Ngomeni Hylky muodostuu edelleen 16. vuosisadan portugali kauppa-alus. Kalastajat löysivät sen 1980-luvulla, ja se ilmoitettiin vuonna 2006 Malindi-museossa. Se sijaitsee 5 metrin syvyydessä kolmen kilometrin päässä rannikolta Ngomeni pohjoiseen Malindi Keniassa.
Kaivaukset suoritettiin 20 x 40 m: n alueella. He paljastivat suuren ja suhteellisen hyvin säilyneen veneen. Siinä oli norsunluun ja eläinten sarvia, vihreitä ja mustia islamilaisia keraamisia esineitä sekä kupariharkkoja, joissa oli Fugger- merkki . Lisäksi arkeologit ovat löytäneet tykinkuulia ja kiviankkureita, lyijylevyjä, rautanauloja ja lukuisia betonielementtejä. Kaivausten lopussa alue peitettiin uudelleen sen säilyttämiseksi paremmin. Se on suunniteltu muuttamaan vedenalaiseksi museoksi matkailun kehittämisen edistämiseksi. Kerätyt näytteet varastoidaan Jeesuksen linnoituksen museoon .