Voit lyhentää sitä tiivistämällä tiettyjen osioiden sisällön ja siirtämällä niiden alkuperäisen sisällön yksityiskohtaisiin artikkeleihin tai keskustelemalla niistä .
SARS-CoV-2 muissa eläimissäTauti | Eläin muodot COVID-19 |
---|---|
Tarttuva aine | SARS-CoV-2 |
Alkuperä | Ensimmäinen tieteellinen kuvaus: Wuhan , Hubein maakunta , Kiina , 2019 |
Sijainti | Yhdysvalloissa, Belgiassa, Espanjassa, Ranskassa ja Hongkongissa kuvatuista ensimmäisistä tapauksista |
Verkkosivusto | https://www.oie.int/fr/expertise-scientifique/informations-specistiques-et-recommandations/questions-et-reponses-sur-le-nouveau-coronavirus2019/ |
Vahvistetut tapaukset |
22 kissaa (luonnollinen saastuminen) 3 koiraa (luonnollinen saastuminen) Muut lajit: minkki, fretti, leijona, tiikeri, kani ... |
---|---|
Kuollut |
1 kissa 14 000 minkkiä (Wisconsin) 92 700 minkkiä teurastettu Espanjassa. Tanskassa teurastettiin 15 000 000 minkkiä |
Tämä artikkeli käsittelee SARS-CoV-2-infektioita muilla eläimillä kuin ihmisillä.
Pandemian alkaessa toukokuuhun astikesäkuu 2020, SARS-CoV-2: ta eläimissä on havaittu vain satunnaisesti, ja "eläinten rooli SARS-CoV-2: n epidemiologiassa on edelleen suurelta osin tuntematon" , mikä vaatii kiireellistä tutkimusta. Tutkimuksia serologisesta levinneisyydestä suositellaan eläimillä ihmisten rinnalla kärsineillä alueilla Covid-19, jotta löydettäisiin mahdolliset eläininfektiot, jotka ovat hiljaisia (tai eivät) koti- ja villieläimissä tai kulkevilla (erityisesti kissat, koirat ja fretit, kun he kuuluvat COVID-19: een) potilaat).
Sisään marraskuu 2020, Science - lehden mukaan "kädelliset, kissat, fretit, hamsterit, kanit ja lepakot voivat olla infektoituneita SARS-CoV-2: lla" . SARS-CoV-2 RNA: ta on havaittu myös "kentällä olevista felideistä, minkeistä ja koirista" . In Wuhan , monet kissat kantoi virusta. Ja genomiset analyysit, jotka tehtiin 16 minkkifarmilla, joihin SARS-CoV-2-tautipesäkkeet tarttuivat, ja siellä asuvilla tai työskentelevillä ihmisillä osoittivat, että ihmiset ovat tuoneet viruksen siihen ja kehittyvät siellä ", mikä todennäköisesti heijastaa minkin yleistä verenkiertoa tartunnan alkaessa useita viikkoja ennen havaitsemista (…) 68%: lla testatun minkin tilan asukkaista, työntekijöistä ja / tai kontakteista oli merkkejä SARS-CoV-2-infektion esiintymisestä. Kun kokonaisia genomeja oli saatavilla, kaikilla kannoilla oli eläimen "allekirjoitus", mikä osoittaa SARS-CoV-2: n tarttuvuuden eläimeltä ihmiselle minkkitiloilla .
Vuoden 2020 alussa tiedetään, että SARS-CoV-2: n glykoproteiinin huippu on peräisin SARS-CoV: stä (CoVZXC21 tai CoVZC45) ja tuntemattomasta β -CoV: stä (vielä tuntematon vuoden 2020 lopussa).
Vuoden 2018 lopussa , juuri ennen pandemiaa, Cui ym. (2018) oli varoittanut kirjoittamalla "[...], kun otetaan huomioon lepakoiden SARS-rCoV: n esiintyvyys ja suuri geneettinen monimuotoisuus, niiden läheinen rinnakkaiselo ja CoV: iden usein tapahtuva rekombinaatio, odotetaan, että tulevaisuudessa syntyy uusia muunnelmia".
Alussa 2020, on arvioitu, että uusi coronavirus ( SARS-CoV-2 ), tunnistettu lopussa 2019, on eläimistä peräisin ( luultavasti lepakot ). Mutaation jälkeen mukautuessaan ihmisiin hän aiheutti Covid-19-pandemian .
Se on osa satojen virusten ryhmää, erityisesti eristetty ihmisistä, jyrsijöistä ja lepakoista (joille koronavirukset näyttävät olevan erittäin patogeenisiä).
On osoitettu (mukaan lukien esimerkit SARS ja sitten MERS) että mutaatiot joskus sallivat CoVs ylittämään lajirajan , luultavasti tuhansia vuosia, joskus tulossa tärkeä ihmisen taudinaiheuttaja.
Vuoden alkaessa Covid-19 pandemian , muutamia tapauksia lemmikkieläimiä , karjaa tai eläintarhoissa on raportoitu tartunnan SARS-CoV-2 . Infektio on koirilla useimmiten lievä tai jopa oireeton. Vain yhden kissan kuolema on vahvistettu ja minkille on esitetty epäilyksiä ja sitten todisteita kuolleisuudesta. Epäilyt koskivat Hongkongin koiraa . Kissat, koirat, leijonat, tiikerit ja minkit näyttävät olevan ihmisten saastuttamia. Kissojen ja frettien välinen saastuminen on todistettu kokeellisesti. Ensimmäisten kuukausien aikana eläintapaukset näyttävät harvinaisilta, mutta testejä on tehty vain vähän, eikä edes yhtään villillä koehenkilöillä.
Vuoden 2020 puolivälissä kansallisten ja kansainvälisten terveysviranomaisten (WHO, OIE jne.) Mukaan kotieläimillä ei ole merkittävää epidemiologista merkitystä SARS-CoV-2 : n leviämisessä . kotieläimistä johtuvan ihmisen saastumisen riskiä tällä viruksella pidetään pienenä, mutta ei nollana. Päinvastainen riski (toisin sanoen eläimen saastuminen ihmisestä, joka kärsii COVID-19: stä) on osoitettu muutamissa yksittäisissä tapauksissa (koirat, kissat), mutta useimmissa tapauksissa testin aikana viruksen replikaatio näytti olevan nolla tai heikko, ja usein virusten erittyminen kotieläimistä oli vähäistä.
Toukokuussa 2020 asiantuntijat ovat edelleen varovaisia tässä asiassa, koska kuten Ranskan lääketieteellinen akatemia muistutti , "Sars-CoV-2 voidaan eristää useilla eläinlajeilla, mukaan lukien pesukarhu , kissat tai tartuttaa kokeellisesti fretit ja jyrsijät ( marsut ja hamsterit ), useimmiten ilman kliinisiä oireita . Vuoden 2020 alussa WHO (ja erilaiset asiantuntijat) ilmoitti ensimmäisten käytettävissä olevien todisteiden perusteella nopeasti, ettei ole viitteitä siitä, että tauti voisi tarttua ihmisistä eläimiin. Nämä asiantuntijat ja muut väittävät edelleen niukkojen tietojen perusteella, että virus ei tuskin vaikuta koiriin ja kissoihin ja että jos näin on, näiden eläinten erittymisaste ja tartuntariski ovat alhaiset .
alkaaToukokuu 2020, ei ollut vielä tiedossa, missä määrin viruksella oli tai ei ollut ominaisuuksia, joiden avulla se voi tartuttaa muita eläinlajeja. In yhteydessä Covid-19 pandemian , julkisen ja kasvattajat kyseenalaistaa riskejä eläimiään. Lisäksi Covid-19-pandemian hallitsemiseksi ja toisen aallon tai muun saman perheen virusten epidemian tai pandemian esiintymisen rajoittamiseksi tai välttämiseksi on tärkeää löytää, mikä on välilaji (kuten olemme pystyneet tekemään sen SARS ja MERS); se on myös tärkeää tietää, jos voisi olla muitakin lajeja-välittäjien ja ymmärtää, mitä voi suosia muita risteykset lajien este . Sama koskee SARS: ää, joka voi syntyä uudelleen, ja MERS: ää, joka ei ole kadonnut.
Jotkut tiettyjen HCoV: iden (ihmisen tai humanisoidut koronavirukset) "säiliöisännät" ja " välilajit " tunnetaan jo. Isäntäeläinten parempi tunnistaminen on välttämätöntä eläinlääkinnällisen ehkäisyn kannalta (ja ihmislääketieteessä). Todellakin esimerkkinä: SARS-CoV ja MERS-CoV ovat kaksi erittäin patogeenistä koronavirusta, mutta tähän mennessä heikosti sopeutuneet ihmisiin; niiden leviämistä ihmiskunnan sisällä ei voida taata, mutta ne voivat pysyä zoonoottisissa säiliöissään ja sieltä mahdollisesti levitä uudelleen ihmisiin "mahdollisesti yhden tai useamman väli- ja monistavan isännän kautta" ;
Kun ” One Health ” lähestymistapa, tutkijat pyrkivät siksi vastaamaan seuraaviin kysymyksiin: Mitkä ovat säiliön lajeja varten SARS-CoV-2 , mitkä ovat sen mahdollisia vektori , villi ja / tai kotimaista lajia , mahdollisesti välituotteiden tai mahdollisia vahvistimet SARS- CoV-2 ? miten ja millaisissa olosuhteissa virus leviää eläinmaailmassa? ja mitä vaikutuksia eläimiin ja ekosysteemeihin tai agroekosysteemeihin ? Toistavatko eläimet, jotka ovat samankaltaisia tai toisinaan lähellä ihmisiä, vai voivatko heillä olla epidemiologiset tai eko- epidemiologiset roolit ( hiusten , höyhenien , virtsan tai ulosteiden tai jopa syljen , kyyneleiden tai mahdollisesti siittiöiden kautta ).
Klo21. toukokuuta 2020, OIE arvioi, että "COVID-19: n nykyinen leviäminen on seurausta ihmisen välisestä tartunnasta; ja OIE katsoi, että se ei ollut perusteltua ottaa kohdistuvien toimenpiteiden eläimiä, erityisesti lemmikkieläimille, jotka voisivat vaarantaa heidän hyvinvointi” .
Sisään marraskuu 2020On selvää, että kädelliset, kissaeläimet, fretit, hamsterit, kanit ja lepakot voivat olla infektoituneita SARS-CoV-2: lla. SARS-CoV-2 RNA: ta on havaittu kissoilla, minkeillä ja koirilla eläintarhoissa, maatiloilla ja lemmikkeissä.
Viruksen mutaatioiden seuraaminen osoittaa, että ihmiset ovat tuoneet sen virukseen näissä tilanteissa ja kehittynyt "todennäköisesti heijastamaan minkkien yleistä verenkiertoa tartuntakauden alussa useita viikkoja ennen havaitsemista (...) 68% asukkaista, työntekijöistä testatuilla minkkitilalla ja / tai kontakteilla oli merkkejä SARS-CoV-2-infektiosta. Kun kokonaisia genomeja oli saatavilla, nämä ihmiset infektoitiin eläinsekvenssin allekirjoittaneilla kannoilla, mikä osoitti SARS-CoV-2: n tarttuvan eläimeltä ihmiselle minkkitiloilla ” . Nykyään on hyväksytty, että erilaiset eläimet (esim. Minkki, kissa, koira) voivat saastuttaa ihmisiä tai toimia tietyllä tavalla säiliössä.
Ne tartuttavat monia eläinlajeja ja ovat joskus zoonoottisia (eli kykenevät tartuttamaan sekä eläimiä että ihmisiä). Ne ovat todennäköisesti hyvin vanhoja, mutta viime vuosikymmeninä on esiintynyt muutamia uusia koronaviruslajeja, jotka ovat kiinnittäneet huomiota merkittävien sosiaalisten ja taloudellisten kustannusten vuoksi.
Historiallisesti ensimmäinen coronavirus (keuhkoputkentulehdus virus kana) tunnistettiin eläinlääkärin (jäljempänä D r Oskar Seifried) vuonna 1931 , mutta tämä ryhmä viruksia on enimmäkseen alettu tunnistaa toisella puoliskolla XX : nnen vuosisadan. Ne ovat olleet suuren yleisön tiedossa vasta vuodesta 2003 (jolloin SARS-CoV-1 ilmestyi aiheuttaen vakavan akuutin hengitysoireyhtymän epidemian ihmisillä).
Ennen SARS ( 2002 - 2003 ), MERS ja sitten COVID-19 pandemiat , koronaviruksista, katsotaan hyvänlaatuinen, olivat kovin kiinnostavia ihmisen lääkettä , mutta ne olivat jo huomattava merkitys eläinten terveydelle ( ”Suurin osa tietoa Patogeenisia molekyylitasolla koronavirusten ominaisuudet tulevat eläinlääketieteellisestä virologiayhteisöstä ” ). Vuonna XX : nnen vuosisadan CoV tiukasti "eläinlääkärin" tutkimukset keskittyivät ainoastaan virusten korkean teknisistä ja taloudellisista ongelmista jalostukseen: virus hiiren hepatiitti (MHV); kissan tarttuva peritoniittivirus (FIPV) ja siipikarjan tarttuva keuhkoputkentulehdusvirus (IBV). Sitten XXI : nnen vuosisadan sian epidemia ripuli virus (PEDV), koska se aiheuttaa huomattavaa sairastuvuutta ja kuolleisuutta (ja siten taloudellisia tappioita) se lisätään.
Eläinlääketieteelliset virologit, jo kauan ennen lääkäreitä, ovat tässä yhteydessä huomanneet, että tietyt koronavirukset voivat kohdistaa keskushermoston (CNS). He osoittivat tämän sian enkefalomyeliitti haemagglutinating viruksen (tai oksentelu ja kuluttava sairaus virus tunnetaan phev), pääasiassa tiedetään siankasvattajille lähteenä suolistoinfektiota, mutta joka voi myös infektoivat neuroneja , että järjestelmässä. Keskushermostossa , mikä aiheuttaa enkefaliitti vuonna sikoja , johon liittyy oksentelua ja laihtumista. Äskettäin sioilla on kuvattu uutta alfakoronavirusta, joka tunnetaan nimellä sikojen akuutti ripulioireyhtymä ( SADS-CoV ).
Eläinlääkärit ovat entistä kiinnostuneempia koronaviruksista, jotka ovat kaksinkertainen konteksti planeetan antropisaatiosta , ja globalisoituneesta teollisesta jalostuksesta (geneettisesti vähemmän ja monipuolisempien eläinten jalostaminen, erityisesti keinosiemennyksen kehittymisen ja esivanhempien voimakkaan valinnan vuoksi. ) on erittäin suotuisa virustyypin leviämiselle ja uusien koronavirusten esiintymiselle.
