhoja. , samoin kuin mitokondrioiden haploryhmän L3 naispuoliset kantajat, joiden uskotaan myös olevan peräisin Euraasiasta. Sitten ehdotetaan, että nämä uudet Euraasian sukulinjat korvasivat suurelta osin vanhat alkuperäiskansojen afrikkalaiset mies- ja naispuoliset sukulinjat.
Haber et al. tukee haploryhmän E afrikkalaista alkuperää. Kirjoittajat tukevat afrikkalaista alkuperää DE: lle (E: n emohaploryhmä), E ja D0 ovat myös Afrikasta, sekä kolmen linjan (C, D ja FT) siirtymistä Afrikasta pois, jotka muodostavat nyt valtaosan. -Afrikan Y-kromosomit. Kirjoittajat pitävät myös tutkimuksessa todettuja DE: n, E: n ja D0: n varhaisia eroamispäiviä, joiden on määrä edeltää esi-isien euraasilaisten Afrikan ulkopuolista muuttoliikettä, tukevan näiden haploryhmien afrikkalaista alkuperää.
Haploryhmän E1b1b jakautuminen.
Haploryhmän E1b1a jakautuminen.
E1a (M33) esiintyy Malissa .
E1b1 , ylivoimaisesti yleisin, on jaettu kahteen alaryhmään:
E1b1aHaploryhmä E1b1a , jossa merkki M2 on yleinen (70-100%) Länsi-Afrikan , Keski-Afrikan , Etelä-Afrikan ja Kaakkois-Afrikan populaatioissa .
E1b1b (E-M35)Haploryhmän E1b1b diffuusio.
Haploryhmälle E1b1b (tai E-M215 , aiemmin E3b) on tunnusomaista M215-merkki .
Sen hallitseva alaryhmä on haploryhmä E1b1b1 (tai E-M35 ), jolle on tunnusomaista merkki M35 . Se edustaa viimeisimmälle muuttoa Afrikasta ja Euroopasta . Se ilmestyi ensimmäisen kerran Afrikan sarvessa noin 22 000 vuotta sitten ja levisi Lähi-idän yli ylemmän paleoliitin ja mesoliittisen ajan aikana .
E1b1b1 on yleinen Afrikan sarven , Pohjois-Afrikan , Lähi-idän , Välimeren ja Balkanin populaatioissa . Eurooppalaiset populaatiot, joilla on E1b1b1- haploryhmä, ovat enimmäkseen Välimeren alueelta. He olisivat saaneet Pohjois-Afrikan tai Lähi-idän geneettisen vaikutuksen . Tämän haploryhmän olisivat tuoneet mukaan populaatiot, jotka ovat vuorovaikutuksessa suoraan Pohjois-Afrikan (M81) tai Lähi-idän (M78-V13) kanssa. Viimeksi mainitut populaatiot tulivat Afrikasta kautta Vähä-Aasiassa , ja toi maatalouden Eurooppaan aikana kivikaudelta .
Fylogeneettinen puuKoska alaryhmien nimet vaihtelevat usein, alla oleva puu käyttää päämerkkejä erottaakseen pääryhmän E1b1b eri alaryhmät (ISOGG 2013).
E-M78 (aiemmin E1b1b1a) ilmestyi Itä-Afrikassa noin 18 600 vuotta sitten. E-M78: n sanotaan siirtyneen Afrikasta Egyptin kautta jääkauden lopussa noin 11 000 vuotta sitten siirtomaa Levantin , Anatolian ja Kreikan .
E-M78 on jaettu 4 päähaaraan: E-V12, E-V13, E-V22 ja E-V65. Euroopassa E-V13-alaryhmä on pääasiassa Albaniassa , Kreikassa (40%) ja Sisiliassa .
E-M183E-M183 (aiemmin E1b1b1b), E-M81: n pääalaluokka, tulee Levantista . E-M183 (E-M81) on yleisin isälinja Pohjois-Afrikassa. Vuoden 2017 tutkimus paljastaa voimakkaan samankaltaisuuden E-M183 Y-STR -haplotyyppien välillä, mikä osoittaa tämän haploryhmän nopean laajenemisen. E-M183: n päivitetyt viimeisimmät yhteiset esi-isät (TMRCA) -arvioinnit osoittavat tämän haploryhmän erittäin tuoreen alkuperän (2000-3000 vuotta). Huolimatta STR : n heterotsygoottisuuden vähenemisestä länteen, mikä viittaa alkuperään Lähi-idässä , antiikin DNA-todisteet yhdessä TMRCA-arvioiden kanssa viittaavat E-M183: n paikalliseen alkuperään Luoteis-Afrikassa.
