Eco RI (Eco "R" un) on restriktioentsyymin tuottama bakteerikanta Escherichia coli , joka onkommensaali bakteeri on ihmisen ruoansulatuskanavan . Sen tunnistussivusto on seuraava:
5'-GAATTC-3' 3'-CTTAAG-5'Suurimman osan ajasta restriktiokohdat ovat palindromisia , ts. DNA-sekvenssi on sama lukemalla 5'-3'-suunnasta.
Se on tyypin II restriktioendonukleaasi , joka on hyvin yleistä bakteereissa.
EcoRI liikkuu liukumalla pitkin DNA: n fosfaatti-sokerirunkoa. EcoRI voi sitoutua DNA: han kahdella tavalla: tavalla, joka on spesifinen tunnistuspaikalleen, liikkumaton, mikä johtaa DNA: n pilkkoutumiseen, ja löyhemmällä ja epäspesifisellä tavalla, mikä sallii sen siirtymisen. Näitä kahta tapaa käytetään vuorotellen ja jatkuvasti.
DNA: n leikkaus siirtyy jokaisella juosteella muutamalla nukleotidilla. Leikkauksen sanotaan tuottavan yhtenäisiä päitä (toisin kuin tylpät päät, joissa leikkauksessa ei ole siirtymää, saatu EcoRV: llä, toisella restriktioentsyymillä).