Koronavirukset ovat yleisiä monissa kotieläimissä; usein ei kovin oireenmukaista tai oireetonta; mutta joskus kohtalokkaita.
Elimistössä niiden tropismia (kohdesoluja ja / tai viruksen kohde-elimiä) on pitkään pidetty pääasiassa hengitysteiden, gastroenteristen (ruoansulatuskanavan kokonaan tai osittain) tai maksan (kokonaan tai osittain maksassa) ja harvemmin neurologisten , mutta huomaamme yhä enemmän neurologisia hyökkäyksiä, joskus vakavia.
Koronaviruksia, joilla on joskus vakavia tai kuolemaan johtavia vaikutuksia ihmisiin, on esiintynyt kolme vuodesta 2000 lähtien ( SARS-CoV-1 , MERS , SARS-CoV-2 ). Kun syntymistä 2019 ja SARS-CoV-2 ja vastaavasti Covid 19-pandemian ) in 2019 - 2020 mennessä ( 3 e pandemian syntyminen johtuu koronavirus kahden vuosikymmenen aikana). Vuonna 2020 kiireellisenä haasteena on siis ymmärtää paremmin tämän viruksen ekologia sekä sen vuorovaikutus muiden (sen perheen tai muiden) virusten kanssa sekä tämän viruksen ja ihmisten ja kotieläinten tai villieläinten immuunijärjestelmän välillä. se on yhteydessä; sekä luonnonvaraisten eläinten jalostus-, metsästys-, kauppa- ja myyntijärjestelmät. Näillä kolmella nousevalla sairaudella on todellakin yhteistä, että ne ovat erittäin tarttuvia, joskus vaikeita tai kuolemaan johtavia (SARS, MEERS, COVID-19), ja ymmärtämällä CoV - isäntäkohtaiset vuorovaikutukset eläimissä "voisivat myös antaa tärkeää tietoa patogeneesistä. CoV ihmisillä" . Kuten influenssa , COVID-19 on zoonoottinen sairaus, jonka aiheuttaa RNA-virus , toisin sanoen virus, joka mutatoituu helposti ja näissä 3 tapauksessa siirtyy eläimiltä ihmisille (väli-isännän kautta) ja päinvastoin todennäköisesti kulkee ihmisistä eläimiin. Molekyylimekanismit, jotka ovat vastuussa uusien CoV-kantojen tai -varianttien syntymisestä ja uusien antigeenisten, biologisten ja / tai patogeneettisten ominaisuuksien selittämisestä, on ymmärrettävä paremmin, jotta voidaan paremmin ymmärtää myös Covid-19-pandemian syntyminen, leviäminen ja evoluutio sekä mahdollinen eläinvastine.
Vuodesta 2002 lähtien koronavirusten taipumus "ylittää lajiesteet " (toisinaan ihmisten vahingoksi) ei ole enää epäilystäkään. Esimerkiksi ihmisen koronavirus OC43 (tunnetaan nimellä: HCoV-OC43 ) on beetakoronavirus, joka tartuttaa ihmisiä ja karjaa ja jonka esi-isä voisi olla "naudan" koronavirus, jolla on - satunnaisella mutaatiolla - kyky infektoida ihmisiä. Tämän viruksen molekyylikellon mukaan sen esiintyminen on suhteellisen äskettäistä (heidän viimeisin yhteinen esi-isänsä on päivätty noin vuonna 1890 ). SARS-CoV-2 on itse seurausta viruksen rekombinaation virus bat väliasennossa eläin, joka saa hänet paeta eläinten eläin sykli, infektoidaan ihmisille, hyväksi adaptiivista mutaatioiden muunnetaan bat viruksen tehokas ihmisen taudinaiheuttaja.
Ihmisten läheiset eläinperhe-lajit ovat todennäköisemmin tartunnan saaneita, mutta samaan perheeseen kuulumisella ei ole systemaattista yhteyttä riskiin, esimerkiksi Cricetiadae- perheen sisällä villi hiiri ei näytä vastaanottavan virusta, kun taas hamsteri supistuu helposti.
Viittaus SARS: ään nimellä " SARS-CoV-2 " heijastaa filogeneettistä ryhmää, johon se kuuluu, sen sijaan että se yhdistää tämän viruksen ihmisten SARS-tautiin (SARS-CoV-2 ei ole SARS-CoV: n jälkeläinen, mutta se on geneettisesti hyvin läheinen serkku).
Coronavirusten kuuluvat Orthocoronavirinae alaryhmään Coronaviridaen perheen ja Nidovirales järjestyksessä .
Tähän alaryhmään kuuluu tällä hetkellä neljä koronaviruksen sukua ; vastuussa yhteisiä tai poikkeuksellista infektioiden monissa lintulajit ( Ɣ -CoV, ẟ -CoV) ja nisäkkäät ( α -CoV, β -CoV, Ɣ -CoV), mukaan lukien ihmisillä ja apinoilla:
Taksoni | Symboli | Huomautukset |
---|---|---|
Alfakoronavirus | a- CoV | Ryhmä, joka tartuttaa vain nisäkkäitä, mukaan lukien erilaiset ihmisen koronavirukset, mutta myös sian tarttuva sian gastroenteriitti koronavirus (tai TGEV, englanninkielisillä tarttuvalla gastroenteriittiviruksella ), koiran koronavirus (CCoV) ja kissan koronavirukset |
Betakoronavirus | p -CoV | tartuttaa vain nisäkkäitä |
Gammacoronavirus | Ɣ -CoV | tartuttaa lintuja ja joillekin nisäkkäille |
Deltakoronavirus | ẟ -CV | tartuttaa lintuja ja joillekin nisäkkäille |
Heillä on erilaiset roolit viruskantojen ja -lajien evoluutiossa ja ihmisiin siirtymisessä.
For SARS-CoV-2 (kuten muidenkin ”ihmisen koronaviruksissa”), Zi-Wei ja hänen kollegansa (alkaen University of Hong Kong ), erottaa vuonna 2020 neljään toiminnallisesti eri kategoriassa:
Huomaa : ”Ihmisen” CoV: n (HCoV) tai kehittyvän HCoV: n kanta, joka on edelleen heikosti sopeutunut ihmisiin, voi olla ”kehittyvä umpikuja” tai umpikuja ja katoaa jo ennen kuin siitä on ilmoitettu, koska ne eivät jatku väli-isännän sisällä. Mutta he voisivat myös sopeutua yhteen tai useampaan väli-isäntään ja tulla sitten endeemisiksi ("väli-isännästä" tulee sitten "säiliön isäntä").
Alkuperä? Koronaviruksen SARS-CoV-2 ja ei-SARS-CoV-2 -kantojen fylogeneettisten suhteiden selvittämiseen tähtäävän analyysin mukaan valmistunutkesäkuu 2020 (mutta julkaistu 7. marraskuuta):
Kirjoittajien mukaan "SARS-CoV-2 olisi voinut kehittyä tavallisten koronavirusten kaukaisesta yhteisestä esi-isästä olematta kenenkään niistä haara"
Kotieläimissä ja tuotantoeläimissä ensimmäiset tunnistetut SARS-CoV-2-infektion oireet olivat ensin hengityselimet, sitten ruoansulatuskanava tai munuaiset. Ihmisillä vihjeet ja lopulta todisteet ovat myös korostaneet kardiovaskulaarisia ja neurologisia vaikutuksia. Jotkut näistä vaikutuksista voivat myös olla ongelmallisia eläimille, jos niitä esiintyy.
Esimerkiksi vuonna 2020, se on vielä epäselvää, hajuaistin ja makuaistin puute ovat oireita myös koe-eläimissä tartunnan SARS-CoV2. Mutta jos SARS-CoV-2: lle alttiina oleva villieläin vain kokee makunsa tai hajunsa muutaman viikon ajan, sen elämä voi olla vaarassa. Itse asiassa monet eläimet ovat riippuvaisia haju- ja makuaististaan löytääkseen ja valitessaan ruokansa, havaitsemaan saaliin tai saalistajien (mukaan lukien ihmiset) kulun tai läheisyyden. Nämä aistit antavat heille myös mahdollisuuden sijoittua ympäristöönsä, pimeässä, havaita feromoneja ja muita muiden lajien tai alueellisten yksilöiden alueen tuoksuvia merkkejä, haistaa sen nuoren identiteetin tai iän., Tulkita sosiaalisen aseman dominointi tai muiden yhteisön jäsenten emotionaalinen tila tai jopa seksuaalisen kypsyyden aste jne., kaikki elintärkeät tekijät luonnossa selviytymiselle.
Kissat ja koirat ovat vähemmän elintärkeitä siitä, mutta tiedämme, että anosmia voi esimerkiksi tehdä niistä väkivaltaisia läheisiä kohtaan tai hyvin häiriintyneitä). Esimerkiksi ryhmä susien (vankeja) sulatettu anosmic kaduittain hajuaistin hermo , nuoret miehet menettivät kyky toistaa (vähäinen kiinnostus naaraiden proestrus tai kiima ), mutta vanhempi mies (seksuaalisesti kokenut ennen leikkausta ) kopioitui onnistuneesti anosmiastaan huolimatta (huomautus: mahdollinen puolueellisuus tai kysymys on se, että hajuhermo pystyy ainoana uudistumaan). Metsästyskoira , joka menettäisi hajuaisti tulee menettävät paljon kykynsä. Ja luonnossa (14. toukokuuta 2020), Richt huomauttaa, että "jos koirilla on samanlaisia oireita, se voi vaikuttaa ilmaisukoiriin, jotka haistavat huumeita, räjähteitä ja muita laittomia esineitä" (sama koskee koiria, joita käytetään kadonneiden henkilöiden etsimiseen tai vangittuina maanjäristyksen raunioihin)
Unohdetaan eläimiä, pandemia Covid-19 on kysymyksiä terveys- ja écoépidémiologiques . Joten:
Myös sosioekonomisia (tuotanto eläimet ) ja sosiopsykologisen kysymykset (aikana synnytyksen , eristyksissä ihmisiä tai perheitä, vammaiset jne, The lemmikki voi olla vahvistettu psyko-emotionaalista rooli). Ympäri maailmaa suurella osalla ihmisistä on lemmikkieläimiä tai elinkorkoja, jotka ovat riippuvaisia enemmän tai vähemmän omistajistaan selviytyäkseen. Kuinka vastata lyhyellä, keskipitkällä ja pitkällä aikavälillä heidän fysiologisiin tarpeisiinsa (ja eläinten hyvinvointiin , myös emotionaaliseen) pandemian aikana? minkä mahdollisten zoonoosiriskien kanssa?
Kuten minkä tahansa zoonoosin kohdalla , on tärkeää ymmärtää viruksen ja eläimen suhde; ”Eläinisäntien tunnistamisella on suoria vaikutuksia ihmisten sairauksien ehkäisyyn. Eläinten CoV-isännän vuorovaikutusten tutkimus voisi myös antaa tärkeää tietoa ihmisten CoV: n patogeneesistä . Alkuvuodesta 2020 , rooli, jonka Huanan mereneläviä tukkumarkkinoilla vuonna Wuhan , ja luultavasti jonka Pangolin (epäilty jonkin aikaa - helmikuussa 2020 - hoidettavakseen todennäköinen "väli lajit") humanisointiin A bat koronaviruksen sitten "löytö" kaksi koiraa ja kissa virusta kantavista joukossa vain muutama koe-eläimistä kasvatettu yleisön ja asiantuntijoiden, kysymyksiä ecoepidemiological ominaisuuksista ja SARS-CoV-2 ja COVID-19 ;
Missä määrin villi- tai kotieläimet voivat tartuttaa ihmisiä ja päinvastoin? Mikä? Miten? 'Tai' Mitä? Millainen ekoepidemiologinen rooli ja mitkä ovat mahdolliset eläinlääketieteelliset, ekologiset ja taloudelliset seuraukset?
WHO ja OIE alaisuudessa ja YK, suosittelen hoitoon zoonoottiset pandemiat kautta maailmanlaajuisen ja ballististen lähestymistapa tunnetaan nimellä " One Health ". Tämän uuden koronaviruksen ja eläinmaailman välisten yhteyksien ymmärtäminen on tarpeen myös huumeiden tai rokotteiden testauksessa käytetyn " eläinmallin " parantamiseksi ja epidemiariskin paremman hallinnan varmistamiseksi . OIE: lla on villieläimiä käsittelevä työryhmä, ja vuoden 2020 alussa toimisto perusti epävirallisen OIE: n neuvoa-antavan ryhmän COVID-19: stä (nimettiin myöhemmin uudelleen OIE: n ad hoc -ryhmäksi COVID-19: lle ihmisen ja eläimen välisessä rajapinnassa ).
Viruksen tropismi ilmailu-ruuansulatuskanavassa viittaa todennäköisiin reitteihin ruoan uloste-oraalisessa saastumisessa; ja viruspartikkelit todetaan todellakin ulosteesta (ihmisestä ja eläimestä). Kiinalaisessa tutkimuksessa (2004) SARS: n, koronaviruksen, joka oli jo vastuussa pandemiasta vuonna 2003, tarkoituksena oli tunnistaa viruksen lähteet 94 henkilöllä, joilla ei ole ollut yhteyttä potilaisiin. Kirjoittajat eivät pitäneet " hiirien tai torakoiden läsnäoloa kotona" riskitekijänä. Rotta on mainittu virus hajaantuminen tekijä yhdessä tapauksessa, mutta ilman konkreettisia todisteita tai vahvistus.
Ottaen huomioon viruksen (erityisesti keuhkojen ja suoliston) tropismin ja ottaen huomioon, että nuoleminen on yleensä tärkeää eläimillä (myös kissoilla, jotka myös nuolevat peräaukkoa ), kotikissojen ja kaniinien karvan, kuivikkeen ja kuivikkeen sisällön hallinta leviämistä tiettyjen ulosteiden muodossa ja siipikarjan ulosteita , lanta , liete ja jätevesilietteen jne mahdollisesti aiheuttaa merkittäviä kansan- ja eläinlääketieteellisiä kysymyksiä
Lisäksi joitakin erityisiä tapauksia ilmenee, esimerkiksi havaita koirien COVID-19 potilaita kokemusta Maisons-Alfort eläinlääketieteellisessä oppilaitoksessa ja Bégin sairaalan Saint-Mandé . Kun tapa tehdä vain tuntuu koira, haju vanulapulla liottaa hiki ja kainalot henkilön, tartuntariskin mukaan koiran harjoittaja näyttää erittäin pieni, varsinkin kun tänä päivänä se näyttää melko vaikea tartuttaa. Mutta jos koiran on haistettava matkustajien haju, joka poistuu liikennemuodoista, kuten lentokone, vene, juna, bussi, metro jne. havaita viruksen kantajat, mahdollisesti oireettomat, mikä on suunniteltu varhaisessa vaiheessaToukokuu 2020, koiran tartuntariski on suurempi tai havaita sairaita ihmisiä kadulla, toinen avoin kysymys on: voivatko koirat - kuten ihmisetkin - joutua anosmian (hajun menetys) uhriksi SARS-CoV-2: n tartuttamana ? Tiedämme, että koirilla esiintyy joskus anosmiaa (tiedämme jopa, miten se valmistetaan keinotekoisesti). Se näkyy erityisesti koirilla vaikuttaa penikkatauti (anosmia joskus jatkuvat talteenoton jälkeen). Konggeneraattori voi hyökätä koiralle, jos jälkimmäinen on anosminen.
