Katalaasi

Katalaasi
Suuntaa-antava kuva artikkelista Catalase
Ihmisen punasolujen katalaasin rakenne ( PDB  1DGB )
Pääpiirteet
Symboli KISSA
EY-nro 1.11.1.6
Homo sapiens
Locus 11 Sivumäärä 13
Molekyylipaino 59 756  Da
Jäämien lukumäärä 527  aminohappoa
HUGO 1516
OMIM 115500
UniProt P04040
RefSeq ( mRNA ) NM_001752.3
RefSeq ( proteiini ) NP_001743.1
Yhdessä ENSG00000121691
ATE 1DGB , 1DGF , 1DGG , 1DGH , 1F4J , 1QQW

GENATLAT • Geenitestit • GoPubmed • HCOP • H-InvDB • Treefam • Vega

Linkit ovat käytettävissä GeneCards- ja HUGO- sivuilta .

Katalaasi (Kreikan kataluein , ”liueta”) on hemi oksidoreduktaasi , joka katalysoi jakaantumisen ja vetyperoksidin osaksi vettä ja happea  :

2 H 2 O 2→ O 2+ 2 H 2 O.

Nämä entsyymit muodostuvat neljästä polypeptidiketjusta noin 500  tähdettä ja aminohappoja , joilla kullakin on yksi molekyyli hemin . Nämä hemit ja niiden proteiiniympäristö ovat entsyymin aktiivisia kohtia . Reaktion katalysoimiseksi hemin rautatomi suorittaa heterolyyttisen katkaisun vetyperoksidin OO-sidoksesta, jolloin syntyy vesimolekyyli ja voimakkaasti hapettava Fe (IV) = O-ryhmä  ; jälkimmäinen voi sitten hapettaa toisen vetyperoksidimolekyylin hapen tuottamiseksi. Tätä prosessia kuvaavat tarkemmin seuraavat yhtälöt:

H 2 O 2+ Fe ( III ) -E → H 2 O+ O = Fe ( IV ) -E; H 2 O 2+ O = Fe ( IV ) -E → H 2 O+ O 2+ Fe ( III ) -E.

Sen suurin nopeus 200 000 katalyyttistä reaktiota sekunnissa on yksi tehokkaimmista tiedetyistä entsyymeistä. Sen reaktionopeutta näyttää todellakin rajoittavan vain diffuusio , toisin sanoen rajoittava nopeus, jolla molekyylit saavuttavat entsyymin aktiivisen kohdan. In eukaryoottien se löytyy peroksisomiin solujen katalaasin A ja sytosolissa katalaasin T.

Katalaasia esiintyy kaikissa aerobisissa organismeissa ja erityisesti naurisissa tai useimmissa kasvien juurissa, hiivassa ja eläinten maksassa.

Katalaasi Tämän kuvan kuvaus, myös kommentoitu alla Staphylococcus aureus -kataasireaktio Avaintiedot
EY-nro EY 1.11.1.6
CAS-numero 9001-05-2
Entsymaattinen aktiivisuus
IUBMB IUBMB-merkintä
IntEnz IntEnz-näkymä
BRENDA BRENDA-sisäänkäynti
KEGG KEGG-tulo
MetaCyc Aineenvaihduntareitti
PRIAM Profiili
ATE RCSB ATE PDBe PDBj ATE
MENNÄ AmiGO / EGO
Katalaasi Tämän kuvan kuvaus, myös kommentoitu alla Naudanmaksa-katalaasi ( PDB  7CAT ) Proteiinidomeeni
Pfam PF00199
InterPro IPR011614
TULEVAISUUS PDOC00395
SCOP 7kissa
SUPERFAMILY 7kissa
OPM- perhe 435
OPM- proteiini 3e4w
CDD cd00328

Käyttö mikrobiologiassa

Tätä entsyymiä käytetään systemaattisessa bakteriologiassa bakteerien tunnistamiseksi. Tähän sisältyy tutkittavan bakteeripesäkkeen saattaminen kosketukseen vetyperoksidin läsnä ollessa (10 tilavuudessa). Pyörteinen (johtuen dioksidin vapautumisesta ) osoittaa katalaasin läsnäolon.