Tämän tutkimuksen mukaan, se ei ole mahdollista sulkea pois tulossa laajentamista Lähi-idän , joka olisi voitu syntyy islamilaisen laajeneminen on VII : nnen vuosisadan, mutta ei varmasti tarvitaan myös neoliittisen , ilmestyi Pohjois-Afrikka Länsi ympärillä 7400 eaa. Ja joka olisi voinut olla voimakas epipaleoliittinen pysyvyys. Tällainen äskettäinen E-M183: n esiintyminen Luoteis-Afrikassa olisi sopusoinnussa muun genomin havaittujen suuntausten kanssa, jossa laajaa sekoittumista, erityisesti Lähi-idän miehillä, todetaan lähes 1300 vuotta, samaan aikaan arabien laajenemisen kanssa. Toinen hypoteesi tarkoittaisi, että E-M183 luotiin jonnekin Luoteis-Afrikassa ja levisi sitten koko alueelle. Tämän haploryhmän alkuperää koskevat ajalliset arviot menevät päällekkäin kolmannen Punisen sodan ( 146 eKr. ) Loppuun , jolloin Karthago (nykyisessä Tunisiassa) voitettiin ja tuhottiin, mikä merkitsi Rooman hegemonian alkua Välimerellä. Noin 2000 vuotta sitten Pohjois-Afrikka oli yksi Rooman rikkaimmista provinsseista, ja väestönkasvu on saattanut olla E-M183: lla.
E-M183-taajuus on yleensä noin 50% Pohjois-Afrikassa, mutta joskus jopa 100% joissakin eristetyissä populaatioissa. Euroopassa tämä haploryhmä esiintyy pääasiassa Iberian niemimaalla , jossa sen taajuus on joskus yli 10% ja korkein pitoisuus Cantabriassa , Pohjois-Espanjassa, jossa sen taajuus saavuttaa 40% Pasiegojen joukossa. Sitä esiintyy myös matalilla taajuuksilla Italiassa ja Etelä- Ranskassa .
E-M34E-M34 (aiemmin E1b1b1c), jolle on tunnusomaista Euroopassa harvinaiset markkerit M123 ja M34, esiintyy pääasiassa Etiopiassa ja Lähi-idässä (Jordaniassa, Jemenissä jne.). Se on myös melko yleistä juutalaisten keskuudessa (10%). Sen esiintyvyys on myös hyvin matala Kaukasuksella (<1%).
E1b1b: n ja sen kolmen pääalaryhmän jakaumaAlue ja väestö | EI | E-M35 * | E-M78 | E-M81 | E-M34 | Lähde |
---|---|---|---|---|---|---|
Euroopassa | ||||||
Pohjoinen portugali | 50 | 2 | 4 | 4 | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Etelä-portugali | 49 | ... | 4.1 | 12.2 | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Pasiegos Cantabriassa | 56 | ... | ... | 41.1 | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Asturialaiset | 90 | ... | 10 | 2.2 | 1.1 | Cruciani et ai. 2004 |
Eteläiset espanjalaiset | 62 | 1.6 | 3.2 | 1.6 | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Espanjan baskit | 55 | ... | ... | 3.6 | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Lounais-ranska | 85 | ... | 4.7 | 3.5 | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Ranskalaiset baskit | 16 | ... | 6.3 | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Korsikanlaiset | 140 | 0.7 | 4.3 | ... | 1.4 | Cruciani et ai. 2004 |
Orkadialaiset | 7 | ... | ... | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Tanskan kieli | 35 | ... | 2.9 | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Pohjois-italialaiset | 67 | ... | 9 | 1.5 | 1.5 | Cruciani et ai. 2004 |
Keski-italialaiset | 89 | ... | 11 | 2.2 | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Etelä-italialaiset | 87 | ... | 11.5 | ... | 2.3 | Cruciani et ai. 2004 |
Sisilialaiset | 136 | ... | 16 | 0.7 | 6.6 | Cruciani et ai. 2004 |
Sardis | 367 | 1.1 | 3.5 | 0,3 | 3.5 | Cruciani et ai. 2004 |
Kiillottaa | 38 | ... | 2.6 | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Virolaiset | 74 | 1.4 | 4.1 | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Venäläiset | 42 | ... | ... | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Romanialaiset | 14 | ... | 17.7 | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Bulgarialaiset | 116 | ... | 18.4 | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Albanialainen | 19 | ... | 31.6 | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Pohjois-Afrikka | ||||||
Marokon arabit | 54 | ... | 38,9 | 31.5 | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Berberit keskimmäisestä atlasesta | 69 | ... | 10.1 | 71 | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Berberit Marrakechista | 29 | 3.4 | 6.9 | 72.4 | 3.4 | Cruciani et ai. 2004 |
Mosabitti-berberit | 20 | ... | ... | 80 | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Pohjois-egyptiläiset | 21 | ... | 28.6 | 4.8 | 4.8 | Cruciani et ai. 2004 |