Lopuksi suojelu haasteet biodiversiteetin ja ympäristöetiikan myös olemassa, myös suhteessa muihin kädellisten , humaani jotkut superperheeseen on hominoids ( apinoita erityisesti) on genomin hyvin samanlainen kuin meidän (tästä aiheesta, katso kohta omistettu apinoita alla ). Tiedotusvälineiden ja sosiaalisten verkostojen välittämistä aiheista ovat tapa, jolla tietyt villieläimet (lähinnä linnut ja nisäkkäät) ovat muuttaneet käyttäytymistään merkittävästi, kun heidän ympäristöstään, satamista tai kaupungeista on tullut hiljaisempia, puhtaampia ja lähes autottomia. pian eristämisen alkamisen jälkeen . 21. toukokuuta 2020BBC varoitti, että kuvamateriaalia villieläimiä tutkia autio kaupungeissa rikkaiden maiden ei piilota että siellä oli myös "piikki salametsästyksen monissa maissa aikana Lockdown - joka lisäksi 'on huono villieläinten lisää meidän riski altistua uusille virukset (...) ", koska miljoonat ihmiset ovat yhtäkkiä työttömiä eikä heillä ole mihin luottaa" (...) Kansainväliset matkustusrajoitukset ovat saattaneet haitata luonnonvaraista kauppaa rajojen yli, mutta ne jättävät myös eläimet luonnossa paljon vähemmän suojattuna ” .
Ihmisten pandemian alkaessa keräämien tietojen mukaan tämä "reseptori" on välttämätön SARS-CoV-2- viruksen tartuttamiseksi soluun.
Sisään helmikuu 2020, siirtogeeniset hiiret , jotka ilmentivät ACE2-reseptorin ihmismuotoa (angiotensiiniä konvertoiva entsyymi 2, joka on sekä SARS-CoV-1: n että SARS-CoV-2: n reseptori), olivat vastaanottokykyisiä virukselle. Mutta villi- tai kotieläinten herkkyydestä SARS-CoV-2: lle oli vain vähän tietoa. Sitten osoitettiin, että hiiren ACE2 ei sitoutu tehokkaasti SARS-CoV-1- ja SARS-CoV-2-virusten "spyke-proteiiniin" (S), mikä estää viruksen pääsyn viruksen soluihin. hiiri (minkä vuoksi ihmisen ACE2-siirtogeeninen hiiri kehitettiin in vivo eläinmallina näiden kahden viruksen tartunnan ja patogeneesin tutkimiseen.
Kanoja lukuun ottamatta ihmisen ACE2: lla ja 17 muun lajin lajilla on voimakkaita geneettisen sekvenssin yhtäläisyyksiä .
Tämä viittaa kolmeen epidemiologisesti tärkeään elementtiin (ellei toisin osoiteta):
Sitä tarvitaan edelleen Covid-19: n vastaisten lääkkeiden ja rokotteiden kehittämiseen ja tutkimiseen . Tätä varten laboratoriot tarvitsevat eläimiä, joilla on viruksen kohdeproteiineja ( lähinnä ACE2 ) ja joilla on tartunnan jälkeen oireita, jotka ovat verrattavissa COVID-19-potilailla havaittuihin.
Ongelma : ACE2: n tai sen ympäristön biomolekyylirakenteen pienet vaihtelut tekevät tästä proteiinista (joka sijaitsee tiettyjen solujen pinnalla) kohteena, jonka virus on kiinnittänyt enemmän tai vähemmän tehokkaasti .
alkaaToukokuu 2020, hiiret (hiiret, rotat), reesusapinat, fretit, koirat, kissat, siat, kanat ja ankat on tutkittu potentiaalisina eläinmalleina SARS-CoV-2: lle .
Ehdokaslajit (eläinmallina) |
edut | haittaa |
---|---|---|
Lab-hiiri | eläimen erittäin nopea lisääntyminen | koska ACE2 on liian erilainen kuin meillä, se ei ole luonnostaan vastaanottavainen virukselle, mutta loimme hiiret, jotka on muunnettu geneettisesti ilmaisemaan "ihminen" ACE2 ihmisen lääketieteellistä tutkimusta varten |
Rhesus-apina | helposti tartunnan tällä viruksella | ihmisillä havaittujen COVID-19-vaikutusten epätäydellinen lisääntyminen |
Fretti | erittäin helposti tartunnan saanut tällä viruksella | ihmisillä havaittujen COVID-19-vaikutusten epätäydellinen lisääntyminen |
Kissa | helposti infektoitunut tällä viruksella (kokeellisesti osoitettu tarttuvuus kissasta kissaan) |
ihmisillä havaittujen COVID-19-vaikutusten epätäydellinen lisääntyminen |
Kani | helposti infektoitunut tällä viruksella Eläimen nopea lisääntyminen; sen ACE2 sitoo viruksen paremmin kuin yllä mainittujen lajien virus SARS-CoV-2: n (ja SARS-CoV-1) hyvään lisääntymiseen COVID-19: n vaikutuksista |
Kani on myös herkkä kanin koronavirukselle (RbCoV), joka on ”kuumeen lähde ”; ruokahaluttomuus; painonpudotus ; Takypnea; silmän iiriksen tulehdus (iridosykliitti) ” . Alunperin raportoitu 1961 vuonna Skandinaviassa (missä kani kasvatus on vielä erikoisuus) virus kuvattiin 1968 ; Viroosi voi ilmetä kahdessa patologisessa muodossa: systeeminen (pleuraefuusio tai kanin kardiomyopatia) tai enteerinen. |
Laboratorio hiiret : kautta soluviljelmissä in vitro, niillä on esimerkiksi testattaessa 2012 mutantti variantit -koronavirus ( rekombinanttien ja SARS-CoV-1 ) vailla spesifisten geenien ja / tai vailla rakenteellisen geenin E (rSARS -CoV- ΔE). Kaikkien näiden mutanttivirusten osoitetaan olevan tarttuvia ja tuottaneet alkuperäisen viruksen kaltaisen morfologian virioneja useissa ihmisen solulinjoissa ja siirtogeenisessä hiiressä (Tg). Tämä tulos tarkoittaa, että puuttuvat proteiinit eivät ole välttämättömiä virussyklille. Kuitenkin ilman "proteiini E: tä" hiirien ja viljelysolujen erittämä viruskuormitus väheni hyvin (noin 100 kertoimella hiirten keuhkoissa) ... ja ilman lisääntymistä näiden hiirten aivoissa (toisin kuin tämä mikä tapahtui muiden E-proteiinilla varustettujen varianttien kanssa). "E-geeni" voisi siis olla tekijä solutropismissa ja virulenssissa tai jopa patogeenisuudessa; ja heikennetty virus AE (josta puuttuu proteiini E) voisi siten olla rokotekandidaatti.
Yhden terveyden lähestymistavassa tämä seuranta on lääketieteen ja eläinlääketieteen yhteisön vastuulla, mutta myös jalostus- ja metsästysmaailman vastuulla. Se on välttämätöntä, koska viruksen evoluutio ja erilaisten HCoV-tautien genominen rekombinaatio ovat suuret, mutta myös tämän tyyppisten epidemioiden tai pandemioiden aiheuttamat ihmis-, eläinlääkintä- ja taloudelliset kustannukset. Tämän valvonnan tulisi, jos sitä harjoitettaisiin laajamittaisesti ja ylläpidettäisi ajan myötä, mahdollistamaan mahdollisten tautitilanteiden varhainen havaitseminen, tietää, mitkä lajit ovat tämän viruksen ja muiden koronavirusten tartuttamia (kotieläimiä koskevien serologisten tutkimusten avulla). esimerkiksi vasta-aineiden etsinnällä), löytää erilaisia tai uusia taudinaiheuttajien kantoja, jotka kohdistuvat yhteen tai useampaan lajiin ja / tai muihin elimiin tai soluihin (ja muita oireita, jotka eläinlääkärien ja lääkäreiden on opittava tunnistamaan).
Esimerkki havainnollistaa tätä mahdollisuutta: Ensimmäisen löydetyn koronaviruksen ( 1930- luvun alussa ) uskottiin tartuttavan vain kanojen ylemmät hengitystiet ja lisääntymiselimet, mutta myöhemmin havaittiin, että tietyt saman viruksen kannat hyökkäsivät myös munuaissoluihin aiheuttaen nefriittia ). Sitten tämän viruksen erilaisia serotyyppejä ja geneettisiä tyyppejä löydettiin kaikkialta maailmasta (vain vähän tai ei lainkaan ristisuojausta serotyypistä toiseen).
Eläinlääkäriyhteisö on havainnut noin 90 vuoden ajan, että uusia IBV-tyyppejä ilmaantuu edelleen ( mutaatioiden ja rekombinaatiotapahtumien kautta viruksen genomissa), mikä tekee tästä IBV-viruksesta edelleen vaikeaa tunnistaa ja vielä vaikeampaa hallita. sitä vastaan on kehitetty useita rokotteita.
Ekoepidemiologisen riskin tarkka arviointi edellyttäisi kuitenkin useiden eläinten testaamista useiden lajien sisällä. Tämä vaatii aikaa ja riittäviä inhimillisiä, teknisiä ja taloudellisia resursseja sekä erityislupia suojeltavien lajien parissa työskentelystä . Tämä ei ollut prioriteetti pandemian alkaessa. Helmikuusta toukokuuhun, maailmassa, vain muutama maatila eläimiä , muutama luonnonvaraisten eläinten eläintarhoissa, muutama koiria ja kissoja, arvioitiin niiden alttiutta virus. Nämä tutkimukset tekivät ennen kaikkea kiinalaiset tutkijat (testeillä ja myös mallinnamalla viruksen kohteena olevaa ACE2- proteiinia eri lajeilla, joiden osalta nämä tiedot sisältyivät jo käytettävissä oleviin tietokantoihin). Siten 42 näkökohtaa, jotka ovat läsnä Hubein ja Jiangxin maakunnissa (luonnossa syöneinä, lääke-, seuralais-, tuotanto- tai eläintarhaeläimet), on tutkittu tästä näkökulmasta:
Tieteellinen nimi | Yleinen nimi | ACE2- yhteensopiva viruksen kanssa (vahvistetaan in vivo ) | Huomautukset |
---|---|---|---|
Rhinopithecus roxellana | Roxellanen rhinopithecus | Joo | Primate ( Rhinopithecus että Cercopithecidae perhe (Kiina, Tiibet, Vietnam, Burma). |
Macaca mulatta | Reesusmakakki, reesusapina tai Bandar, | Joo | jo eläinmallina käytettynä SARS-CoV-2 aiheuttaa siinä hengitystiesairauksia jäljittelemällä ihmisillä usein havaittavaa kohtalaista tautia; pitkä 8-16 päivää tyypillisillä keuhkoinfiltraateilla, suurilla orofaryngeaalisilla viruspainoilla sekä keuhkoputkien alveolaarisella huuhtelulla; Huomaa: Yhdellä potilaalla ilmeni pitkittynyt rektaalinen viruksen irtoaminen. Tämän vuoksi on hyvä eläinmalli tutkia COVID-19: n patogeneesiä ja testata tiettyjä lääketieteellisiä vastatoimenpiteitä. |
Mustela erminea | Kärppä | Joo | Pieni lihansyöjä, mustelidae- perheestä |
Camelus dromedarius | Kameli | ei | Säiliö lajeja varten MERS-CoV ja kätkeminen useita muita koronavirukset; MERS-CoV on todennäköisesti tartuttanut kamelit vuosikymmenien ajan. Tämä virus näyttää olevan hyvin sopeutunut tähän lajiin, jolla on vain lieviä oireita tartunnan yhteydessä; dromedaari olisi siis jo siirtynyt "väli-isännän" asemasta "säiliöisännän" asemaan, vakaa ja luonnollinen. MERS-CoV- mutaatioaste näyttää suhteellisen matalalta dromedaarissa, ja jos viruksen siirtyminen ihmisille on vaarallista, se on vain satunnaista ja vahingossa tapahtuvaa; ihmiset pysyvät MERS-CoV: n umpikujana, koska sen leviämistä ei voida ylläpitää. |
Procyon-lotori | Yhteinen pesukarhu | ei | |
Paguma larvata | Naamioitu kämmenesiitti1 tai Pagume tai Naamioitu sivetti | Joo | Pieni lihansyöjä Etelä-Kiinasta |
Rhinolophus macrotis | Isokorvainen hevosenkengän lepakko | Joo | |
Rhinolophus ferrumequinum | Isompi hevosenkengän lepakko tai Suuren hevosenkengän lepakko, Suuren hevosenkengän lepakko tai Suuren hämärän hevosenkengän lepakko | ei | |
Rhinolophus sinicus | Kiinalainen punahiuksinen hevosenkengän lepakko | Joo | Esijulkaisussa (versio 1) mainitaan tämä laji SARS-CoV-2: n luonnollisena isäntänä, ja se saattoi mahdollisesti tartuttaa ihmiset suoraan välitöntä isäntää tarvitsematta; tässä tutkimuksessa (jota ikätoverit eivät ole vielä vahvistaneet) mainitaan myös mahdolliset välilajit. |
Rousettus leschenaultii | Syvännepiikkihai Leschenault (iso bat frugivore ) | Joo | melko helposti tartuttava nenänsiirteen avulla ((50% tartunnan saaneista eläimistä), helppo tarttua yksilöiden välillä; tartunnan ominaisuuksien perusteella laji voi olla yksi säiliölajeista (tai jäljitellä, heijastaa säiliölajin ominaisuuksia, tai joilla on antropotooninen rooli), vaikka ne eivät olisikaan pandemian alkuainesäiliö (koska sitä ei ole Kiinassa) .Nämä ominaisuudet tekevät siitä kuitenkin hyödyllisen mallilajin. Pandemian aikana kaikki kontaktit, joita ei ole suojattu näillä lepakoilla tai niiden elinympäristössä (myös tutkimusohjelmien tai ekologisten analyysien aikana) tulisi välttää. |
Sus scrofa | Villisika | Joo | kyllä, sen ACE2-reseptorin mukaan, mutta on vahvistettava luonnossa, koska sika (geneettisesti hyvin läheinen laji) ei näytä olevan alttiita virukselle. |
