Alkuperäinen päivämäärä | 76 500 (67 600–86 700) BP. |
---|---|
Lähtöisin | Afrikka tai Aasia |
Esivanhempi | CT |
Jälkeläiset | D , E |
Määritetyt mutaatiot | M1 / YAP, M145 = P205, M203, P144, P153, P165, P167, P183 |
In ihmisgenetiikkaan , Haplogroup DE on Haploryhmä , että ihmisen Y-kromosomin , se on määritelty mutaatioita, joko yksittäinen nukleotidin polymorfismi (SNP), tai UEP : M1 (YAP), M145 (P205), M203, P144, P153, P165, P167, P183.
DE-haploryhmä määritellään usein tunnetuimmalla mutaatiolla YAP, joka on yhden tapahtuman polymorfismi (lyhenne UEP) . YAP-mutaatio syntyi, kun DNA- laastari, jota kutsutaan ALU-sekvenssiksi, lisääntyy itsestään; lisäsi kopion Y-kromosomiin . Y-kromosomin, jolla on YAP-mutaatio, sanotaan olevan YAP-positiivinen (YAP +), ja Y-kromosomin, jolla sitä ei ole, sanotaan olevan YAP-negatiivinen (YAP-).
DE-haploryhmän arvioidaan olevan noin 65000 vuotta vanha. Sen ikä on viime aikoina arvioitu 76 000 vuodeksi.
Suurin osa urospuolisista DE-sukulinjoista on joko osa haploryhmää D (Y-DNA) , todennäköisesti peräisin Aasiasta , ainoasta alueesta, jossa se on löydetty, tai haploryhmää E (Y-DNA) , kuin uskotaan olevan peräisin Itä-Afrikasta tai Lähi-itä . loput sukulinjoista luokitellaan DE * -ryhmään , joista vahvistetut tapaukset ovat erittäin harvinaisia.
Globaalissa tutkimuksessa, johon osallistui yli 8000 miestä, mukaan lukien 1247 nigerialaista miestä , haploryhmä DE * havaittiin vain viidellä nigerialaisella (5/1247). Tutkimuksen kirjoittajat kuitenkin olettavat: " Tämän haploryhmän näennäisen parafyyttisen tilan ja siten myös ryhmän ja sen alaryhmien kladistisen analyysin johtopäätösten on todennäköisesti oltava petollisia" ja että "ainoa genealogisesti merkittävä määritelmä tämän ikä kladin tulisi olla sen viimeisimmän yhteisen esi-isän laskettu päivämäärä pelkästään DE * -kladille; mutta vain, jos DE * on todella paraphyletic, niin se tulee automaattisesti vanhempia D tai E. ”Sittemmin kopio DE * todettiin joukossa Nalu on Guinea-Bissaun (1/17). Tämän yksilön DE * -sekvenssi eroaa nigerialaisten DE * -sekvenssin mutaatiosta. Tämä osoittaa yhteisen esi-isän, vaikka tässä tutkimuksessa ei selvennetty filogeneettistä suhdetta kahden sukulinjan välillä. Vuonna 2008 tehdyssä tutkimuksessa DE * havaittiin kahdella Tiibetistä tulleella yksilöllä (2/594).
DE-haploryhmä löytyy Afrikasta (E ja DE * haploryhmät) ja Itä-Aasiasta (D ja DE * haploryhmät), mutta sitä ei ole kokonaan näiden kahden alueen välillä. DE: n läsnäolo laajasti erillisillä alueilla on aiheuttanut vaikeuksia tutkijoille, jotka yrittävät rekonstruoida miesten muuttoliikkeen Afrikasta Aasiaan. Yhdessä vaiheessa DE-sukutaulut olisivat hävinneet Aasian länsi-, etelä- ja keskiosissa. Alkuperäisiä DE-sukulinjoja ei ole Intiassa, joka on tärkeä alue ihmisten leviämisessä Aasiassa. Kuitenkin suvusta on havaittu relikti populaatioissa on Andamaanien saarilla , viittaa mahdollisuuteen, että vahingollisia mutaatioita saattaa selittää sukupuuttoon DE suvusta Intiassa.
