Archaea (filogeneettinen luokitus)

Tämän sivun tarkoituksena on esitellä Archaean filogeneettinen puu ( Archaebacteria , Archébacteria, Archaea), toisin sanoen kladogrammi, joka korostaa heidän eri ryhmiensä (tai taksonien) välisiä sukulaisuussuhteita, kuten viimeiset tunnustetut analyysit tarjoavat heille. Tämä on vain yksi mahdollisuus, ja tärkeimmät tiedeyhteisön sisällä olevat keskustelut on esitetty lyhyesti alla, ennen kirjallisuusluetteloa.

Fylogeneettinen puu

Tässä esitetyn kladogrammin on tarkoitus olla yhdenmukainen viimeisimpien julkaistujen ja saatavilla olevien analyysien kanssa. Se ei välttämättä ole yksimielistä, ja aina voidaan viitata artikkelin alaosassa olevaan kirjallisuusluetteloon.

Symboli ▲ viittaa elävien olojen filogeneettisen puun välittömästi yläosaan. Merkki ► viittaa kyseessä olevan ryhmän filogeneettiseen luokitukseen. Mikä tahansa puun solmu, jossa on enemmän kuin kaksi oksaa, osoittaa tarkasteltavan ryhmän sisäisen fylogenian määrittelemättömyyden .

Kasvitieteilijöiden ja eläintieteilijöiden typografiset tavat ovat erilaiset. Täällä lukemisen helpottamiseksi ja joillekin nykyisiin ryhmiin, jotka kuuluvat kahteen perinteiseen alueeseen, sukua korkeammat taksonit kirjoitetaan kaikki suorilla merkeillä, sukujen tai lajien nimet kursiivilla.

Jälkeen taksonin , sen aikana ulkonäkö, kun tiedetään, voidaan osoittaa seuraava kuvateksti: ( A. Ple ): Pleistoseeni  ; ( Pli ): plioseeni  ; ( Mio ): mioseeni  ; ( Oli ): oligoseeni  ; ( Eoc ): eoseeni  ; ( Pal ): paleoseeni  ; ( Cre ): Liitukko  ; ( Jur ): Jurassic  ; ( Tri ): Triassic  ; ( Per ): Permi  ; ( Auto ): Hiilipitoinen  ; ( Dev ): devonilainen  ; ( Sil ): silurilainen  ; ( Ord ): Ordoviitsija  ; ( Camb ): Cambrian  ; ( Edi ): Ediacaran . Lisää tarkkuutta, jos mahdollista, ( - ): alempi; ( ~ ): väliaine; ( + ): ylivoimainen.

▲ └─o Archaebacteria ou Archaea ├─o Thaumarchaeota │ ├─o Cenarchaeales │ ├─o Nitrosopumilales │ └─? Nitrosocaldales └─o ├─o │ ├─o Korarchaeota │ └─o Crenarchaeota ou Eocyta │ ├─o Thermoproteales │ │ ├─o Thermoproteaceae │ │ └─o Thermofilaceae │ └─o │ ├─o Sulfolobales │ └─o │ ├─? Fervidicoccales │ ├─o Acidilobales │ │ ├─o Caldisphaeraceae │ │ └─o Acidilobaceae │ └─o Desulfurococcales ou Igneococcales │ ├─o Desulfurococcaceae │ └─o Pyrodictiaceae └─o Euryarchaeota ├─? groupes "ARMAN" ├─o Nanoarchaeota ├─? Nanohaloarchaea └─o ├─o Thermococcales └─o ├─o │ ├─o Methanopyrales │ └─o │ ├─o Methanobacteriales │ │ ├─o Methanobacteriaceae │ │ └─o Methanothermaceae │ └─o Methanococcales │ ├─o Methanococcaceae │ └─o Methanocaldococcaceae └─o ├─o Thermoplasmatales ou Picrophilales │ ├─o Thermoplasmataceae │ └─o │ ├─o Picrophilaceae │ └─o Ferroplasmataceae └─o ├─o Archaeoglobales └─o ├─o Halobacteriales └─o Methanomicrobia ├─o Methanosarcinales │ ├─o Methanosarcinaceae │ ├─o Methanosaetaceae │ └─o Methermicoccaceae ├─o Methanocellales └─o Methanomicrobiales ├─o Methanospirillaceae ├─o Methanocorpusculaceae └─o Methanomicrobiaceae

Tieteellinen keskustelu Archaean kasvillisuudesta

Jos tänään, huolimatta suuresta etäisyydestä, joka erottaa kaksi pääarkealaista divisioonaa, ryhmän monofia tuntuu hankitulta (eukaryoottien juurtumista vastaan ​​eosyyttien sisällä), kiistanalainen kysymys on metanogeenisten bakteerien alkuperä: merkki esiintyi vain kerran myöhään ( vrt Gao ja Gupta), tai edes kerran pohjaan Euryarchea (ja kadota tietyissä ryhmien kesken), tai useita kertoja. Löytäminen uudesta Archaeasta, joka todennäköisesti poikkesi puun juuresta, tai "Richeanin kaivoksen Archean acidophilic nanoorganismeista" (tunnetaan nimellä ARMAN), voimme paremmin vilkaista ryhmän monimuotoisuutta odottaen tyydyttävää näkymää sen phylogeny.