Mustela putorius furo | Fretti | Joo | Tämä eläin helppo kokeellisesti tartuttavat on 3 e eläimen yleisin yritys Pohjois-Amerikassa 2000-luvun alussa on Euroopassa ja Japanissa , takana koira ja kissa . Vuonna 2020 Ranskassa olisi noin 500 000 lemmikkieläintä; hänellä on oltava Eurooppalainen passi matkustamiseen ja rokotettava raivotautia vastaan ja tunnistettava. Siitä asti kun4. heinäkuuta 2011, tämä tunnistus on tehtävä käyttämällä elektronista sirua ( RFID ), joka on istutettu fretin ihon alle eläimen kaulan vasempaan osaan. |
Rattus norvegicus | Ruskea tai norjarotta | ei | Kiinalainen, tuotu suurelle osalle maailmaa, lemmikki ja laboratoriorotan alkuperä |
Mus musculus | Harmaa hiiri, talohiiri, talohiiri | ei | Komensaaliset ihmisen lajit ; kaikkialla ja laboratorion hiiren alkuperä |
Canis lupus familiaris | Koira | Joo | Kiinassa kulutettu lemmikki, geneettisesti lähellä harmaata susi ja hyvin lähellä Dingoa |
Felis catus | Kissa | Joo | Lemmikki. Kissanliha kulutetaan Aasiassa, ja paikallisesti Euroopassa, jossa esimerkiksi noin 7000 kissojen kulutetaan alueilla Pohjois-Italian, vaikka teoriassa Euroopassa kiellettyjä. |
Manis javanica | Jaavanilainen Pangolin tai malaiji Pangolin | Joo | Hyvin salametsästetty eläin , jota käydään Kiinassa paljon kauppaa ja jonka epäillään olleen laji, jonka sisällä COVID-19-virus on inhimillinen. Villissä pangoliinissa on kaksi koronaviruslinjaa, jotka ovat filogeneettisesti lähellä SARS-CoV-2: ta (PCoV-GX ja PCoV-GD). |
Rhinolophus pearsonii | Pearsonin hevosenkengän lepakko | Joo | |
Phyllostomus-väri | Värikäs phyllostoma | Joo | |
Pteropus vampyrus | Malesian hedelmälepakko tai Malesian kalong, Malesian hedelmälepakko tai suuri lentävä kettu | Joo | Sen siirtomaita voi olla tuhansia yksilöitä, pääasiassa Kaakkois-Aasiassa |
Pongo abelii | Sumatran Orangutan | Joo | |
Equus caballus | Hevonen | Joo | |
Bos taurus | Zebu, lehmä, naudanliha, sonni, hieho / hieho, sonni, lehmä, vasikka | Joo | Ihmisten lähellä olevien ja merkittävän kansainvälisen kaupan kohteena olevien eläinten ryhmä |
Pan troglodytes | Simpanssi, simpanssi | Joo | Lajit geneettisesti hyvin lähellä ihmistä |
Ornithorhynchus anatinus | Vesinokkaeläin | ei | |
Ovis oinas | Lammas | Joo | Eläimet, joihin kohdistuu merkittävää kauppaa (paikallinen ja kansainvälinen) |
Papio anubis | Oliivi paviaani | Joo | Cercopithecidae-perheen apina. Laajin kaikista paviaaneista, löytyy 25 Afrikan maasta monenlaisissa elinympäristöissä (savannit, arot ja metsät). Se on myös laboratorioeläin. |
Loxodonta africana | Afrikkalainen savanni norsu | ei | |
Sus scrofa domesticus | Kotisika | Joo ? | Eläimet, joille käydään merkittävää kauppaa (paikallista tai kansainvälistä). Huomautus : teoreettiset tutkimukset ( sikojen ACE2-muodon perusteella päätellen sen alttiudelle SARS-CoV-2: lle ), mutta sikojen kokeellinen infektio istuttamalla SARS-CoV-2, Shi et ai. (8. huhtikuuta 2020) totesi, että sikaa oli mahdotonta tartuttaa (käytetyn rokotteen avulla), samoin kuin toinen tutkimus, joka julkaistiin heinäkuussa 2020 The Lancet -lehdessä , vaikka se oli esijulkaisu (vertaisarviointia odottava tutkimus), sitten toinen tutkimus (huhtikuu 2020) pääteltiin, että sika (kuten hiiri) on haavoittuva ja voi olla tuleva väli-isäntä ja “todennäköinen SARS-CoV-2-säiliö” . |
Erinaceus europaeus | siili | ei | |
Oryctolagus cuniculus | Eurooppalainen kani, tavallinen kani | Joo | Kekotrofinen eläin , jonka lihasta, turkista, karvoista ( angorasta) käydään merkittävää kauppaa |
Nyctereutes procyonoides | supikoira | ei | |
Vulpes vulpes | Kettu | Joo | Eri maissa metsästetyt, loukkuun jääneet tai turkistaan kasvatetut lajit |
Phodopus campbelli | Campbellin hamsteri | Joo | NAC (uudet lemmikit) |
Mesocricetus auratus | Kultainen hamsteri (tai Syyrian hamsteri) | Joo | lemmikki ja laboratorioeläin, käytetään erityisesti COVID-19: n tutkimiseen |
Callithrix jacchus | Tavallinen marmosetti, valkoinen kärki | Joo | Huomaa: Eteläamerikkalaiset apinat ovat muiden tutkimusten mukaan alttiita virukselle |
Suricata suricatta | Meerkat | ei | |
Heterocephalus glaber | Karvaton myyrä rotta tai karvaton myyrä rotta | Joo | Kekotrofi, |
Nannospalax galili | Sokea moolirotta Ylä-Galilean vuorilta (Välimeren moolirotaryhmästä | Joo | Kekotrofi, |
Dipodomys ordii | Ordin kengururotta | ei | |
Ictidomys tridecemlineatus | Raidallinen maa-orava | Joo | Miehittää suuren osan Keski-Amerikasta |
Cavia porcellus | Marsu, Kotimainen marsu, Marsu | ei | Kotieläimet ja laboratorioeläimet |
Cricetulus griseus | Kiinalainen hamsteri | Joo | Uusi lemmikki ja laboratorioeläin |
Catharus ustulatus | Oliivin tukema sammas tai oliivin tukema sammas | Joo | Ensimmäinen ACE2-yhteensopiva lintutapaus (laajasti vaeltava Pohjois-Amerikan ja Länsi-Etelä-Amerikan välillä) |
Näiden neljänkymmenen lajin joukossa olisi siten " poissuljettua " tai epäherkkä virukselle: dromedaari, pesukarhu, hevosenkengän lepakko R. ferrumequinum (yksi alun perin epäiltyjen lepakoiden lajeista), ruskea rotta (tai ruskea) , hiiri (vahvistettava), Ornithorhynchus, afrikkalainen norsu, siili, pesukarhu, Suricate, Ordin rotakenguru ja marsu (marsu) sekä todennäköisesti sianliha ja villisika.
Yllä olevassa taulukossa on vain muutama indikaatio ja "koettimet", ja sen luettelo ei ole läheskään tyhjentävä ( luettelo yksinomaan Kiinassa olevista nisäkkäistä sisältää 495 lajia, joista on monia alalajeja tai rotuja. Kotieläimet). Muut tutkimukset ovat alkaneet tarkistaa ja täydentää sitä tai laajentaa sitä muille maantieteellisille alueille (esimerkiksi Afrikassa täplikäs hyena ( Crocuta crocuta ) näyttää myös alttiilta virukselle (esijulkaisua ei ole vielä vahvistettu vertaisissaToukokuu 2020).
Tiedot ja indeksit ovat saatavilla Toukokuu 2020, esitetään yhteenvetona alla;
Koska kädelliset ovat lähellä ihmisiä ja niitä käytetään joskus eläinmallina, myös rokotteiden ja lääkkeiden testaamiseksi, kädelliset (PNH) ovat saaneet virologien erityistä huomiota.
Loppu huhtikuu 2020, tiedämme, että mitä tulee SARS: iin ja MERS: iin , lepakot ovat monien koronavirusten ja erityisesti SARS-CoV-2: n tai sen läheisen esi-isän (luultavasti pääsäiliön) luonnollinen zoonoottinen säiliö, mutta emme vielä tiedä mikä on isäntäalue SARS-CoV-2: sta (ja väli-isännät, jotka voivat edelleen helpottaa muiden lajien hyppäämistä ihmisiin).
Harbinin (Kiina) eläinlääketieteellinen tutkimuslaboratorio on julkaissut31. maaliskuutaon bioRxiv ), joitain alkutietoja kokeellisista nenän rokotuksista muutamilla ihmisille lähellä olevilla eläimillä. Nämä tiedot viittaavat siihen, että:
Virologian puuttuu edelleen nopea ja tehokkaita välineitä löytää uusia viruksia ympäristössä ja myös tunnistaa niiden isännät (kuten 3 jäsentä Academy of Kiinan tiede, sanoi menetelmää analyysiin käytetään koodia ei ole optimaalinen).
Eniten kärsinyt laji on amerikkalainen minkki : alkaen25. tammikuuta 2020 (samoin kuin muut mustelidit) epäillään (esijulkaisu) olevan erityisen herkkä virukselle.
Kymmenen kuukautta myöhemmin minkinviljelylaitokset ilmoittivat sen kuudessa maassa ( Tanskassa , Alankomaissa , Espanjassa , Ruotsissa , Italiassa ja Yhdysvalloissa ).
5. marraskuuta 2020, Tanskan seerumi-instituutin alustavassa raportissa raportoidaan mutaatista SARS-CoV-2-kannasta, joka siirtyi minkistä 12 ihmiselle. Tämän kannan on osoitettu in vitro olevan vähemmän herkkä aiemmin infektoituneiden henkilöiden vasta-aineille . Jos se leviää, sitä valmistamattomat rokotteet (ja immunoterapiat ) hallitsevat vähemmän . Tanskan hallitus teurasti ennalta ehkäisevästi 15 miljoonaa minkkiä.
NederlandsissäTässä maassa asuu noin 160 minkkitilaa.
26. huhtikuuta 2020, kahden tilan (lähes 15 km päässä toisistaan Pohjois-Brabantissa maan eteläosassa) ilmoitetaan olevan OIE: n saastuttamia siellä ; sijaitsee Milheezessä ja Beek en Donkissä (7500 aikuista minkkiä ennen jalostusta). Minkillä oli hengitysvaikeuksia (vuotava nenä, keuhkokuume ) ja lisääntynyt kuolleisuus. Huhtikuun lopussa 2,5% minkistä kuoli ensimmäisellä tilalla ja hieman yli 1% toisella tilalla ilman klustereiden havaintoja (kuolleet eläimet ovat hajallaan tiloilla molemmissa tapauksissa); ruumiinavaukset paljastavat vakavan diffuusisen interstitiaalisen keuhkokuumeen ja SARS-CoV-2 RNA: n nenän turbinaateissa , keuhkoissa , kurkussa ja peräsuolessa , joilla on suuri orofaryngeaalinen viruskuorma. Anti-SARS-CoV-2-vasta-aineita löytyy 60 minkin verinäytteestä kahdelta tilalta.
Molemmissa tapauksissa työntekijöillä oli ollut COVID-19-oireita, ja toisessa tapauksessa omistaja ilmoitti flunssan kaltaisesta sairaudesta . Maatalousministeriön mukaan "saastuminen ihmisistä eläimiin on mahdollista" . Mutta sen vaikutus ihmisten terveyteen on tällä hetkellä "merkityksetön" . Maatilojen lähellä olevat tiet on suljettu, ja eläinten ja niiden lannan liikkuminen on kielletty. Näissä tiloissa aloitetaan kliininen, patologinen ja virologinen tutkimus sekä näytteistettyjen virusisolaattien sekvensointi, ja siellä suunnitellaan minkin serologinen tutkimus (3 kertaa 6 viikon aikana). Ilmaa ja pölyä testataan lähellä " varotoimenpiteenä " (mutta julkaisemattoman näytteenottoprotokollan mukaan), ja ministeriö suosittelee, ettei polkupyörällä pidetä 400 metrin säteellä ainakin ennen kuin näytteet on analysoitu.
-Englannin kansalaisjärjestö PETA ehdottaa minkki-turkistarhojen kieltoa (alun perin suunniteltu vuodelle 2024 Alankomaissa). Tutkimus osoittaa, että näillä kahdella tilalla oli virus useita viikkoja , ja näiden kahden tilan lähteet olivat erilaiset. "Kliinisesti puhkeamisen kesti noin 4 viikko, mutta jotkut minkki olivat edelleen positiivisia polymeraasiketjureaktion varten SARS-CoV-2 suun ja nielun jälkeen otetuissa katoaminen kliinisiä oireita" , mikä tekee niistä kantajia oireettomia.
-7. toukokuuta 2020, 2 muuta maatilaa julistetaan saastuneiksi, yksi De Mortelissa (Gemert-Bakelin kunta, saman omistajan kuin Milheeze ), toinen Deurnessa . Kaikissa 4 tapauksessa virus näytti olevan ihmiseltä.
Tanskan Sören Alexandersen, joka johtaa "Centre for Study of Emerging Infectious Diseases" in Geelongissa klo Deakinin yliopisto Australiassa , "kehitys tilanne on tulossa" hyvin huolestuttava kanssa nyt 4 isoa minkkitarhoilla vaikutti Alankomaissa. Low ... olisi erittäin yllättävää, jos muut minkinkasvatuslaitokset suurimmissa minkin tuottajamaissa, kuten Pohjois-Euroopassa , Pohjois-Amerikassa ja Kiinassa , eivät kärsii niin paljon. ilmoitetaan, että minkkiä pidetään suurilla tiloilla ja että näiden tartuntojen leviäminen on erittäin tehokkaasti häkistä toiseen " ; Vaikuttaa siltä, että raskaana olevat naiset ovat haavoittuvimpia; muistutuksena katsoja synnyttää kerran vuodessa, noin 5 poikaa, huhtikuun lopusta toukokuun alkuun, joten toukokuussa kasvattajat täytyy hallita eniten eläimiä. Koska nämä minkin olivat luultavasti alunperin tartunnan ihmiseen, niin luultavasti kautta jatk iso agioni minkistä minkkiin ; luulisi, että viruksen uudelleenlähetysriski minkistä ihmisiin voi olla merkittävä. Alexandersen lisää: "Koska olen työskennellyt minkin kanssa muiden infektioiden kanssa, mielestäni tämä on hyvin häiritsevää tietoa ja mahdollisesti vakava riski" .