Etelä-egyptiläiset | 34 | ... | 17.6 | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Itä-Afrikka | ||||||
Etiopian juutalaiset | 22 | 9.1 | 9.1 | ... | 13.6 | Cruciani et ai. 2004 |
Etiopian Amhara | 34 | 2.9 | 8.8 | ... | 23.5 | Cruciani et ai. 2004 |
Etiopian aromi | 25 | 12 | 32 | ... | 8 | Cruciani et ai. 2004 |
Etiopian Wolayta | 12 | 16.7 | 16.7 | ... | 8.3 | Cruciani et ai. 2004 |
Eri etiopialaisia | 12 | 8.3 | 33.3 | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Somalit | 23 | 17.4 | 52.2 | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Borana (Oromo) Keniasta | 7 | 14.3 | 71.4 | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Kenia Bantu | 28 | 10.7 | 3.6 | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Kenian Nilo-Saharans | 18 | 11.1 | 11.1 | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Saharan eteläpuolinen Afrikka | Cruciani et ai. 2004 | |||||
Senegalilainen Mandenka | 16 | ... | 6.3 | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Songhai Nigeristä | 10 | ... | ... | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Nigerin tuareg | 22 | ... | 4.5 | 9.1 | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Niger fulbe | 7 | ... | ... | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Nigerian Fulbe | 32 | ... | ... | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Hausa Nigeriasta | 10 | ... | ... | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Nigerian joruba | 21 | ... | ... | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Biaka Pygmies | 33 | ... | ... | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Mbuti Pygmies | 13 | ... | ... | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Namibia San | 7 | ... | ... | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Etelä-afrikkalaiset Kung | 64 | 10.9 | ... | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Etelä-afrikkalaiset Khwe | 26 | 30.8 | ... | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Bantu eteläafrikkalaiset | 8 | 12.5 | ... | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Lähi-itä | Cruciani et ai. 2004 | |||||
Sephardim Turkista | 19 | ... | ... | 5.3 | 5.3 | Cruciani et ai. 2004 |
Istanbulin turkkilaiset | 35 | ... | 5.6 | 3.7 | 2.9 | Cruciani et ai. 2004 |
Lounais-turkkilaiset | 40 | ... | 8.5 | 2.5 | 2.5 | Cruciani et ai. 2004 |
Koillis-turkkilaiset | 41 | ... | ... | 2.4 | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Keski-Anatolialaiset | 61 | ... | 6.6 | ... | 3.3 | Cruciani et ai. 2004 |
Kaakkois-turkkilaiset | 24 | ... | 4.2 | ... | 4.2 | Cruciani et ai. 2004 |
Erzurumin turkkilaiset | 25 | ... | 4 | ... | 8 | Cruciani et ai. 2004 |
Kyproksen turkkilaiset | 46 | ... | 13 | 8.7 | 2.2 | Cruciani et ai. 2004 |
beduiini | 28 | ... | 3.6 | 3.6 | 7.1 | Cruciani et ai. 2004 |
Druze arabit | 28 | ... | 10.7 | ... | 3.6 | Cruciani et ai. 2004 |
Palestiinalaiset | 29 | ... | 10.3 | ... | 3.4 | Cruciani et ai. 2004 |
Arabiemiirikunnat | 41 | ... | 2.4 | ... | 4.9 | Cruciani et ai. 2004 |
Omanilaiset | 13 | ... | 7.7 | ... | 7.7 | Cruciani et ai. 2004 |
Kaukasus | Cruciani et ai. 2004 | |||||
Azerit | 97 | ... | 2.1 | ... | 2.1 | Cruciani et ai. 2004 |
Adygei | 18 | ... | ... | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Pakistanilainen | 176 | ... | 1.1 | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Itäaasialaiset | 245 | ... | ... | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Oseanian kansalaiset | 21 | ... | ... | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
Amerikan alkuperäiskansat | 43 | ... | ... | ... | ... | Cruciani et ai. 2004 |
E2 (M75) esiintyy sekä Itä- että Länsi-Afrikassa.
Haplogroups Y-kromosomin (Y-DNA) | ||||||||||||||||||||||||
Viimeisin yleinen patrilineaalinen esi-isä | ||||||||||||||||||||||||
AT | ||||||||||||||||||||||||
BT | ||||||||||||||||||||||||
B | CT | |||||||||||||||||||||||
OF | CF | |||||||||||||||||||||||
D. | E | VS | F | |||||||||||||||||||||
G | H | IJK | ||||||||||||||||||||||
IJ | K | |||||||||||||||||||||||
Minä | J | LT | K2 | |||||||||||||||||||||
I1 | L | T | NEITI | P | EI | |||||||||||||||||||
M | S | Q | R | EI | O | |||||||||||||||||||
R1 | R2 | |||||||||||||||||||||||
R1a | R1b | |||||||||||||||||||||||