Ainoa ihminen maailmassa, joiden on vahvistettu DE * Haploryhmä kaupallinen testi on sunni arabien välille Damaskos , Syyria . Yhrd.org-tietokannassa hänen kaltaista haplotyyppiä löytyy vain Syyrian arabeista , tutkittu "Donbak2006" -tutkimuksessa (9 yhdeksästä markkerista, 1 113 henkilöstä). Tämä osoittaa, että Syyriassa on jonkin verran DE * -haploryhmää (jota yliopistotutkimukset eivät ole koskaan raportoineet muualla kuin Länsi-Afrikassa ja Tiibetissä ). Kaikki muut Syyriassa tehdyt akateemiset tutkimukset eivät kuitenkaan ole jatkuvasti löytäneet tätä haploryhmää. Ainoa haplotyyppi Afrikan ulkopuolella, on lähellä edellisen voisi löytyä smgf.org (Sorenson) tietokanta ja se kuuluu Palestiinan arabien perhe vuonna Jerusalemissa .
YAP-insertin löysi Arizonan Michael Hammer ja hänen tiiminsä. Vuosina 1997-1998 Hammer julkaisi kolme artikkelia, jotka koskivat DE-haploryhmän alkuperää. Näille artikkeleille YAP-lisäys tapahtui Aasiassa. Viime aikoina vuonna 2007 tutkimukset, kuten Chandrasekar et ai. 2007, lainaa Hammerin julkaisuja, samalla kun se kannattaa YAP-lisäyksen aasialaista alkuperää.
Hammerin kehittämiin skenaarioihin kuuluu muuttoliike Afrikasta yli 100 000 vuotta sitten, YAP + -lisäys Aasian Y-kromosomiin 55 000 vuotta sitten ja YAP +: n paluumuutto Aasiasta Aasiaan. E. Tämä analyysi perustui siihen tosiasiaan, että vanhemmat afrikkalaiset sukulinjat, kuten haploryhmät A ja B , olivat YAP-negatiivisia, kun taas nuorin suku, haploryhmä E, oli YAP-positiivinen. haploryhmä D, joka on YAP-positiivinen, oli selvästi aasialainen sukutaulu, koska sitä löydettiin vain Itä-Aasiassa, korkeat taajuudet Japanissa ja Tiibetissä. Koska haploryhmän E määrittäviä mutaatioita havaittiin jo haploryhmän D esi-isätilassa ja koska 55 000 vuoden ikäinen haploryhmä D on huomattavasti vanhempi kuin haploryhmä E 31 000 vuodessa, Hammer päätti, että haploryhmä E oli haploryhmän D alaluokka.
Vuonna 2000 monet tutkijat olivat alkaneet kyseenalaistaa hypoteesin YAP-lisäyksen aasialaisesta alkuperästä. Underhill et ai. 2000 tunnistettiin häntä mutaation D-M174 jossa määritellään haplogroup D . M174-alleelia ei löytynyt mistään afrikkalaisesta sukulaisuudesta, kuten haploryhmä E. M174: n löytö tarkoitti, että haploryhmä E ei voinut olla haploryhmän D alaluokka. mutaatiot, jotka määrittelevät haploryhmän E Underhillin et ai. Vuonna 2000 pelkkä M174: n olemassaolo osoitti YAP-lisäyksen afrikkalaisen alkuperän.
YH: n afrikkalaista alkuperää tukevia muita väitteitä esitettiin Underhill et ai. 2001. Nämä perustelut ovat:
YAP +: n afrikkalaista alkuperää tukevat myös haploryhmää E. koskevat tutkimukset. Altheide ja Hammer 1997, nämä kirjoittajat väittävät, että haploryhmä E olisi esiintynyt Aasiassa esi-isän YAP +-alleelilla ennen siirtymistä takaisin Afrikkaan. Muutamat tutkimukset, kuten Semino et ai., Osoittavat kuitenkin, että haploryhmän E korkeimmat taajuudet ja monimuotoisuus ovat Afrikassa, joka on todennäköisin haploryhmän E lähtöpaikka.