Tämä on sitäkin huolestuttavampaa, kun otetaan huomioon, että immunosuppressiivinen sairaus on hyvin yleinen minkkitiloilla, erityisesti Kiinassa: AMD ( Aleutin minkin tauti ). Se on ensimmäinen kolmesta sairaudesta, joita eläinlääkärit ovat yleisimmin havainneet ja hoitaneet turkista tuottavilla mustelidifarmilla (ja erityisesti minkin kohdalla kaikkialla maailmassa) .Tauti on myös levinnyt viime vuosikymmenien aikana. luonnollinen ympäristö.
Kahdessa ensimmäisessä hollantilaisessa maatilassa häkit olivat yksilöllisiä, ilman minkki-minkki kosketusta, mutta järjestettyinä sivuille avattuihin suuriin suojaan. Viraalista RNA: ta ei löytynyt ulkoilmasta. Mutta pöly kahdelta tilalta (näytteenotto 3 kertaa28. huhtikuuta ja 16. toukokuuta 2020) sisälsi sitä joskus rakennuksissa ja toiminnoissa tietämättä missä määrin pöly saastuttaa . 8. toukokuuta 2020, Pääministeri Carola Schouten ehdottaa suosituksia edustajainhuoneelle. RIVM ( kansallinen kansanterveys- ja ympäristöinstituutti ) puolestaan luo neljän tilan ympärille 400 metrin turva- alueen, arvioidessaan toukokuun puolivälissä sen (näissä olosuhteissa ja odottaen muita ilman- ja pölynäytteiden analyysejä) "COVID-19: n tämänhetkisen tiedon perusteella minkkitilat eivät aiheuta riskiä ihmisten myöhemmälle saastumiselle" . Muutamia kaninviljelylaitoksia (laji, jonka Erasmus University Rotterdam on osoittanut alttiiksi myös SARS-CoV-2: lle), on myös havaittu.
26. toukokuuta 2020, täsmälleen kuukauden kuluttua siitä, kun minkistä ihmisiin siirtymisen riski on luokiteltu "merkityksettömäksi" , myös maataloudesta ja luonnosta vastaava 1. ministeri Schouten vahvisti, että "Äskettäin toinen tapaus ilmestyi yhdessä tartunnan saaneista minkkitiloista . Todennäköisin on, että SARS-CoV-2 (Covid-19) leviää minkistä ihmisiin . Wim van der Poelin (virologi, jota lainaa RTL Nieuws) mukaan virus on viimeisessä tapauksessa siirtynyt minkistä ihmisiin ( "Työntekijällä oli oireita, sitten positiivinen testi. Sitten tutkimme viruksen geneettisen koodin kyseisessä henkilössä. Ja sen perusteella, mitä tiedämme, tämän geneettisen koodin avulla voimme sanoa, että virus tuli minkistä " , ei 100-prosenttisen varmuudella, mutta pienellä vaaralla olla väärässä, hän sanoi". (alueen 160 minkkitilasta)
Aloitakesäkuu 2020, Deurnessa kaksi työntekijää, jotka olivat saaneet minkin SARS-CoV-2-koronaviruksen: tämä on ensimmäinen dokumentoitu eurooppalainen tapaus covid-19: n tarttuvasta eläimestä ihmisestä . Alankomaiden viranomaiset ovat määränneet teurastamaan 10000 minkkitilaa maassa, vaikka jotkut eläinten hyvinvointiyhdistykset uskoivat sen olevan vain epäilys. Minkin SARS-CoV-2-genomien fylogenetiikka osoitti 5 hollantilaista klusteria (A - E), mutta minkäänlaista SARS-CoV-2: n "leviämistä" ei esiintynyt Alankomaiden väestössä.
11. kesäkuuta, Eurosurveillance vahvistaa, että näillä maatiloilla "hengitettävä pöly sisälsi viruksen RNA: ta , mikä viittaa työntekijöiden mahdolliseen altistumiseen"
Ja on tunnistettu toinen ekoepidemiologinen ongelma: tilojen ympärillä on havaittu 24 kulkukissaa; heidän verensä ja suun ja nielun limansa sisälsivät anti-SARS-CoV-2-vasta-aineita. Yhdestä näistä kissoista havaittiin virus-RNA, mutta se oli liian pieni sekvensoitavaksi.
IrlannissaTässä maassa on 3 suurta teollisuuslaitosta, joilla on syksyllä 2020 yhteensä noin 100 000 minkkiä. Kuten Ranskassa, siellä ei ole havaittu SARS-CoV-2-tapauksia, mutta yhden terveyden ja ennalta varautumisen lähestymistavassa kaikkien viljeltyjen minkki maassa on ilmoitettu, koska terveysministeriön mukaan "minkin lisääntymisen jatkaminen merkitsee jatkuvaa vaaraa viruksen lisävaihtoehtojen ilmaantumisesta", mahdollisesti patogeenisemmaksi tai tarttuvammaksi ihmisille tai muille eläimille.
EspanjassaKlo Puebla de Valverde - tarkoittaen kylässä vihreä laakso - sijaitsee Aragon , 92700 minkki teurastettiin, koska positiivisuus 90% heistä on covid testissä.
OIE: n mukaan "vaikka zoonoosin leviämistä ei voida sulkea pois, vaikutusta ihmisten terveyteen pidetään vähäisenä epidemian tässä vaiheessa, koska tehokas tarttuminen ihmisestä toiseen on epidemian liikkeellepaneva voima" .
KiinassaKlo 26. toukokuutaKiina, vaikka maailman suurin minkin kasvattaja, ei ole ilmoittanut minkään COVID-19 -tapauksen minkistä.
S. Alexandersen on yllättynyt: "Koska olen työskennellyt minkin kanssa muiden infektioiden kanssa, mielestäni tämä on erittäin huolestuttavaa tietoa ja mahdollisesti vakava riski"
in DenmarkViljeltyjä minkkejä on useita kymmeniä kertoja enemmän kuin Alankomaissa.
4. syyskuuta 2020, Statens Serum Institute (SSI) Kööpenhaminassa ilmoittaa maan eläinlääkintä- ja elintarvikehallinnolle, että kaksi koronaviruksen mutanttia kukoistaa Tanskan maatiloilla, maatilat ovat ihanteellinen ympäristö minkkien väliselle tartunnalle.
Elintarvikeministerille Mogens Jensenille ilmoitettiin henkilökohtaisesti terveysvaarasta
1. lokakuuta .
16. syyskuuta, ISS ja Kööpenhaminan yliopisto (UC) ilmoittavat yhdessä Tanskan eläinlääkintä- ja elintarvikehallinnosta ja lisäävät, että uusin näistä kahdesta mutantista löytyy nyt ihmisistä ja minkistä ainakin kuudessa Tanskan maatilalla.
Lokakuussa professori Hans Jørn Kolmos (a mikrobiologi on University of Southern Denmark ) uskoo, että viranomaiset ovat reagoineet aivan liian hitaasti käytettävissä olevien tietojen.
18. syyskuuta, ISS: n ja UC: n raportissa katsotaan, että ihmisiin leviämisen aiheuttama piikkiproteiinimutaatioiden lisääntyvä määrä Tanskassa on "kansallinen ja kansainvälinen uhka" kansanterveydelle ja ihmisille - rokotteen odotetut vaikutukset. Elintarvike-, maatalous- ja kalastusministeri Mogens Jensen ei vastannut tiettyihin haastattelupyyntöihin Tanskassa, jossa monet kasvattajat erikoistuivat minkkien kasvattamiseen .
3. marraskuuta 2020Tanskan pääministeri , Mette Frederiksen , vahvistaa, että viidessä minkkitarhoilla Pohjois-Jyllannissa mutatoitunut virus Covid-19 lähetettiin 12 henkilöä (sanovat klusteri 5 "); 4 potilasta oli ollut kosketuksessa minkin kanssa 3 tilalla. Tällä viruksella on 4 mutaatiota S-proteiinia koodaavassa geenissä : deleetio (2 aminohapon menetys) H69del / V70del ja 3 mutaatiota aminohappomuutoksella: Y453F, I692V, M1229I). Sars-CoV-2 : n Spike 1 -proteiinia koodaavassa geenissä havaitaan kaksi, sitten seitsemän mutaatiotamarraskuu 2020tanskalaisessa minkissä ja joissakin ihmisissä, ei ole yllättävää, koska RNA-virukset mutatoituvat paljon, mutta häiritsevää, koska proteiinien plastisuus on valikoiva etu lajiesteen ylittämisessä . Marraskuun alussa, viljellyissä minkeissä esiintyi mutatoitunut virus a priori , joka on jo siirretty 214 ihmiselle (joista 12: lla on yksi variantti, jolla on WHO: n mukaan "yhdistelmä mutaatioita tai geneettisiä muutoksia, joita ei ole aiemmin havaittu ") 7-79, joista vain 8 oli suoraan yhteydessä minkinviljelyyn ja 4 lähistöllä asuvia), mikä saattaa uhata tulevan rokotteen tehokkuutta , koska ihmisen vasta-aineiden on osoitettu olevan vähemmän tehokkaita heitä kohtaan. Siksi Tanskan hallitus määrää teurastaa yli 17 miljoonaa minkkiä sen alueella kasvatetuissa häkeissä. Tämän päätöksen taustalla on se, että teollisissa siipikarjatiloilla liian tarttuvaa lintujen tarttuvaa keuhkoputkentulehdusta ei ole koskaan estetty asianmukaisesti tavanomaisilla bioturvallisuustoimenpiteillä; vain säännöllisesti päivitettävä rokote, jota käytetään ympäri maailmaa, näyttää olevan tehokas.
Kysymykset korvauksena kasvattajille on poliittisen keskustelun aihe, jotkut vaadittiin korvaus malli perustuu keskihinta nahkojen viimeisten 10 vuoden aikana, mutta myös odotetut hyödyt useita vuosia tulevaisuuteen, tietäen, että vuodesta 2009 kohteeseen 2019 , minkin turkiksen vienti (lähinnä Kiinaan) olisi tuonut 5-13 miljardia kruunua, mutta puhuttiin myös näiden tilojen kieltämisestä. Toinen riski on, että minkkiin mukautettu SARS-CoV-2 voi ylittää lajiesteen ja tartuttaa toisen eläinlajin (villi ja / tai viljelty).
Tanskalainen asianajaja väittää, että hallitus ei voi velvoittaa, vaan vain "kutsua" kasvattajat tappamaan minkinsa, koska Tanskan lain mukaan vain 8 km: n säteellä tartunnan saaneen minkin ympärillä sijaitsevia minkkejä voidaan teurastaa. Ja hätälaissa vaaditaan 2/3 parlamentin äänistä , mikä ei johtunut Venstre-puolueen toimenpiteiden vastustamisesta . Tämä maa on johtava minkinahkojen jalostaja / viejä Euroopassa. Minkkinviljelijät osoittivat traktoreissa, kun kansanterveysryhmät aloittivat teurastuksen (jonka odotetaan kestävän 15 päivää).
4. marraskuutaPääministeri Mette Frederiksen ilmoitti kuitenkin lehdistötilaisuudessa, että "kaikki viljellyt minkit" olisi tapettava Tanskassa, ja lisäsi, että päätöstä ei voida " neuvotella eikä keskustella " . Tanskan kansallinen poliisi vastaa minkin teurastuksen koordinoinnista. Noin viisitoista miljoonaa minkin ruumiita on tuhottava, mieluiten poltettava, koska terveydellisistä syistä ei voida enää pitää teurastamojätettä, joka on aiemmin muunnettu eläinten rehuiksi tai biomassaenergiaksi . DAKA-tehdas (Randerissa), joka yleensä "arvostaa" minkin ruumiita sen jälkeen, kun niiden turkis on kerätty syksyn lopusta, on viranomaisten pyynnöstä muutettu hätäkeskukseksi. biopolttoaineiksi ja dieselpolttoaineiksi. Kuorma-autot ja varusteet pestään ja desinfioidaan siellä useita kertoja prosessin aikana, ja suojapuvut ovat pakollisia. Elinten minkki steriloidaan paineen alla 20 minuuttia 130 ° C: ssa, sitten eläinten ja luun ateriaa muuttuvat biopolttoainetta, ja rasva muuntelee Daka ecoMotion osaksi SO sanottu kestävän 2. sukupolven biodieseliä varten tieliikenteessä. .
6. marraskuuta 2020, kun taas Saksa ja Yhdistynyt kuningaskunta lisäsivät Tanskan luetteloonsa maista, joissa karanteeni on pakollista, Tanskassa noin 280 000 asukasta seitsemästä paikkakunnasta on rajoitettu kunnallaan yrittämään lopettaa näiden virusten mutanttien leviäminen, eikä sitä suositella kaikki mennä alueelle, jolla ylläpidetään vain koululiikennettä. Mutta DAKA-kasvi on lähellä kylläisyyttä (ennennäkemätön tapaus), koska sen on käsiteltävä määrä ruumiita muutamassa päivässä, yleensä 3-4 viikon intensiivisen työn aikana. Osa kuorma-autoista ohjataan kaukolämpöyhtiöille, jotka kutsutaan polttamaan nämä minkit samalla kunnioittaen tiettyjä hygieniaolosuhteita. Niitä käytetään lämmön, sähkön tuottamiseen ja niiden tuhkaa voidaan käyttää tien kerroksen tai rakennusperustan pohjassa. Sønderborg Varme hyväksyi ensimmäisen yrityksen tämän tehtävän. Kaikki minkinviljelijöiden käsittely- ja työskentelytoimet ovat nyt kansallisen poliisin valvonnassa yhdessä Tanskan eläinlääkintä- ja elintarvikehallinnon kanssa.
Yleensä Dakan kanssa kilpailevat saksalaiset ostajat ostavat myös minkkirunkoja, mitä he eivät tee vuonna 2020 pandemian yhteydessä.
Kolmas ratkaisu toteutetaan, jossa hautaa miljoonien ruumiiden alareunassa syvät haudat, peitetty poltettua aluksi kaksi suurta ja pitkää lineaarista joukkohautoja kaivettiin nosturilla Länsi -Jyllannissa. (Ja muut kuopat harkitaan maan eteläosassa ja Jyllannin eteläosassa). Tanskan eläinlääkintä- ja elintarvikevirasto valitsi kaksi sotilaskohtaa (Holstebro ja Karup) yhdessä Tanskan luontoviraston kanssa pohjaveden saastumisriskin rajoittamiseksi .
