Ensembl on bioinformatiikan automaattinen genomin merkintäjärjestelmä . Se on Euroopan bioinformatiikan instituutin (EBI) ja Wellcome Trust Sanger -instituutin yhteisprojekti, jonka keskeisenä ajatuksena on järjestää laajat biologisen tiedon kentät genomisekvenssien ympärille .
Jokaisen analysoidun genomin osalta Ensembl yrittää tunnistaa automaattisen prosessin avulla kaikki sen sisältämät geenit . Tätä varten se perustuu olemassa olevien sekvenssien ( RNA , proteiinit ) tietoihin , jotka se "ripustaa" genomiin geenien rakenteen päättelemiseksi.
Tähän ensimmäiseen, geenien rakenteen merkintäkerrokseen Ensembl lisää muita elementtejä, muun muassa:
Ensembl esittelee itsensä ensin "selaingenomina" ( " Genome Browser " ) tutkiakseen ja visualisoiden monien organismien genomeja eri tasoilla.
Ensembl on myös avoin tietokanta, josta voi vapaasti tulla piirtämään joko suoraan tai ohjelmointirajapinnan kautta tai BioMart-kyselyjärjestelmän kautta.
Lopuksi Ensembl on avoin ohjelmistoinfrastruktuuri, jonka avulla voidaan rakentaa erilaisia järjestelmiä, jotka järjestävät genomisiin sekvensseihin liittyviä tietoja.
Ensembl-hanketta ohjaa laaja avoimuuden kulttuuri, joka tarkoittaa: