DNA B
DNA B on muotoa priori yleisin on kaksoiskierre ja DNA: n , joka käsittää geneettistä materiaalia on solujen elossa. Crick ja Watson kuvailivat sitä vuonna 1953, ja sille on tunnusomaista noin 2,37 nm : n halkaisija ja keskimääräinen venymä 0,34 nm / lisätyn emäsparin kohdalla , jokainen kierteen kierros käsittää 10,4 - 10,5 emäsparia liuoksessa. Siinä on kaksi epätasaista uraa, tyypillisesti 2,2 nm pääuralla ja 1,2 nm pienellä uralla. Tämän seurauksena nukleoemäkset ovat käsiksi ulkopuolelta suurimmilla ura, ja se on tyypillisesti tällä tasolla, jotka selektiivisesti sitoutuvat proteiinit , kuten transkriptiotekijät , joka perustuu sekvenssin ja DNA: n .
Rakenteelliset parametrit, jotka viittaavat kaksijuosteisen DNA: n kolmeen päämuotoon
| Asetus
|
DNA A
|
DNA B
|
Z DNA
|
|---|
| Potkurin suunta |
oikein |
oikein |
vasemmalle
|
| Toistettu kuvio |
1 bp
|
1 bp
|
2 bp
|
| Pyörimään pari emästen
|
32,7 ° |
34,3 ° |
60 ° / 2
|
|
Pohjapari potkurikierrosta kohti |
11 |
10.5 |
12
|
| Potkurin nousu kierrosta kohden |
2,82 nm |
3,32 nm |
4,56 nm
|
| Akselin pidennys jalustaparilla
|
0,24 nm |
0,32 nm |
0,38 nm
|
| Halkaisija |
2,3 nm |
2,0 nm |
1,8 nm
|
| Kaltevuus emäsparia akselilla potkurin |
+ 19 ° |
-1,2 ° |
-9 °
|
| Keskikierre ( potkurin kierre ) |
+ 18 ° |
+ 16 ° |
0 °
|
Orientaatio substituentit on emästä
on osidic jäämiä
|
anti |
anti |
Pyrimidiini : anti,
Puriini : syn
|
Furanoosin taittuva / endosyklinen vääntö
( sokeriripustin ) |
C3'- endo
|
C2'- endo
|
Sytosiini : C2'- endo ,
guaniini : C2'- ekso
|
Huomautuksia ja viitteitä
-
(in) Timothy J. Richmond ja Curt A. Davey , " rakenne DNA nukleosomin ydin " , Nature , voi. 423, n ° 6936,
8. toukokuuta 2003, s. 145-150 ( PMID 12736678 , DOI 10.1038 / nature01595 , Bibcode 2003Natur.423..145R , lukea verkossa )
-
(in) Richard Wing, Horace Drew, Tsunehiro Takano, Chris Broka, Shoji Tanaka Keiichi Itakura ja Richard E. Dickerson , " Crystal rakenteen analyysi täyden kierroksen B-DNA: n " , Nature , voi. 287, n ° 5784,
23. lokakuuta 1980, s. 755-758 ( PMID 7432492 , DOI 10.1038 / 287755a0 , Bibcode 1980Natur.287..755W , lukea verkossa )
-
(in) CO Pabo ja RT Sauer , " Protein-DNA Recognition " , Annual Review of Biochemistry , voi. 53,
Heinäkuu 1984, s. 293-321 ( PMID 6236744 , DOI 10.1146 / annurev.bi.53.070184.001453 , lue verkossa )
-
(in) Richard R Sinden , DNA-rakenne ja toiminta , Academic Press,
15. tammikuuta 1994, 398 Sivumäärä ( ISBN 0-12-645750-6 )
-
(en) Rich A, Norheim A, Wang AHJ, " Vasenkätisen Z-DNA: n kemia ja biologia " , Annual Review of Biochemistry , voi. 53,
1984, s. 791–846 ( PMID 6383204 , DOI 10.1146 / annurev.bi.53.070184.004043 )
-
(in) Ho PS, " d: n (CA / TG) n ei-B-DNA-rakenne ei eroa Z-DNA: n rakenteesta " , Proc Natl Acad Sci USA , Voi. 91, n ° 20,
27. syyskuuta 1994, s. 9549-9553 ( PMID 7937803 , PMCID 44850 , DOI 10,1073 / pnas.91.20.9549 , Bibcode 1994PNAS ... 91.9549H )