Kansallinen bioteknologian tiedotuskeskus

Kansallinen bioteknologian tiedotuskeskus NCBI-logo herättää DNA: n kaksoiskierteen . Kuva Infoboxissa. Historia
Säätiö 4. marraskuuta 1988
Kehys
Lyhenne (en)  Kansallinen keskuspankki
Tyyppi Tutkimuslaitos , biologinen tietokanta , tietokirjasto
Istuin Bethesda
Maa  Yhdysvallat
Yhteystiedot 38 ° 59 '45' 'pohjoista leveyttä, 77 ° 05' 56 '' läntistä pituutta
Organisaatio
Vanhempien organisaatio Yhdysvaltain kansallinen lääketieteellinen kirjasto
Verkkosivusto (en)  www.ncbi.nlm.nih.gov

National Center for Biotechnology Information ( NCBI ), ranskaksi "  American Center for Biotechnology Information  ", on yhdysvaltalainen National Institute for molekyylibiologisia tietoa .

Tämä järjestö, joka perustettiin vuonna 1988 ja sijaitsee Bethesda on Marylandissa , on osa Yhdysvaltain kirjaston of Medicine , yksi Yhdysvaltain Institutes of Health .

Tehtävät

NCBI tekee tutkimusta laskennallisessa biologiassa, kehittää ohjelmistoja genomitietojen analysoimiseksi ja biolääketieteellisen tiedon tarjoamiseksi.

NCBI ei ole tietokanta, mutta se kehittää myös julkisia tietokantoja, kuten:

Se on tavallaan Euroopan bioinformatiikan instituutin (EBI) amerikkalainen vastine .

NCBI tarjoaa ja sisältää NCBI taksonomia tietokanta , joka on vain viitteellinen. NCBI: n verkkosivustolla täsmennetään, että tämä tietokanta ei ole luotettava lähde nimikkeistölle tai luokitukselle, ja että luotettavimpia tietoja on käytettävä asiaankuuluvassa tieteellisessä kirjallisuudessa. NCBI-taksonomia edustaa noin 10% planeetan elävistä lajeista. Tämä taksonomia on kuratoitu luokitus, ja sitä ehdotetaan organisoiduksi nimikkeistöksi julkisten tietokantojen organismisekvensseille. TaxID (yksilöllinen tunniste NCBI-taksonomiassa) toimii linkkinä kolmen kansainvälisen nukleotidisekvenssitietokantayhteistyön (INSDC, "International Collaboration in Nucleotide Sequence Databases ") tietokantojen välillä , johon Japanin DNA-tietopankki kuuluu. ( DDBJ), NCBI (USA) ja Euroopan bioinformatiikan instituutti (EMBL-EBI, Eurooppa).

Huomautuksia ja viitteitä

  1. (in) "  Vastuuvapauslauseke: NCBI: n taksonomiatietokanta ei ole arvovaltainen lähde nimikkeistölle tai luokitukselle - luota asiaankuuluvasta tieteellisestä kirjallisuudesta.  » (Katso tämän tutkimusesimerkin alatunniste .)
  2. "  Koti - Taksonomia - NCBI  " , osoitteessa www.ncbi.nlm.nih.gov (käytetty 30. elokuuta 2017 )
  3. (sisään) Scott Federhen Karen Clark , Tanya Barrett ja Helen Parkinson , "  Kohti rikkaampia metatietoja mikrobisekvensseille: Korvaa kantotason NCBI-taksonomiat taxidilla Bioproject, BioSample records and Assembly  " , Standards in Genomic Sciences , voi.  9, n o  3,15. kesäkuuta 2014, s.  1275 ( ISSN  1944-3277 , DOI  10.4056 / sigs.4851102 , luettu verkossa , käytetty 30. elokuuta 2017 )
  4. (in) "  Kansainvälinen nukleotidisekvenssitietokannan Tietokanta Collaboration | INSDC  ” , www.insdc.org (käytetty 30. elokuuta 2017 )

Katso myös

Aiheeseen liittyvät artikkelit

  • Anna NCBI Global Cross-Database Search System.
  • BLAST , NCBI-ohjelmisto, joka mahdollistaa nukleotidi- ja proteiinisekvenssien vertailun.
  • Luettelo Wikipedia-sivuista, jotka kuvaavat taksonia käyttäen NCBI-viitteitä .

Ulkoiset linkit