InterPro on integroitu tietokanta domeeni- ja proteiinisignaalien "allekirjoituksista", jota käytetään proteiinien automaattiseen luokitteluun ja merkintöihin .
Interpro mahdollistaa proteiinien luokittelun toiminnallisten domeenien, toistojen ja signaalien läsnäolon perusteella automatisoidun haun ansiosta useissa tietokannoissa (CATH-Gene3D, HAMAP, PANTHER, Pfam, PIRSF, PRINTS, ProDom, PROSITE, SMART, SUPERFAMILY, TIGRFAMs ).