Ei-proteogeeninen aminohappo

Proteiinisynteesiin aminohappo on aminohappo, jota ei voida sisällyttää proteiineihin aikana käännös on lähetti-RNA mukaan ribosomien . Tällaisia aminohappoja voidaan edelleen läsnä proteiineissa, mutta tässä tapauksessa ne on muodostettu tähteet on proteinogeenisiä aminohappojen mukaan muuttamalla translaation jälkeisen ; ne voivat myös koskaan löydetty proteiineja ja suorittaa muita fysiologisia toimintoja sisällä soluja . Noin 500 erilaista aminohappoa ovat tunnettuja, määritellään yksinkertaisesti karboksyylihappojen myös kuljettaa amiini- funktio , kun taas vain 22 proteinogeenisiä Tunnettuja aminohappoja - 23, jos otamme huomioon, että N -formylmethionine on yksi niistä - joka tarkoittaa, että suurin osa aminohapoista ovat proteiinittomia.

Proteiineista löytyvät ei-proteogeeniset aminohapot

Noin 140 erilaista aminohappoa tiedetään muodostavan proteiineja. Ne johtuvat translaation jälkeisiä modifikaatioita ja tähteet on proteinogeenisiä aminohappojen osaksi proteiineihin mukaan ribosomien . Tässä on muutama esimerkki:

Fosforylaatio on seriini- treoniinin ja tyrosiinin kanssa O -phosphosérine , O -phosphothréonine ja O -phosphotyrosine on nykyinen asetus mekanismi fysiologista aktiivisuutta proteiinien ja entsyymien .
Karboksylaation on glutamaatti on γ-karboksiglutamaatti mukana proteiinit, jotka osallistuvat veren hyytymiseen edistämällä vuorovaikutuksia kationien ja kalsium Ca 2+ . Lysiinin karboksylointi antaa diaminopimeliinihapon , joka on välttämätön bakteeriseinälle peptidoglykaanin ainesosana .
Hydroksylaatio ja proliinin ja lysiinin ja hydroksiproliinin ja hydroksilysiiniä esiintyy kollageeni . Hydroksiproliini on läsnä myös soluseinän ja oomycetes . Muita hydroksiproliineja, kuten 3,4-dihydroksiproliinia, on läsnä piilevien soluseinässä , joissa sillä voi olla merkitys piidioksidikerrostumien muodostumisessa . Aspartaatti voidaan myös hydroksyloitu, jolloin saatiin 3-hydroksi aspartaatti .
Asetylointi on lysiini ja N -ε-asetyy- tapahtuu histonien moduloimaan niiden sitoutuminen DNA on nukleosomeja , jolla on merkittäviä vaikutuksia epigenetiikka , eli moduloinnissa geenin ilmentymisen .
Metylaatio on lysiiniä eri méthyllysines on toinen epigeneettisiä mekanismi, samanlainen ja joka täydentää asetylaatio.
Vähentäminen on kaksi molekyyliä kysteiini antaa yhden molekyylin kystiinin ; tämä johtaa disulfidisidosten muodostumiseen proteiineissa , jotka vahvistavat ja stabiloivat tiettyjen proteiinien kolmiulotteista rakennetta.
Nestehukka molekyylin seriinin antaa dehydroalaniini läsnä joissakin peptidien lyhyen mikro-organismien ja joka voidaan myös havaita, että kaseiini jälkeen lämmityksen tai emäskäsittelyllä kanssa natriumhydroksidia (kaustista soodaa).
Lisäys on kysteiiniä molekyylin ja dehydroalaniini molekyyli antaa lantioniinia , joka on läsnä tietyissä bakteeri seiniin .

Muut ei-proteogeeniset aminohapot

Suuri määrä aminohappoja tarjoaa erilaisia metabolisia ja fysiologisia toimintoja . He voivat siis puuttua asiaan seuraavasti:

Välituote aineenvaihdunta: ornitiini , sitrulliini , arginiinimeripihkahapposukkinaattisyntetaasin , homoseriini , homokysteiini , happo kysteiini sulfiinihappo , 2-aminomuconique , happo δ-aminolevuliinihappoa , β-alaniini , para-aminobentsoehappo , kystationiini , jne.
Hormonit : kilpirauhashormonit
Välittäjäaineet : y-aminobutyraatti , DOPA ( dopamiinin , adrenaliinin ja noradrenaliinin esiaste ), 5-hydroksitryptofaani ( serotoniinin esiaste ), D- seriini ( neuromodulaattori ).
Toksiinit : iboteenihappo , atsetidiini-2-karboksyylihappo , domoiinihappoa , djenkolic happo , jne.
Ei-ribosomaaliset peptidit : a-aminobutyraatti , 2-aminoisobutyraatti , D- leusiini , D- valiini , mukaan lukien peptidoglykaani : diaminopimeliinihappo , D- alaniini , D- glutamaatti .

Huomautuksia ja viitteitä

(in) Alexander Ambrogelly, Sotiria Palioura ja Dieter Söll , " luonnollinen laajennus geneettisen koodin " , Nature Chemical Biology , vol. 3, n o 1, tammikuu 2007, s. 29-35 ( PMID 17173027 , DOI 10.1038 / nchembio847 , lue verkossa )
(sisään) Tadashi Nakajima ja BE Volcani , " 3,4-dihydroksiproliini uusi aminohappo piimaan soluseinissä " , Science , voi. 164, n ° 3886, 20. kesäkuuta 1969, s. 1400-1401 ( PMID 5783709 , DOI 10.1126 / science.164.3886.1400 , lue verkossa )