Mallit, jotka tukevat afrikkalaista tai aasialaista alkuperää YAP + -lisäystä, edellyttävät kumpikin esi-isän YAP-kromosomin sukupuuttoa YAP + -polymorfisuuden nykyisen jakauman selittämiseksi. DE * paragroup ei ole mutaatioita, jotka määrittävät Haploryhmä D, eikä niitä, haplogroup E. Jos DE * paragroup oli todettu yhdessä maanosassa eikä toisaalta tämä olisi suosinut teorian välillä. Haploryhmä DE * on äskettäin löydetty Nigeriassa , Guinea-Bissaussa ja myös Tiibetissä . Kolmen DE * -sekvenssin välinen fylogeneettinen suhde on vielä vahvistamatta, mutta tiedetään, että Guinea-Bissaun sekvenssit eroavat Nigerian sekvensseistä ainakin yhden mutaation avulla. Weale et ai. väittävät, että DE *: n löytäminen nigerialaisten keskuudessa siirtää Afrikan YAP-kromosomien viimeisimmän yhteisen esi-isän (MRCA) päivämäärän takaisin . Heidän mielestään tämä vähentää aikaikkunaa, jonka läpi mahdollinen paluumuutto Aasiasta Afrikkaan voi tapahtua.
Chandrasekhar et ai. 2007, tuki YAP +: n aasialaista alkuperää. He väittävät
"YAP-insertion läsnäolo Koillis-Intian heimoissa ja haploryhmää D sisältävien Andamaanien saarten saarilaisten keskuudessa viittaa siihen, että kromosomissa, jossa oli merkkiaine M168 ( haploryhmä CT ), esiintyi YAP-insertiota ja M174-mutaatiota, joka määrittelee haploryhmän D Etelä-Aasia »
He väittävät myös, että YAP + -kantajat palasivat Afrikkaan muiden Euraasian haploryhmien kanssa. Näistä haploryhmä R1b1 * (18 000 - 23 000 vuotta), havaittu erityisen suurella taajuudella joissakin Pohjois- Kamerunin heimoissa , ja haploryhmä T (25 000 - 30 000 vuotta), havaittu matalilla taajuuksilla Afrikassa. Mutta haploryhmä E, jonka ikä on 50000 vuotta, on paljon vanhempi kuin nämä haploryhmät, ja sitä on havaittu 80-92%: n taajuuksilla suuressa osassa Afrikkaa.
Karafetin ym. Tutkimusta käsittelevässä lehtiartikkelissa. (2008), Michael Hammer tarkisti DE-haploryhmän alkamispäivämäärät 55 000 vuoden iästä 65 000 vuoteen. Haploryhmän E kohdalla Hammer tarkisti alkamisajankohdat 31 000 vuoden iästä 50 000 vuoteen. Hammerin sanotaan myös sanoneen: "DE-haploryhmän ikä on noin 65 000 vuotta vanha, vain hieman nuorempi kuin muu päälinja lähteä Afrikasta, jonka sanotaan olevan noin 70 000 vuotta vanha. Ikä", jossa hän myöntää, että haploryhmä oF lähti Afrikasta haploryhmän CF kanssa .
Peter Underhill väittää, että DNA-sekvenssivarianttien tarkasta alkuperästä tulee aina epävarmuutta YAP: n takia, koska esihistorialliseen demografiaan ja väestöliikkeisiin liittyvä tieto puuttuu. Underhill väittää kuitenkin, että kaikilla käytettävissä olevilla tiedoilla hypoteesi YAP + -polymorfismin afrikkalaisesta alkuperästä on yksinkertaisempi ja uskottavampi kuin aasialainen. Muut kirjoittajat ovat julkaisseet tai julkaisseet YAP +: n afrikkalaista alkuperää tukevan teoksen, mukaan lukien Luigi Luca Cavalli-Sforza , Toomas Kivisild , Spencer Wells , Linda Stone ja Paul F. Lurquin.
Tämä fylogeneettistä puu on para-Haploryhmä DE perustuu 2008 YCC puun ja siihen liittyvien julkaistu tutkimus.
Haplogroups Y-kromosomin (Y-DNA) | ||||||||||||||||||||||||
Viimeisin yleinen patrilineaalinen esi-isä | ||||||||||||||||||||||||
AT | ||||||||||||||||||||||||
BT | ||||||||||||||||||||||||
B | CT | |||||||||||||||||||||||
OF | CF | |||||||||||||||||||||||
D. | E | VS | F | |||||||||||||||||||||
G | H | IJK | ||||||||||||||||||||||
IJ | K | |||||||||||||||||||||||
Minä | J | LT | K2 | |||||||||||||||||||||
I1 | L | T | NEITI | P | EI | |||||||||||||||||||
M | S | Q | R | EI | O | |||||||||||||||||||
R1 | R2 | |||||||||||||||||||||||
R1a | R1b | |||||||||||||||||||||||