Marraskuun puolivälissä hallitus arvioi, että uusi uusi mutatoitu kanta (tunnetaan klusterina 5) näyttää nyt "todennäköisesti" sukupuuttoon; Tanskan kansallinen seerumi-instituutti ei ole löytänyt tätä muunnosta sen jälkeen15. syyskuuta.
In Hong Kong ensin aikana seulonta toteutetulla 17 koiraa ja kahdeksan kissojen kanssa elävien ihmisten virusta kantavista kaksi koiraa "positiivisiksi Covid-19". Esijulkaisun mukaan (versio23. heinäkuuta 2020, hyödyntämällä Pohjois-Italiassa tehdyn tutkimuksen tuloksia - suurin tähän mennessä tehty lemmikkieläinten koronavirusta koskeva tutkimus), kissat ja / tai koirat, jotka elävät tartunnan saaneiden ihmisten kanssa tai alueilla, joihin COVID-19 vaikuttaa vakavasti olla SARS-CoV-2-virusinfektio ihmisinä ". Tämän ennalta julkaistun tutkimuksen (ennen vertaisarviointia) kirjoittanut EI Patterson et ai. bioRxiv-tutkimuksessa näissä tapauksissa mikään PCR-testeistä, jotka on tehty Pohjois-Italiassa otetuista näytteistä 817 lemmikin (540 koiraa ja 277 kissaa, maaliskuun ja maaliskuun välisenä aikana) kuonosta, kurkusta tai peräsuolestaToukokuu 2020), ei osoittanut SARS-CoV-2-virus-RNA: n esiintymistä analyysin aikana, muut testit (veressä kiertävien virusten vasta-aineiden suhteen) osoittivat, että jotkut eläimet (noin 3% koirista ja 4% kissoista ja tarkemmin sanottuna: 3,4% koirista ja 3,9% kissoista) oli aiemmin saanut tartunnan viruksella. Tämä 3-4%: n infektioprosentti on verrattavissa eurooppalaisten ihmisten havaitsemiin testien aikaan. Tutkimuksessa ei selvitetty, voisivatko nämä eläimet puolestaan tartuttaa ihmisen tai muut eläimet, mutta kirjoittajat huomauttavat, että "koirilla COVID-19-positiivisista kotitalouksista oli huomattavasti todennäköisempi positiivinen tulos kuin COVID-19-negatiivisista koirista kotitaloudet ”. Edellyttäen, että ikäisensä vahvistavat nämä luvut, ne tarkoittavat, että tarttuvia viruksia levisi tuolloin koirilla ja kissoilla yhtä paljon kuin ihmisillä.
Of kissan coronavirusten on tunnettu jo useita vuosikymmeniä, 2 patotyypit:
Kissat : Sisäänmaaliskuu 2020, ensimmäinen COVID-19-tapaus kissoilla on vahvistettu OIE: ssä . Erillisenä tai jopa poikkeuksellisena sen löysivät Belgiassa Liègen eläinlääketieteellisen tiedekunnan tutkijat . Tämä kissa olisi saanut tartunnan hänen rakastajastaan, joka olisi palannut kärsinyt COVID-19: stä Italian matkalta ja asetettu karanteeniin kotiinsa. Toisin kuin kaksi koiraa, jotka jo havaitsivat kantavansa virusta, tällä kissalla oli viikkoa myöhemmin ruoansulatuskanavan ja hengityselinten oireita ( " ruokahaluttomuus , ripuli , oksentelu , yskä ja hengenahdistus" , jonka eläinlääkäri havaitsi videolinkin kautta). Kissa testattiin sitten positiiviseksi ( ulosteet ja oksentelu ) RT-PCR: llä, minkä jälkeen viruksen läsnäolo varmistettiin suuritehoisella sekvensoinnilla . Yhdeksän päivän sairauden jälkeen eläin toipui, kertoi AFSCA . Yksi tämän pandemian viranomaisten edustajista tohtori Emmanuel Andrén mukaan "ei ole mitään syytä uskoa, että eläimet voivat olla epidemian levittäjiä yhteiskunnassamme" .
Maailman eläintautijärjestö (OIE) on julistanut SARS-CoV-2: n uudeksi taudiksi; Siksi maiden on ilmoitettava vahvistetuista eläintapauksista OIE: lle.
Vuonna 1971 kuvattiin ensimmäinen "koiran koronavirus" (CCoV), joka sitten tunnistettiin enteropatogeeniksi koirilla; Viruksen (ja muut koronavirukset) esiintyvät usein koiran väestön, erityisesti suurissa ryhmissä isännöi suojien, eläinkaupasta, kennelit metsästää tai kasvatustyöstä , koska tarttuvuutta viruksen.
Vuonna pennut ja nuorille koirille, tietyt coronavirukset ovat toisinaan johtanut kuolemaan, varsinkin kun on yhteisinfektiota CDV tai muiden suoliston taudinaiheuttajia. Koska 2000-luvulla , raportit erittäin virulenttia CCoV epidemioita on dokumentoitu Euroopassa.
Koira on ainoa koira, jolla on kohtalainen haavoittuvuus SARS-CoV-2: lle
Lisäksi virologit Kiinassa ovat kokeellisesti infektoineet koirat "ihmisen SARS-CoV-2: lla", ja biokemiallisesta näkökulmasta koiran ACE2: lla on kokoonpano, joka sallii viruksen sitoutua siihen. Thomas Mettenleiter (virologi ja liittovaltion eläinterveystutkimuslaitoksen johtaja Riemsissa, Saksassa) suosittelee koiran omistajille, joilla on positiivinen koronavirus, oltava varovaisia lemmikkejä käsiteltäessä.
Asiantuntijoiden tai eläinlääkintä- tai terveysviranomaisten lausunto : Ne kehittyvät tietämyksen mukaan. Vuoden 2020 alussa AFCD arvioi tieteellisten tietojen perusteella, että Covid-19 voidaan tartuttaa koirille tartunnan saaneelta omistajalta. Mikään ei kuitenkaan osoita, että koirat voivat puolestaan tartuttaa ihmisiä tai muita eläimiä;
Varotoimenpiteenä AFCD kehottaa eläinlääkäreitä lisäämään valppauttaan, käyttämään henkilökohtaisia suojavarusteita (käsineitä, naamioita jne.) Ja desinfioimaan rutiininomaisesti ympäristöään, varsinkin jos eläimellä on tiedossa oleva historia tai epäillään olevan yhteydessä vahvistettu tapaus. AFCD lisää, että eläinsairaaloissa asiakkaiden tulisi myös käyttää suojanaamareita . Hongkongin eläinlääkäreitä pyydetään ilmoittamaan epäilystään eläimen saastumisesta AFCD: lle vihjelinjan kautta.
Karanteeni on varotoimi estää eläimiä osansa fomite (harjoittaja viruksen ihmiselle) puolivälistä lähtien
maaliskuu 2020, ei ole vielä todisteita siitä, että lemmikkieläimet välittävät (tai eivät) virusta ihmisille;
- Pennsylvanian yliopiston eläinlääketieteellisen mikrobiologin Shelley Rankinin mukaan SARS-CoV-2: n tarttuvuuden mahdollisuutta ihmisiltä eläimille (kumppani tai ei) ei ole vielä tutkittu, eikä epidemiologista merkitystä voida antaa tämä yksittäinen tapaus.
SisäänToukokuu 2020, Ranskan lääketieteellinen akatemia katsoo, että jos "COVID-19 voidaan tartuttaa tartunnan saaneelta omistajalta koirille. Mikään ei kuitenkaan viittaa, että tällä hetkellä, että koirat voivat puolestaan saastuttaa kautta aerosoleja tai syljestä infektoitumattomilta ihmisiä tai muita eläimiä kohdannut (esimerkiksi kadulla.)” OIE (ilmoitus9. maaliskuuta 2020), sitten ANSES (lausunto 11. maaliskuuta 2020) piti koiran ja koiran saastumisriskiä epätodennäköisenä, mutta suositteli varovaisuutta erityisesti siksi, että kissoilla ja koirilla tiedetään olevan useita ACE2 -solureseptoreita, jotka ovat samanlaisia kuin meidän; teoreettisesti virus voi siksi kiinnittyä siihen; mutta hän ei todennäköisesti pääse helposti heidän soluihinsa.
Lopuksi vuonnaheinäkuu 2020Italiassa, tartunnan saaneilla alueilla ja perheissä tehtyjen vasta-ainepitoisuustutkimusten mukaan CARS-CoV-2-infektioprosentti (3,4%) 540 koirasta, jotka oli testattu maaliskuun ja Toukokuu 2020) "Heijastakaa ihmisten omaa" .
Varotoimenpiteenä ihmisten, joilla on SARS-CoV-2, tulisi rajoittaa kosketusta lemmikkinsä kanssa, pestä kätensä hyvin ja olla nuolematta kasvojaan (koska virusta esiintyy nenän eritteissä, käsissä ja potilaan suussa).
Keski-Toukokuu 2020, Nature-lehden artikkeli välittää American Veterinary Medical Associationin lausunnon, jossa suositellaan, että COVID-19-potilaat "pukeutuvat naamioon hoidettaessa lemmikkinsä ja välttävät hellittämistä, halaamista sylissään tai jakamaan ruokaa eläinten kanssa ja pesemään. kätensä ennen kosketusta heidän kanssaan ja sen jälkeen ” . "On kiireesti testattava enemmän eläimiä, jotka ovat läheisessä yhteydessä ihmisiin, mukaan lukien työeläimet ja karja, jotta voidaan ymmärtää, onko niillä rooli viruksen leviämisessä (...) Tarvitaan sarjoja eläinten testaamiseksi ”, lisää Jürgen Richt (eläinlääkäreiden virologi, Kansasin osavaltion yliopisto).
Viimeaikainen mallinnus ennusti, että "koirat voisivat olla toissijaisia isäntiä SARS-CoV-2: n evoluution aikana lepakoista ihmisiin"
Se on tunnettu ainakin 1990-luvulta lähtien, että apinat ovat herkkiä useita koronavirukset, ja että sama coronavirus voi tartuttaa eri lajien apinoita (esim: Ensimmäinen kokeellinen infektio apinoiden mukaan koronavirus (CV) on kuvattu 1994 , suoritettiin makakit ( Macaca mulatta ), jossa on siirrostetaan kannan CVRM 281 uutettu kuolleen rhesus-apina, vaan makakit kehitetty krooninen sairaus, jossa on ajoittain pahenemisvaiheita ja viruksen pysyvyyttä. Oireet olivat ruoansulatuskanavan ( enterokoliitti ) ja hengitysteiden ( keuhkokuume ); jossa ominaisuus histologisia vaurioita ).
Kymmeniä koronaviruksen (CV) isolaatteja on tutkittu Papio hamadryasissa ja spontaanisti infektoiduissa reususapinoissa ; kaksi näistä isolaateista valittiin simian Coronaviruksen (CoV) prototyyppikannoiksi: CVRM 281 (reesusapina) ja CVP 250 ( Papio hamadryas ); ne kuuluvat nisäkkään CoV-antigeenien toiseen ryhmään, jolla on prototyyppikanta HCV OC 43, mutta ne eroavat jälkimmäisestä. Jo 1990-luvulla apinoita ehdotettiin eläinmalliksi ihmisen koronavirusten tutkimiseen.
Apinoilla, jotka ovat suuria apinoita ( simpansseilla , bonoboilla , 2 gorillalajilla , 2 orangutanilajilla ), on genomi, joka on hyvin samanlainen kuin ihmisen. Muut kädelliset, geneettisesti vähemmän läheiset sukulaiset, ovat kuitenkin alttiita monille mikrobeillemme, siihen saakka, että niitä käytetään eläinmallina . Esimerkiksi maaliskuun lopulla BioRxivillä julkaistun tutkimuksen mukaan SARS-CoV-2- rokote , joka on kokeellisesti talletettu makaki- apinan silmän sidekalvoon , on jälkimmäiselle tarttuvaa. SisäänTammikuu 2021, kaksi giorillaa San Diegon eläintarhassa ( Kalifornia ) sai viruksen.
Keski-maaliskuu 2020, IUCN muutti suosituksiaan nostamalla vähimmäisetäisyyden 10 metriin pitääkseen mukana seitsemän isojen apinoiden lajia, "lähimmät sukulaiset, jotka ovat peräisin 21 Afrikan maasta ja kahdesta Kaakkois-Aasian maasta (...) kuten uhanalaisten tai äärimmäisen uhanalaiset on punainen kirja ” ; ja kenenkään, joka on sairas tai ollut tekemisissä sairaan henkilön kanssa viimeisten 14 päivän aikana, "ei pitäisi sallia lähestyä apinoita" . Amerikkalaisen akateemisen asiantuntijan Thomas Gillespien ja kaksikymmentäviisi hänen ikäisensä mukaan Nature-lehden julkaisemassa avoimessa kirjeessä : covid-19-pandemia on "potentiaalisesti tuhoisa apinoiden tilanne . On paljon vaarassa niille, jotka ovat sukupuuttoon vaarassa ” . Vuonna 2016 Taïn kansallispuiston ( Norsunluurannikko ) luonnonvaraiset simpanssit olivat jo saaneet tartunnan ihmisen koronaviruksella. Tiedämme, että vuodesta proteiinien rakenteen ennusteet tekemät proteiini mallinnus , amerikkalainen apinoita ja jotkut kummituseläimet , lakkiaiset ja lorisoids on ACE2 juurikaan affiniteetti virus, toisaalta "kaikki Afrikkalainen ja Aasian apinoita, näytteille samoja Kahdentoista näppäimen aminohapon happotähteet ihmisen ACE2: na ” . Kädellisten tutkijat, primatologit suositellut ja vaati sulkemisen eläintarhojen ja eläinnäyttelyitä määräämättömäksi ajaksi vähentääkseen leviämisriski Koronavirus apinoita. Heitä kuunneltiin, mutta joskus useiden viikkojen kuluttua. Jotkut Kongon ja Ruandan kansallispuistot suljettiin nopeasti turistien ja jopa tutkijoiden edessä. In Borneo , suojellakseen Oranki viruksesta, Sepilok kuntoutuskeskuksen suljettiin. Ei ole yllättävää, laboratorioeläimessä tilat tai henkilöillä, jotka olivat juuri tuotu, jo 1990-luvulla, spontaani koronaviruksesta infektioita oli kerrottu, myös makakit eri lajien (mukaan lukien reesusmakakia ) ja hamadrya paviaanit . Nämä epidemiat vaikuttivat jopa 50 prosenttiin yksilöistä ja olivat jatkuvia jaksoittaisissa nousussa; oireet olivat keuhkokuume (jossa esiintyi jättiläissoluja, karniikan merkkejä ) ja / tai enterokoliitti , joka liittyi diffuuseen lymfosyyttiseen ja makrofagiseen infiltraatioon suoliston limakalvossa . Tarttuvia koronaviruksia löydettiin kuolleiden apinoiden suolistosta , haimasta ja keuhkoista ; nämä kannat on erityisesti nimetty CVMR: ksi ja CVPH: ksi, jotka on rekisteröity Venäjän kansallisessa viruskokoelmassa.
