APC (proteiini)

Adenomatoottinen polyposis Coli
Suuntaa-antava kuva artikkelista APC (proteiini)
Superhélice N -terminaalinen CPA ihmisen ( ATE  1DEB )
Pääpiirteet
Hyväksytty nimi APC, WNT-signaaliväylän säädin
Symboli APC
Synonyymit Proteiinifosfataasi 1, säätelyalayksikkö 46
Homo sapiens
Locus 5 q 22.2
Molekyylipaino 311 646  Da
Jäämien lukumäärä 2843  aminohappoa
Käy peremmälle 324
HUGO 583
OMIM 611731
UniProt P25054
RefSeq ( mRNA ) NM_000038.5 , NM_001127510.2
RefSeq ( proteiini ) NP_000029.2 , NP_001120982.1
Yhdessä ENSG00000134982
ATE 1DEB , 1EMU , 1JPP , 1M5I , 1T08 , 1TH1 , 1V18 , 2RQU , 3AU3 , 3NMW , 3NMX , 3NMZ , 3QHE , 3RL7 , 3RL8 , 3T7U , 4G69 , 4YJE , 4YJL , 4YK6

GENATLAT • Geenitestit • GoPubmed • HCOP • H-InvDB • Treefam • Vega

Linkit ovat käytettävissä GeneCards- ja HUGO- sivuilta .

Englanninkielisestä adenomatoottisesta polyposis colista peräisin oleva APC-proteiini on molekyyli, joka säätelee β-kateniinin pitoisuutta, joka vaikuttaa solujen kiinnittymiseen osallistuvan kadheriini E: n kanssa . In ihmisillä , se on koodattu mukaan APC- geeni , joka sijaitsee kromosomissa 5 . Tiedämme kaikkien nisäkkäiden ortologit , joista käytettävissä on kattavaa genomista tietoa . Mutaatiot Tämän geenin voi johtaa paksusuolen syövän .

APC on kasvainsuppressorigeeni . Tämän tyyppiset geenit estävät hallitsemattoman solujen lisääntymisen , josta voi kehittyä syöpä . Proteiini johtuvat ilmentymistä tämän geenin on ratkaisevassa roolissa useiden solun prosessien saattaa johtaa kasvaimen . Sen avulla voidaan hallita mitoosin taajuutta , tapaa, jolla solu tarttuu naapureihinsa biologisessa kudoksessa , solun polaarisuuden hankkimista, kolmiulotteisten rakenteiden morfogeneesiä tai jopa solun liikettä kankaan sisään tai ulos. Se auttaa myös varmistamaan, että solujen jakautumisen tuottamien kromosomien määrä on oikea. Se suorittaa nämä erilaiset toiminnot olennaisesti liittymällä muihin proteiineihin, erityisesti niihin, jotka osallistuvat solujen kiinnittymiseen ja signalointiin . Erityisesti se säätelee p-kateniinin aktiivisuutta Wnt-proteiinien kautta . P-kateniinin säätely estää solujen jakautumista stimuloivien geenien liian usein tapahtuvan aktivoinnin sekä solujen liiallisen kasvun.

Osallistuminen tiettyihin syöpiin

Yleisin paksusuolisyövän mutaatio johtaa APC-proteiinin inaktivaatioon. Kun tällaisia ​​mutaatioita ei ole, havaitaan sen sijaan mutaatioita, jotka aktivoivat p-kateniinin . APC-proteiinin mutaatiot voivat olla synnynnäisiä tai esiintyä spontaanisti somaattisissa soluissa , usein muiden geenien mutaatioiden seurauksena, jotka vähentävät DNA: n korjauskykyjä . Syövän kehittymiseksi täytyy vaikuttaa geenin molempiin alleeleihin . APC- tai β-kateniinimutaatioiden on seurattava muita mutaatioita, jotta niistä tulee syöpä; Kuitenkin ihmisillä, joilla APC inaktivoi mutaatiot, paksusuolisyövän kehittymisen riski 40-vuotiaana on lähes 100%.

Polypoosin peräsuolen perhe on synnynnäinen geenin mutaatioista APC inaktivoivan proteiinin. Suurin osa näistä mutaatioista tuottaa epänormaalisti lyhyen, oletettavasti ei-toimivan APC-proteiinin. Tämä katkaistu proteiini ei estä kudosten liiallista kehitystä, joka johtaa polyyppien muodostumiseen , joista voi kehittyä syöpä . Yleisin mutaatio familiaalisessa paksusuolen polypoosissa on viiden emäksen deleetio APC- geenissä . Saatu proteiini sekvenssi on muutettu tähteestä 1309.

