Entsymaattinen substraatti
In Enzymology , termi ” entsymaattinen substraatti” tarkoittaa mitä tahansa molekyyliä, siinä tapahtuu kemiallinen reaktio , jota katalysoi entsyymi (esim tärkkelys hydrolysoidaan amylaasi ja glukoosi ). Ne voivat olla monimutkaisia molekyylejä, polymeerejä, yksinkertaisia molekyylejä (esim . Vetyperoksidin katalaasin dismutantti ). Sopimuksella:
- Molekyyliä tai molekyyliperhettä, joka käy spesifisesti läpi entsymaattisen katalyysin sitoutumalla entsyymin aktiiviseen kohtaan , kutsutaan substraatiksi (esim. Amylaasilla hydrolysoidun tärkkelyksen tapauksessa vettä ei pidetä substraattina. Entsyymi tärkkelyksen tai glykogeeni ).
- Reaktantti on molekyyli, joka reagoi substraatin kanssa ja tulee taseessa lopullinen kemiallinen yhtälö.
- Reaktiotuote , tai jopa tuotteita , on molekyyli (t) vapautuu entsyymin jälkeen katalyysi.
Kun entsyymi sitoutuu substraattiinsa, sitä kutsutaan entsyymi-substraatti-kompleksin muodostumiseksi . Tämä johtaa muutokseen entsyymin konformaatiossa, joka voi johtaa:
- joko suoraan kemiallisen reaktion katalyysissä;
- tai paljastaa kofaktorin sitoutumiskohta, joka sallii lopullisen konformaation muutoksen ja reaktion katalyysin.
Reaktio päättyy reaktiotuotteiden vapautumiseen.
Valinnaisesti entsyymi voidaan liittää proteesiryhmään (esim. Koentsyymi A , metalloentsyymit jne.), Joka reagoi katalysoidussa reaktiossa. On olemassa erityinen reagenssiluokka, jota kutsutaan kofaktoreiksi , jotka osallistuvat reaktioon, mutta eivät pääse metabolisen reitin lopulliseen reaktiotasapainoon, koska ne kierrätetään (esim .: NADPH ).
Kun taas sitoutuminen (ensimmäinen vaihe) ja vapautumisen (viimeinen vaihe) vaiheet ovat yleensä palautuvia, keskeinen vaihe voi olla palautumaton (kuten kymosiini ja katalaasin reaktiot mainittu edellä) tai palautuvia (moniin reaktioihin). Että metaboliareitti on glykolyysi ). Lisäämällä substraattikonsentraatiota ja siten entsyymi-substraatti-kompleksien määrää reaktionopeus kasvaa, kunnes entsyymikonsentraatiosta tulee rajoittava tekijä .