Histoni H3

Histoni-H3 on yksi viisi suurta proteiinien histonit , jotka ovat mukana rakenteessa kromatiinin on eukaryoottisoluissa . Proteiinilla on pallomainen päädomeeni ja pitkä N-terminaalinen pyrstö, ja se on osa kromatiinin nukleosomirakennetta ja "helmi-kaulakoru" -rakennetta. Histoniproteiinit ovat erittäin modifioituja translaation jälkeen ja histoni H3 on modifioituimmin. Termi "Histone H3" on epäselvä, koska se ei mahdollista erottella eroja sekvenssin tasolla .tai proteiinin modifioitu tila. Histone H3 on merkittävä toimija epigeneettisissä kysymyksissä, koska sen eri variantit sekvenssitasolla ja sen modifikaatiot ovat mukana geeniekspression dynamiikassa ja säätelyssä.

Epigenetics ja translaation jälkeiset muutokset

Histoni H3: n N-terminaalinen häntä ulkonee nukleosomin pallomaisesta rakenteesta ja voi käydä läpi erityyppisiä translaation jälkeisiä modifikaatioita, jotka vaikuttavat erilaisiin soluprosesseihin. Parhaiten karakterisoidut modifikaatiot liittyvät metyyli- tai asetyyliryhmien kiinnittymiseen lysiiniin tai arginiiniin ja fosforylaatioon seriinin tai treoniinin tasolla . Bi- ja tri- metylaation lysiinin 9 sekä trimetylaatio lysiinin 27 liittyy geenien ilmentymisen repressio ja muodostumista heterokromatiinin . Vastaavasti lysiini 4: n mono- ja tri-metylaatio, kuten lysiini 27: n asetylointi , liittyvät aktiivisiin geeneihin ja avoimeen kromatiinin ( eukromatiinin ) tilaan . Entsyymit, jotka suorittavat nämä muutokset kutsutaan histoni metyylitransferaasit metylaation, tämä on tapauksessa EZH2 proteiini , joka on vastuussa Metyloinnin lysiini 27, kun taas asetylointi suoritetaan histoniasetyylitransferaaseiksi (HAT). Sitä vastoin muut proteiinit ovat vastuussa näiden muutosten poistamisesta, kuten histonideasetylaasit .

Vaihtoehdot proteiinisekvenssissä

Nisäkässoluilla on 3 tunnettua histoni-H3- varianttia . Virallinen nimikkeistö on histoni H3.1, histoni H3.2 ja histoni H3.3. Nämä kolme proteiinia eroavat toisistaan ​​vain muutamassa aminohapossa.

On olemassa toinen histoni H3-variantti, sentromeerinen variantti (CenH3 tai CENP-A nisäkkäissä), jolla on huonosti konservoitunut proteiinisekvenssi, joka on hyvin erilainen kuin H3.

Geneettinen

Kanoniset histonit H3: t koodaavat genomin eri geenit, jotka on ryhmitelty yhteen:

Vaikka H3.3-muunnosta koodaa kaksi erillistä geeniä genomissa:

H3.3 : H3F3A , H3F3B

Katso myös

Viitteet

  1. Bhasin M, Reinherz EL, Reche PA, “Histonien  tunnistaminen ja luokittelu tukivektorikoneella  ”, J. Comput. Biol. , voi.  13, n o  1,2006, s.  102–12 ( PMID  16472024 , DOI  10.1089 / cmb.2006.13.102 )
  2. (in) Hartl Daniel L. Freifelder David Snyder Leon A., perinnöllisyystieteen , Boston, Jones ja Bartlett Publishers,1988( ISBN  0-86720-090-1 )
  3. Rosenfeld JA, Wang Z, Schones DE, Zhao K, DeSalle R, Zhang MQ, "  Rikastettujen histonimuutosten määrittäminen ihmisen genomin ei-geneerisissä osissa  ", BMC Genomics , voi.  10,maaliskuu 2009, s.  143 ( PMID  19335899 , PMCID  2667539 , DOI  10.1186 / 1471-2164-10-143 )
  4. Lachner M, O'Carroll D, Rea S, Mechtler K, Jenuwein T, "  Histoni H3-lysiini 9: n metylointi luo sitoutumiskohdan HP1-proteiineille  ", Nature , voi.  410, n °  6824,Maaliskuu 2001, s.  116–20 ( PMID  11242053 , DOI  10.1038 / 35065132 )
  5. Helin K, Dhanak, " Kromatiiniproteiinit ja modifikaatiot lääkekohteina   ", Nature , voi.  502, n °  7472,Lokakuu 2013, s.  480-488 ( PMID  24153301 , lue verkossa )
  6. Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ, “  Ihmisen ja hiiren replikaatiosta riippuvat histonigeenit  ”, Genomics , voi.  80, n o  5,Marraskuu 2002, s.  487–98 ( PMID  12408966 , DOI  10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3 )
  7. Hake SB, Garcia BA, Duncan EM, Kauer M, Dellaire G, Shabanowitz J, Bazett-Jones DP, Allis CD, Hunt DF, "  Nisäkkään histoni H3 -variantteihin liittyvät ekspressiomallit ja translaation jälkeiset modifikaatiot  ", J. Biol. Chem. , voi.  281, n o  1,tammikuu 2006, s.  559–68 ( PMID  16267050 , DOI  10.1074 / jb.M509266200 )