Toinen mutaatiotyyppi, joka vaikuttaa noin 6 prosenttiin Ashkenazista peräisin olevista ihmisistä , koostuu isoleusiinitähteen substituutiosta asemassa 1307 lysiinitähteellä , jota merkitään 11130K. Alun perin luokiteltu ilman ilmaantuvuutta, käy ilmi, että se lisäisi paksusuolisyövän kehittymisen riskiä.

Rakenne

Täydellinen ihmisen proteiini on 2843  tähteet on aminohapon , joka molekyylimassa on 311,6  kDa . Useiden näiden proteiinien N- terminaalisen domeenin kolmiulotteinen rakenne on selvitetty suurella resoluutiolla. Suurin osa proteiinista vaikuttaa häiriintyneeltä, mutta ei tiedetä, pysyykö tämä suuri alue, jolla ei ole huomattavaa in vitro havaittua rakennetta ja joka sisältää tähteitä 800 - 2843, in vivo vai stabiloiko siellä tuntemattomat proteiinit, jotka olisivat vuorovaikutuksessa sen kanssa. On myös osoitettu, että alue, joka keskittää mutaatiot proteiinin keskustan ympärille, on luonnostaan ​​häiriintynyt in vitro .

Huomautuksia ja viitteitä

  1. (in) Catherine L. Daya ja Tom Alber , "  Crystal rakenne aminopään kiertyneen kierteen domeenin APC tuumorisuppressorin  " , Journal of Molecular Biology , voi.  301, n o  1, 4. elokuuta 2000, s.  147-156 ( PMID  10926498 , DOI  10,1006 / jmbi.2000.3895 , lukea verkossa )
  2. arvot massan ja tähteiden määrä ilmoitetaan tässä ovat ne, joilla on proteiinin esiasteen johtuvat käännös ja geenin , ennen translaation jälkeisiä modifikaatioita , voivat erota merkittävästi vastaavasta arvot toiminnallinen proteiini .
  3. (in) I. Nishisho, Y. Nakamura, Y. Miyoshi, Y. Miki, H. Ando, ​​A. Horii, K. Koyama, J. Utsunomiya, Baba S. ja P. Hedge , " Kromosomin 5q21 geenien mutaatiot "  FAP- ja paksusuolen syöpäpotilailla  ” , Science , voi.  253, n °  5020, 9. elokuuta 1991, s.  665-669 ( PMID  1651563 , DOI  10,1126 / science.1651563 , lukea verkossa )
  4. (in) Sanford D. Markowitzin ja Monica M. Bertagnolli , "  Molecular Basis of peräsuolen syövän  " , The New England Journal of Medicine , vol.  361, n °  25, 17. joulukuuta 2009, s.  2449-2460 ( PMID  20018966 , PMCID  2843693 , DOI  10.1056 / NEJMra0804588 , lue verkossa )
  5. (in) Alyssa C. Lesko, Kathleen H. Goss, Frank F. Yang, Adam Schwertner, IMGE Hulur Keenan Önel ja Jenifer R. Prosperi , "  APC-tuumorisuppressorin vaaditaan epiteelisolujen polarisaation ja kolmiulotteinen monogeneesin  " , Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research , voi.  1853 n o  3, maaliskuu 2015, s.  711-723 ( PMID  25578398 , PMCID  4327896 , DOI  10.1016 / j.bbamcr.2014.12.036 , lue verkossa )
  6. (in) David P. Minde Zeinab Anvarian Stefan Rüdiger GD ja Madelon Maurice , "  Messing häiriö: miten missensemutaatioita APC tuumorisuppressoriproteiinia johtaa syöpään?  ” , Molecular Cancer , voi.  10, 22. elokuuta 2011, s.  101 ( PMID  21859464 , PMCID  3170638 , DOI  10.1186 / 1476-4598-10-101 , lue verkossa )
  7. (in) "  Suuri määrä häiriöitä adenomatoottisessa polyposissa Coli tarjoaa strategian vartioimaan Wnt-signalointikontre-mutaatiot  " , PLoS One , voi.  8, n o  10, 9. lokakuuta 2013Asetuksen n o  e77257 ( pMID  24130866 , PMCID  3793970 , DOI  10,1371 / journal.pone.0077257 , lukea verkossa )