Vuonna 1994 Goncharuk ja hänen kollegansa raportoivat koronaviruksen pysyvyystapauksia ja että "tartunnan saaneilla makakkeilla oli lisääntynyt vasta-ainetiitteri omasta näistä eläimistä eristetystä CV-kannasta sekä ihmisen antigeenisesti samankaltaisesta CV-kannasta 0043. Apinoissa spontaani CV-infektio voi olla käytetään eräiden epämääräisten ihmisten sydäninfektioiden patogeneesin ja epidemiologisten ongelmien ratkaisemiseen .
Lepakoiden erityinen rooli kuuluisa, vanha ja tärkeä "säiliö" ja monet virukset (kuten Ebola, eräänlaista rabies) ja erityisesti uusia tauteja todennäköisesti siirtyä muihin eläimiin tai ihmisten. Tämä ei ole yllättävää, koska niiden iän, suuri läsnäolo maan päällä, määrä viruksia he satama ( lyssaviruksen , filoviruksen , henipavirus ja UE erityisesti, mutta myös CoVs usein havaitaan, koska yritimme niitä) ja niiden lajien lukumäärä (ne edustavat lähes neljännes erityisten monimuotoisuuden sekä tunnettujen nisäkkäiden ). Tämä rooli on kuitenkin tiedetty vasta vuodesta 2005 lähtien , joka löydettiin ensin kolmesta Miniopterus- lajista Aasiassa. Tiedämme nyt, että lepakoilla kaikkialla maailmassa on monia koronaviruksia, jotka tartuttavat muita selkärankaisia, ja jotkut koronavirukset tartuttavat ihmisiä (esim. HCoV-NL63 ja HCoV-229E ). Heidän tutkimukselleen luodun DBatVir-tietokannan mukaan vuosien 2005 ja toukokuun 2020 välillä lepakoissa tunnistettiin yli 200 uutta CoV: tä. Tähän mennessä lepakoissa tunnettu ja sekvensoitu viromi koostuu noin 35% CoV: stä. Vuoden 2010 alussa näiden virusten yli 30 täydellistä genomia oli jo sekvensoitu. Keski-Toukokuu 2020, ICTV ei ole vielä virallisesti tunnustanut tai nimeä suurta osaa näistä lepakoiden kuljettamista hyötyajoneuvoista . Lepakot kehittävät kliinisiä virus-, bakteeri- tai sienitauteja (joskus vakavien epidemioiden kanssa, kuten "valkoisen nenän" tapauksessa, mutta nämä virukset (mukaan lukien CoV: t) sietävät usein näitä eläimiä hyvin, joten ilman oireita immuunijärjestelmän erityisyyden ansiosta Ahn et ai. vuonna 2019 ja Brook et ai. vuonna 2020. kaikilla mantereilla lepakot pitävät "vain" kahta neljästä CoV: n suvusta: erityisesti alfaCoV: t (ja korkeammalla tiitterillä) ja vähemmässä määrin , alisukupuolien Sarbecovirus , Merbecovirus , Nobecovirus ja Hibecovirus beetaCoV: t , ja useampaan näistä viruksista liittyneitä samanaikaisia infektioita, Merbecovirus- alaryhmään liittyvät läheisesti MERS-CoV . tammikuu 2019, muutama kuukausi ennen “Wuhan-epidemiaa”, neljä tartuntatautien tutkijaa Hongkongista kirjoitti artikkelissa ”Eri lepakotyyppien välisten vuorovaikutusten lisäksi myös lepakoiden ja eläinten väliset vuorovaikutukset ihmisen hiirillä, kuten elävät lepakot märillä markkinoilla ja villieläinravintoloissa Etelä-Kiinassa, ovat tärkeitä yhteisvaikutusten siirtymiselle lajille ja voivat johtaa tuhoisiin maailmanlaajuisiin tautipesäkkeisiin . Ymmärtäminen, miten jotkut lepakot onnistuvat pitämään virusinfektiot jatkuvasti "hiljaisena", on toivon lähde uusille viruslääkehoitotavoille. Siten on havaittu, että joillakin lepakoilla, esimerkiksi egyptiläisillä hedelmäkakkuilla tai Rousettus aegyptiacuksella (afrikkalaisilla lajeilla), on odottamaton antiviraalinen hypervalvonta , joka tunnetaan nimellä "ikuisesti aktivoituva interferonireitti" , joka toisin kuin useimmissa tapahtuu muut nisäkkäät, ei aiheuta haitallista tulehdusta. Lepakot näyttävät menettäneen tietyt tulehdusta edistävät geenit. Tutkimme äskettäin "näiden lepakoiden ainutlaatuisten antiviraalisten suojatoimien vaikutusta itse viruksiin" , muun muassa vertaamalla yhden tyyppisten in vitro viljeltyjen lepakosolujen antiviraalisia immuunivasteita toisaalta egyptiläisestä hedelmähahmosta, lajista, jossa interferonireitti aktivoituu jatkuvasti ja toisaalta laji, joka aktivoi tämän polun vain tartunnan aikana: musta lentävä kettu ( Pteropus alecto, joka elää Indonesiasta pohjoiseen ja itään Australiaan ja on yksi zoonoottiset Lyssavirus ). Perustuu vuonna 2007 saatavilla oleviin tietoihinmaaliskuu 2020, virus, joka on geneettisesti lähinnä COVID-19: n virusta (96,2% nukleotidisekvenssin identtisyys), on BatCoVRaTG13 -kanta, joka löytyy Rhinolophus affinisista , Yunnanista (Kiina), hieman lähempänä kuin Pangolinissa esiintyvä. SisäänToukokuu 2019, ei vielä tiedetä, oliko välituote (ja / tai monistava) isäntä todella tarpeen, jotta virus pystyisi tartuttamaan ihmisiä (kuten SARS-CoV: n ja muiden HCoV: iden tapauksessa); SisäänToukokuu 2020Kaksi italialaista eläinlääkärin mikrobiologeja, Decaro & Lorusso siksi suositella ”huolellinen käyttö erityisten antigeenejä serologista diagnosointia SARS-CoV-2 eläimillä, koska Ristiinreagointia virusten suvun Alphacoronavirus laajasti levinneet eläimiin, voi tapahtua” , kuten Sun & Meng näytti vuonna 2004.
Ole kuitenkin varovainen: lepakot eivät ole ainoa koronaviruksen varasto; jyrsijän (muiden suurten taksonominen ryhmä kannalta erityisten monimuotoisuuden nisäkkäillä) ovat toinen (esim varten HCoV-OC43 ja HKU1 ); ja kun otetaan huomioon jo tehtyjen tutkimusten, tiedämme, että lepakot ja jyrsijät ovat lähde geenien useimpien α -CoV ja β -CoV , kun taas linnut näyttävät olevan tärkein säiliö gamma-CoV ja delta-CoV 2.
Nämä väitteet perustuvat filogeneettisiin todisteisiin, jotka perustuvat tällä hetkellä useissa kansainvälisissä geenipohjoissa saatavilla oleviin koronaviruksen genomisekvensseihin.
"Eläinten" koronavirukset (lepakoista tai jyrsijöistä) näyttävät tarvitsevan "väli-isäntiä" itsensä humanisoimiseksi. Of karja on ollut tässä roolissa HCoV-OC43 ja Alpakka varten HCoV-229E. Tapauksessa SARS-CoV-1 ja MERS-CoV, nämä isännät olivat vastaavasti kämmen sivetti ja dromedaari . On huomattavaa, että lepakot jakavat rottien kanssa tosiasian läheisistä ja jatkuvista sosiaalisista ja perhevuorovaikutuksista, asumisesta usein tiheissä ryhmissä ja joillekin läsnä samassa paikassa tuhansien vuosien ajan sekä suojan auringonvalossa (useimmille lajeille). . Lepakot liikkuvat myös suuremmilla etäisyyksillä, niillä on joskus huomattava pitkäikäisyys , ja niillä on usein (leutoista viileisiin vyöhykkeisiin) erilaisia kesä- ja talvipaikkoja. Näissä majoissa asuu joskus erilaisia lepakoita. Jotkut lepakot muuttavat kausiluonteisesti muuttolintujen tavoin (esim. Pipistrelle of Nathusius , Ranskassa) tai yli muutaman sadan kilometrin (esim. Tavallinen pipistrelle ). 2000-luvulla samankaltaisia koronaviruksia löydettiin jo saman lepakkalajin organismeista tuhansien kilometrien päässä olevista maista, ja eri CoV-lajeja tai -sukuja löytyy erilaisista lepakotyypeistä, samoilla roostopaikoilla elävistä hiiristä.
Tämä vaeltava ilmiö tunnetaan nykyään paljon vähemmän lepakoissa kuin linnuissa. Nämä erityispiirteet auttavat selittämään, miksi näissä eläimissä on hyvin monia viruksia; Lepakot eivät ole vain hyvä ”viruksen leviämistaksoni”, vaan ne edistävät myös geneettisiä rekombinaatioita ja viruksen geenifragmenttien interspecifistä vaihtoa, samoin kuin spesifistä transmissiota (mutta puolestaan rotat, elleivät ne ole 'siipisiä', kuljetetaan tavallisesti kuorma-autoilla, junilla, laivoilla ja lentokoneilla, ja ne käyttävät helposti viemäreitä maan alle kulkemiseen; rotat eivät kuitenkaan näytä geneettisesti olevan hyvä isäntä SARS-CoV-2: lle, kun taas joillakin hevosenkengän lepakoilla on ACD2 "kohdistettu" Ihmisillä on paljon vähemmän läheinen kosketus lepakkoihin kuin rottiin, lukuun ottamatta muutamissa tapauksissa (lepakoiden metsästys ja kulutus, lepakoiden korjuu). Lannoitteena käytettävät tai myytävät lepakoiden ulosteet ja tietyt speleologiset tai kaivostoiminnot toiminta… Vuonna 2020 Zi-Wei ja hänen kollegansa mainitsevat hiilikaivokset seurattavien kontaktien lähteenä.
OIE toteaa, että egyptiläiset hedelmä lepakot ovat saattaneet olla infektoituneita laboratoriossa ( SARS-CoV-2: lla ), mutta niillä ei ollut taudin merkkejä. Tartunnan saaneet hedelmä lepakot pystyivät välittämään tartunnan muihin hedelmä lepakkoihin ” .
Sisään maaliskuu 2019Kiinalaisella Guangdongin alueella on takavarikoitu 21 pangoliinia ihmiskauppiailta, ja useat sitten kaikki sairastuvat vakavasti, kun he ovat viikkoja kestäneet ponnisteluja heidän pelastamiseksi. Virologit kutsutaan sitten ottamaan näytteitä ja julkaisemaan tutkimus, jossa korostetaan useita virustyyppejä, mukaan lukien SARS: n lähellä olevat koronavirukset. Sitten se oli ensimmäinen koronaviruksen löydös pangoliineissa. Sisäänhelmikuu 2020Covid-19-pandemian jälkeen analyysit toistetaan ja ne osoittavat uuden Sarbecovirus-viruksen, jolla on 92% samankaltaisuutta SARS-CoV-2: n kanssa ja jonka RBD on erittäin lähellä. Samanaikaisesti muut nisäkäsviromit analysoidaan uudelleen ja Guangxin alueella vuonna 2017 takavarikoiduista pangoliineista havaitaan Sarbecovirus, jonka samankaltaisuus on 86% SARS-CoV-2: n kanssa.
Salametsästys , The liikenteen ja kaupan pangolins epäiltiin välillä helmikuu 2020 olleen rooli laukaista sairauden. Puolivälissä julkaistun tutkimuksen mukaanhelmikuu 2020, Etelä-Kiinassa useita COVID-19-virukseen liittyviä koronaviruksia (mukaan lukien yksi reseptoria sitovaan domeeniin läheisesti liittyvä) on tunnistettu geneettisesti salakuljetuksen torjuntaa varten takavarikoiduissa pangoliineissa ( Manis javanica ) . Tänä aikana tehty havainto useista pangoliinikoronaviruslinjoista ja niiden suuri samankaltaisuus SARS-CoV-2: n kanssa viittasi siihen, että Pangolineja olisi pidettävä tämän uuden ihmisviruksen mahdollisina "väli-isäntinä", ja Lam et ai. "Että ne olisi poistettava märiltä markkinoilta zoonoosin leviämisen estämiseksi" ).
Sitten tämä mahdollisuus kyseenalaistettiin sen ACE2- proteiinin mallintamisen perusteella .
Sitten uudessa tutkimuksessa ( toukokuu 2020 ) todettiin jälleen, että pangoliinin ACE2 ja viruksen proteiini S vastaavat toisiaan , mutta lisättiin, että kissa, koira ja kiinalainen hamsteri (Cricetulus griseus) ovat myös sopeutuneet siihen.
Sisään
heinäkuu 2020, vahvistetaan, että SARS-CoV-2: een liitettyjä koronaviruksia kantavat malaijin pangoliinit ( Manis javanica ), virukset, jotka kuuluvat kahteen SARS-CoV-2: een liitettyyn koronaviruksen alalinjaan, joista yhdellä on suuri samankaltaisuus domeeniin sitoutumisessa reseptoreihin SARS-CoV-2, mikä viittaa siihen, että jälkimmäinen voi johtua koronavirustapahtuman geneettisestä rekombinaatiosta, johon liittyy sekä lepakoiden että pangolinien SARS: ään liittyvää koronavirusta. SARS-CoV-2: n rekombinaatio ja / tai sopeutuminen olisi voinut tapahtua myös kolmannella lajilla sekä kosketuksessa lepakoiden että pangolinien kanssa. alkaaheinäkuu 2020, emme vieläkään tiedä varmuudella, kuka on tai ovat ”upokaslajit”, jotka mahdollistivat SARS-CoV-2: n esiintymisen, eikä tämän syntymisen tarkkaa hetkeä.
Pangoliinin ekoepidemiologista merkitystä SARS-CoV-2 : n leviämisessä ei ole vielä selvitetty. Jos näin käy, rooli on epäilemättä erilainen kuin soitti dromedaari varten MERS-CoV , koska beeta-CoVs tunnistettu pangolins ovat erittäin patogeeniseen tälle eläimelle (joka siis olla vain toivoton isäntä. For beta-CoV sidoksissa SARS-CoV-2 , joka on samanlainen palmunydin- tapauksessa SARS-CoV-1 ). Se voi olla (mahdollisesti muiden joukossa) "tehostaja-isäntä" ja "välittäjä" uudelle SARS-CoV-2- virukselle . Jos se ei ole mukana, sitä olisi edelleen tarkkailtava, koska jos sitä metsästetään edelleen ja saatetaan kosketuksiin ihmisten tai lemmikkien kanssa, se on mahdollisesti sulatusuuni toisen koronaviruksen ilmaantumiselle, tarttuvalle ja potentiaalisesti ihmiselle.
