Iialaisten Uzbekistanissa on pieni vähemmistö lahko, joka koostuu lähes kokonaan etnisten Iranissa . Maassa on vain kolme rekisteröityä shia- moskeijaa , kaksi Samarkandissa ja yksi Bukharassa ; näissä kahdessa kaupungissa asuu Iranista.
Historioitsija Jed Snyder toteaa, että ennen Venäjän hyökkäyksiä 1800-luvun lopulla, Sharkin ja Sunniitin ryhmittymät Samarkandissa eivät olleet harvinaisia . Shiiitit sulautuivat suurelta osin sunnit Venäjän jälkeisen miehityksen aikana.
Uzbekistanilaisia shiittejä ei ole tarpeeksi paljon muodostamaan yhteisöä Uzbekistanissa (koska niiden liittoon kykeneviä instituutioita ei ole), voimme liittää shiismiin joitain ryhmiä: "Ironis, Persiyons, Azerits ja Ismailis".
Vaikka hallitus on antanut näiden shiitti moskeijoiden toimia, jotkut uzbekiläiset shiitit pelkäävät, että hallitus estää uusien shia moskeijoiden rekisteröinnin ja että virallinen kansallinen uskonnollinen elin, Uzbekistanin muslimien henkinen hallinto, on epäonnistunut. Lisäksi neuvostoajan jälkeen maassa ei ole ollut shia- madrasaa , eikä uutta madrasaa ole kirjattu itsenäisyyden jälkeen. Ne, jotka haluavat tulla uskonnolliseksi johtajaksi, voivat saada shia-koulutuksen vain menemällä Iraniin, mutta Uzbekistanin hallitus ei tunnusta Iranissa saatuja shia-tutkintoja. Tämän seurauksena virallisesti tunnustetuista šiittijohtajista on pulaa.