Luokitus Cavalier-Smithin mukaan

Luokitus Cavalier-Smith 2002: n mukaan ─o division des Archaebacteria ├─o sous-division des Euryarchaeota │ ├─o super-classe des Neobacteria │ │ ├─o classe des Methanothermea (probablement paraphylétique) │ │ │ ├─o ordre des Methanobacteriales │ │ │ └─o │ │ │ ├─o ordre des Methanomicrobiales │ │ │ ├─o ordre des Methanococcales │ │ │ └─o ordre des Methanopyrales │ │ ├─o classe des Archaeoglobea │ │ │ └─o ordre des Archaeoglobales │ │ └─o classe des Halomebacteria │ │ ├─o ordre des Methanosarcinales │ │ └─o ordre des Halobacteriales │ └─o super-classe des Eurythermea (probablement paraphylétique) │ ├─o classe des Protoarchaea │ └─o classe des Picrophilea └─o sous-division des Crenarchaeota └─o classe des Crenarchaeota ├─o │ ├─o ordre des Thermoproteales │ ├─o ordre des Sulfolobales │ └─o ordre des Desulfurococcales ├─o ordre des Cenarchaeales └─? Korarchaeota  

Luokittelu Bergeyn mukaan

Luokitus Bergeyn vuoden 2004 mukaan ─o domaine des Archaea ├─o embranchement des Crenarchaeota │ └─o classe des Thermoprotei │ ├─o ordre des Thermoproteales │ │ ├─o famille des Thermoproteaceae │ │ └─o famille des Thermofilaceae │ ├─o ordre des Caldisphaerales │ │ └─o famille des Caldisphaeraceae │ ├─o ordre des Desulfurococcales │ │ ├─o famille des Desulfurococcaceae │ │ └─o famille des Pyrodictiaceae │ └─o ordre des Sulfolobales │ └─o famille des Sulfolobaceae └─o embranchement des Euryarchaeota ├─o classe des Methanobacteria │ └─o ordre des Methanobacteriales │ ├─o famille des Methanobacteriaceae │ └─o famille des Methanothermaceae ├─o classe des Methanococci │ └─o ordre des Methanococcales │ ├─o famille des Methanococcaceae │ └─o famille des Methanocaldococcaceae ├─o classe des Methanomicrobia │ ├─o ordre des Methanomicrobiales │ │ ├─o famille des Methanomicrobiaceae │ │ ├─o famille des Methanocorpusculaceae │ │ └─o famille des Methanospirillaceae │ └─o ordre des Methanosarcinales │ ├─o famille des Methanosarcinaceae │ └─o famille des Methanosaetaceae ├─o classe des Halobacteria │ └─o ordre des Halobacteriales │ └─o famille des Halobacteriaceae ├─o classe des Thermoplasmata │ └─o ordre des Thermoplasmatales │ ├─o famille des Thermoplasmataceae │ ├─o famille des Picrophilaceae │ └─o famille des Ferroplasmataceae ├─o classe des Thermococci │ └─o ordre des Thermococcales │ └─o famille des Thermococcaceae ├─o classe des Archaeoglobi │ └─o ordre des Archaeoglobales │ └─o famille des Archaeoglobaceae └─o classe des Methanopyri └─o ordre des Methanopyrales └─o famille des Methanopyraceae  

Luokittelu Gaon ja Guptan mukaan

Tämä puu perustettiin tiettyjen spesifisten proteiinien läsnäolon mukaan eri ryhmissä.

Luokitus Gao ja Gupta 2007 mukaan └─o Archaea ├─o Crenarchaeota │ ├─o Thermoproteales │ └─o │ ├─o Sulfolobales │ └─o Desulfurococcales └─o Euryarchaeota ├─? Nanoarchaeota └─o ├─o Thermoplasmatales │ ├─o Thermoplasmataceae │ └─o │ ├─o Picrophilaceae │ └─o Ferroplasmataceae └─o ├─o Halobacteriales ├─o Thermococcales └─o ├─o Archaeoglobales └─o ├─o Methanosarcinales │ ├─o Methanosarcinaceae │ └─o Methanosaetaceae └─o ├─o Methanomicrobiales └─o ├─o Methanococcales └─o ├─o Methanopyrales └─o Methanobacteriales  

Lue lisää

Artikkelin kirjoittamiseen käytetty asiakirja : tämän artikkelin lähteenä käytetty asiakirja.

Viitteellinen bibliografinen lähde

Muut bibliografiset lähteet

Internet-lähteet

Aiheeseen liittyvät artikkelit