Happituotannon vuoksi katalaasissa sitä ei ole tiukoissa anaerobisissa bakteereissa. Useimmilla gram-negatiivisilla bakteereilla on katalaasi (katalaasi +). Haku katalaasireaktioiden tämäntyyppisistä bakteerit siis ei kiinnosta, paitsi serovariantti on Shigella dysenteriae . Ja Gram-positiiviset bakteerit , etsiä tämän entsyymin mahdollistaa erilaistua:

Tekninen

Toisin kuin oksidaasitesti, katalaasitesti voidaan suorittaa platinasilmukalla. Tätä testiä ei suositella tekemään siemenviljelyliemestä, koska tulos on vähemmän selkeä. Jos olet epävarma tuloksesta, aloita alusta suuremmalla siirtokunnalla. Yhdistämällä tulokset muiden testien (Gram +, Gram-) tuloksiin voidaan sitten tehdä hypoteeseja bakteerityypistä.

"Katalaasitestin" rooli lajin tunnistamisessa

Tämä testi on tärkeä ensimmäisen suuntautumisen kannalta puhtaan bakteerikannan tunnistamisessa .

Bakteerin täydellisen tunnistamisen suorittamiseksi on tiedettävä hengitystyyppi. Gram + -bakteereilla on enimmäkseen fakultatiivinen aero-anaerobinen hengitystyyppi , lukuun ottamatta Micrococcus- sukua ( tiukka aerobinen tyyppi ).

Siksi on tarpeen jatkaa kannan tunnistamista kylvöväliaineilla: selektiivinen, vihamielinen tai osa testiparistoa, joka on tarkoitettu sukujen erottamiseen ja bakteerin tunnistamiseen, kuten reitin etsimiseen. .

Biokemiallinen markkeri

Katalaasi "CAT" on biokemiallinen merkkiaine puolustukselle antioksidantteja vastaan . Sillä on rooli raskasmetallien saastuttamien organismien detoksifikaatiossa , erityisesti simpukoissa tutkittujen kuparin , kadmiumin ja lyijyn suhteen, joiden CAT-aktiivisuuden ja näiden metallien aiheuttaman ympäristön pilaantumisen asteen välillä on osoitettu olevan positiivinen korrelaatio. Jälkimmäiset kertyvät simpukoihin suhteessa ympäristökonsentraatioon, mikä lisää typen ja fosforin erittymistä ja merkittävästi biokertyvien metallien vapautumista. Tämä prosessi parantaa jo metalleille altistettujen simpukoiden antioksidanttisuojaa. Mitä enemmän simpukka on kontaminoitunut myrkyllisillä metalleilla, sitä korkeampi sen CAT-aktiivisuus on, ja päinvastoin simpukoiden puhdistaminen johtaa CAT-aktiivisuuden vähenemiseen. Katalaasia voidaan siksi käyttää antioksidanttina puolustusbiomarkkerina ja "herkänä, nopeana ja tehokkaana" bioindikaattorina vesiympäristön laadulle ja terveydelle.

Huomautuksia ja viitteitä

  1. arvot massan ja tähteiden määrä ilmoitetaan tässä ovat ne, joilla on proteiinin esiasteen johtuvat käännös ja geenin , ennen translaation jälkeisiä modifikaatioita , voivat erota merkittävästi vastaavasta arvot toiminnallinen proteiini .
  2. Kamel Boudjema, Tutkimus hivemetallien (kuparin, kadmiumin ja lyijyn) biokertyvyyden biomarkkereista akne myrkytykselle altistuneessa Perna perna Born (1780) -simpukassa ( magisterin muisti),2013( lue verkossa ).

Liitteet

Aiheeseen liittyvät artikkelit

Ulkoiset linkit