Monien zoonoosien tarttuva yhteys ihmisten ja eläinten välillä on vastavuoroinen.
Kaksi skenaariota, joissa on hyvin erilaisia asioita, ovat seuralaisen ja tuotantoeläimen (tarkoitettu lihan, maidon, nahan jne. Tuottamiseen). Näiden kahden luokan välillä on lemmikkieläinten jalostaminen, myydään verkossa tai lemmikkikauppojen kautta .
Panos: lähellä ihmisiä erityisesti koirille, kissoille ja lapsille, etenkin synnytyksen aikana , metsästyskoirat ja -kissat (kun he tuovat takaisin hiiriä, haikaroita, nuoria rotteja jne.) Voivat olla välittäjiä villieläinten ja ihmisten välillä. Eläimen nuoleminen ja koskettaminen hyväilemällä ovat silloin usein. kysymykset: Voiko ihminen tuomita heidät, saastuttaa hänet vastineeksi olemalla terve kantaja? Yleensä, lukuun ottamatta epätodennäköistä mutaatiotapahtumaa, koronavirukset, kuten influenssavirus, näyttävät tarvitsevan väli-isäntiä ( koronaviruksen tapauksessa aina nisäkkäitä , toisin kuin influenssavirus) "inhimillistämiseksi", toisin sanoen mutaation ja hankkia kyky pystyä tartuttamaan ihmisiä;
Tunnetut (tai oletetut) väli-isännät ovat olleet kolme kotieläintä:
Dromedaari varten MERS-CoV . ja metsästetty tai salametsästetty eläin ( Masked Civet SARS-CoV : n tapauksessa ).
Confinements kaupunkien, alueiden ja koko valtioiden sekä sosioekonomiset seuraukset pandemian COVID-19 kriisi on ollut myös useita siihen liittyviä ja epäsuoria vaikutuksia, joista jotkut voivat ainakin väliaikaisesti, vaikuttaa positiivisesti luontoon. Esimerkiksi :
Kuten erilaisten loisten , bakteerien ja viroosien (erityisesti ebolan ja lintuinfluenssan ) kohdalla, eläinten tai bushmeat-lihan metsästys ja kauppa voivat kuljettaa mikrobia ja myötävaikuttaa uusien kantojen esiintymiseen, jotka voivat olla patogeenisempia tai kohdistaa uusia lajeja.
Helmikuussa Kiina kielsi villieläinten kaupan ja kulutuksen (kielto oli jo SARS-ajankohtana, mutta kauppa jatkui sitten), ja huhtikuussa kissat ja koirat suljettiin virallisesta syötävien eläinten luettelosta.
Kansalaisten vetoomusten maailmassa erilaiset luonnonsuojelujärjestöt, tutkijat ovat myös vaatineet nopeasti ihmisravinnoksi tarkoitettujen luonnonvaraisten eläinten kaupan täydellistä rajoittamista erityisesti kosteilla markkinoilla, joita pidetään alueilla, joilla on suuri tartuntariski. lajien väliset rekombinaatiot, vaikka tämäkin toimenpide muistuttaisi Eskewin ja Carlsonin kesäkuu 2020) ei riitä torjumaan kaikkia zoonoottisia pandemioita. Joillekin köyhille tai metsästäjä-keräilijöille nämä lait ovat käsittämättömiä tai niitä on vaikea noudattaa; Ebolan yhteydessä paikalliset bushmeat-lihakaupan kiellot vahvistivat laittomia piirejä (vielä vaikeampaa hallita), ja nämä kiellot heikensivät joidenkin paikallisten väestöjen luottamusta terveyskriisin johtajiin ja ympäristönsuojelijoihin, joiden koettiin tai esitettiin haluavansa riistää väestöltä ilmainen ruoka.
Kaikki yksisäikeiset RNA-virukset mutatoituvat helposti ja paljon enemmän ja useammin kuin DNA-virukset. Mutaatiot, jotka tekevät poikkeuksellisesti näistä viruksista tarttuvampia ja / tai virulentisempia, voivat erityisesti huomaamattomasti esiintyä lajien hyppyjen yhteydessä eri eläinisäntien sisällä ja esiintyä siellä, missä sitä ei odotettu. Tämä jatkuva geneettinen poikkeaminen vaikeuttaa rokotuksia ja tiettyjen lääkkeiden tehokkuutta CoV: tä vastaan (mutta ne ovat edelleen mahdollisia ja toivottavia ja Zi-Wei: n mukaan (Toukokuu 2020) "Teoreettisesti geneettinen ajautuminen ei todennäköisesti tee SARS-CoV-2-rokotteita ja viruslääkkeitä tehottomiksi" ). Nämä jatkuvat muutokset tekevät myös ekoepidemiologisen seurannan vaikeaksi ja aikaa vieväksi.
CoV: iden genomisen RNA: n epätavallisen pitkä koko antaa heille todennäköisesti lisää "plastisuutta" mutaatioiden ja rekombinaatioiden genomin modifioinnissa . "Se lisää täten spesifisten koevoluutioiden todennäköisyyttä , mikä on hyödyllistä uusien CoV: iden syntymiselle olosuhteiden tullessa sopiviksi .
"
Kaikkiin RNA-viruksiin verrattuna SARS-CoV-2: lla (kuten kaikilla CoV: llä) on kohtalainen tai korkea mutaatiokyky. Molekulaarinen epidemiologia käyttää näitä mutaatioita seuraamaan viruskantojen maailmanlaajuista leviämistä ja evoluutiota ja havaitsemaan mahdolliset mutaatiot, jotka saattavat tehdä sukulinjoista virulentisempia ja / tai tarttuvampia ja / tai vaikeuttaa rokotteiden ja tehokkaiden lääkkeiden tuotantoa "muuttamalla vasta-aineet ja T-solut patogeenin tunnistamiseksi " . Nämä mutaatiot on lueteltu erityisesti Glasgow'n yliopistossa .
Näyttää myös siltä, että CoV: t mutatoituvat keskimääräistä enemmän, kun ne eivät ole hyvin sopeutuneet isäntäänsä.
Tammikuusta vuoteen 2007 saatujen tietojen mukaan Toukokuu 2020, SARS-CoV-2 mutatoituu hieman hitaammin kuin SARS-CoV-1 . Tämä viittaa siihen, että uusi SARS-CoV-2 (myös hieman vähemmän virulentti) on sopeutunut ihmisille paremmin kuin SARS-CoV-1 (zi-Wei & al. (2020) mukaan "luultavasti se on jo mukautettu toiseen ihmisen lähellä oleva isäntä (...) tämä koskee myös MERS-CoV: tä , joka on hyvin sopeutunut kameleihin ” ).
Viruksen mutaatioiden joukossa emme tiedä, mikä osa niistä on elinkelpoisia. Ohitamme myös luonnollisten ja spontaanien mutaatioiden ("normaalit" RNA-kopiovirheet) osuuden verrattuna muihin mutaatioihin, jotka johtuvat mahdollisesti mutageeneista, jotka kykenevät joko vahingoittamaan virus-RNA: ta tai muuttamaan solukoneistoa. Tunnettujen CoV-genomien keskimääräinen keskimääräinen substituutioaste on kuitenkin arvioitu: se on noin 10-4 substituutioita vuodessa ja paikkaa kohden (keskimääräinen koronavirus mutatoituu noin miljoona kertaa useammin kuin isäntänsä). Tämä mutaatioaste vaihtelee vaiheen ja viruksen sopeutumisasteen mukaan isäntään.Nimi = zoonoottinen alkuperäZiWeiYuan2020 /> (tai uusi isäntä syntyvän taudin tapauksessa ).
In CoVs deleetio uusinta exoribonuclease johtaa erittäin korkea mutability. Useimmat mutantit eivät ole elinkelpoisia, mutta mitä enemmän niitä on, sitä suurempi on uuden variantin tai vaarallisen uuden viruksen syntymisen riski. Vuonna 2020 Patrick CY Woo ym. (joka tutki CoV: n lajien välisiä hyppyjä) toteaa, että Remdesivir (lääke, jota ehdotetaan COVID-19: lle ) on nimenomaan tämän eksoribonukleaasin (ja RNA: sta riippuvan RNA-polymeraasin) estävä nukleotidianalogi.
Kaikista viruksista CoV: llä on epätavallisen pitkä ja monimutkainen RNA. Niiden monimuotoisuus näyttää johtuvan suurelta osin niiden mutoituvuudesta ja RNA: n korkean taajuuden rekombinaatiosta . Nämä rekombinaatiot näyttävät olevan spontaaneja, ja ne tapahtuvat jopa ilman selektiivistä painetta .
Fylogeneettisiä todisteita luonnollisista rekombinaatioista on CoV: ssä. Ne on dokumentoitu eläinten CoV: ssä (kuten lepakko SL-CoV ja batCoV-HKU9), mutta myös ihmisiä infektoivissa COV: issä (sekä HCoV-HKU1- että HCoV-OC43-viruksilla).
CoV-genomit sisältävät monia ainutlaatuisia avoimia lukukehyksiä , ja proteiinifunktiot koodaavat kohti genomin 3'-päätä (alue, jolla tiedetään olevan tärkeä rooli muissa viruspatologioissa).
Lisäksi CoV: t vaihtavat malleja satunnaisesti ja usein RNA: n replikaation aikana. He tekevät tämän ainutlaatuisen "kopiovalintamekanismin" avulla. Kun isäntä toimii rekombinaatioupokkaana, RNA-juosteen vaihto tapahtuu usein RNA-transkription aikana. Pitkät RNA-palat ja / tai lyhyet, erittäin homologiset subgenomiset yksiköt voivat sitten rekombinoitua uusien CoV: iden muodostamiseksi.
Nämä rekombinaatiot, kuten mutaatiot, ovat todennäköisesti usein suurimmaksi osaksi vahingollisia tai neutraaleja virukselle, mutta ne mahdollistavat joskus tehokkaiden serotyyppien ja biotyyppien syntymisen (homologisesta RNA: sta vaihtamalla vastaavia sekvenssejä CoV: iden välillä). Esimerkiksi uusi koronavirus, joka on vastuussa lintujen keuhkoputkentulehduksesta ja joka havaittiin 1990-luvulla , osoittautui Jia & al: n (1995) mukaan olevan seurausta kolmen eri koronaviruskannan RNA: n rekombinaatiosta. Lisäksi, kun solu on infektoitu samanaikaisesti useilla eri viruksilla, heterologiset RNA-rekombinaatiot (ts. Koronaviruksen RNA: n ja ei-koronaviruksen lähteistä peräisin olevan RNA: n välillä) ovat mahdollisia. Kun ne ovat "elinkelpoisia", nämä rekombinaatiot ovat neutraaleja tai tarjoavat uusia geenejä, jotka mahdollistavat mahdollisesti syntyvän koronavirus- tai jopa uuden koronaviruksen kannan, jolla on uusia ominaisuuksia.
Tämä voimakkaan oksentelun puhkeaminen alkoi vaivata englantilaisia koiria ennen COVIDin alkamista. Se johtuu toisesta koronaviruksesta (raportoitu muutama kuukausi ennen COVIDia Yhdistyneessä kuningaskunnassa). Tämä on esimerkki ajallisesta sattumasta kahden koronavirusepidemian välillä, jotka johtuvat kahdesta viruksesta, jotka mahdollisesti kykenevät rekombinoitumaan, jos koirilla esiintyy samanaikaisia infektioita tai koirien on osoitettu olevan infektoituja SARS-CoV-2: lla muualla. Koiran puhkeamisen oireet ovat uneliaisuutta, joka liittyy pitkittyneeseen ruokahaluttomuuteen, voimakkaaseen oksenteluun ja joskus ripuliin . Pieneläinten eläinlääkintävalvontaverkosto ( SAVSNET ) on myös havainnut epäspesifisen gastroenteriaalisen taudin puhkeamisen, todennäköisestimarraskuu 2019Noin ja koiran kausiluonteisen suolistosairauden normaalien vaihtelujen taustalla (minkä vuoksi puhumme epidemiasta) on tunnistanut syylliseksi koiran enteerisen koronaviruksen (tunnetaan nimellä CECov "koiran enteerinen koronavirus").
- - 16 koiraa 39: stä ensimmäisestä testatusta (PCR) eli 41% oli positiivisia CECoV: lle (kun taas 0 16 kontrollitapauksesta oli).
- - Ulosteet ja oksennukset olivat useammin positiivisia kuin suun kautta otetut vanupuikot .
CECoV on tunnettu syy (yli 10 vuotta) lievään ripuliin tai epäyhtenäisiin infektioihin, mutta se on paljon harvinaisempi syy kuin CPV ( koiran parvovirus ). CECoV EI liity tunnettuihin ihmisen koronaviruksiin, mukaan lukien äskettäin ilmestynyt SARS-CoV-2.
Päivänähuhtikuu 2020, ANSES katsoo, ettei ole tieteellistä näyttöä siitä, että kotieläimillä (seuralaiseläimillä tai tuotantoeläimillä) olisi epidemiologinen rooli SARS-CoV-2: n leviämisessä. Sama koskee Yhdysvaltojen CDC: tä , WHO: ta ja OIE: tä . Jotkut eläimet, jotka ovat läheisessä yhteydessä ihmisten kanssa, jotka ovat mahdollisesti tai lopullisesti infektoituneet SARS-CoV-2: lla, ovat saaneet positiivisen tuloksen.
Niistä noin kahdellakymmenellä kissalla todettiin positiivinen SARS-CoV-2. Vaikka tämä määrä on todennäköisesti aliarvioitu, eläinlääkintäviranomaiset puhuvat satunnaisista tapauksista. Saastuminen johtuisi eläimen kanssa elävistä ihmisistä, mutta kiinalaiset tutkijat ovat osoittaneet, että kissojen saastuminen oli mahdollista, mikä on vahvistettu japanilaisessa tutkimuksessa. Toisaalta kissojen aiheuttama ihmisten saastuminen ei tällä hetkellä ole mahdollista. Saastuneet kissat olivat yleensä lieviä tai jopa oireettomia, mutta joissakin tapauksissa ruoansulatusoireita, sydämen vajaatoimintaa tai hengitysvaikeuksia, joihin liittyy yskää, esimerkiksi Bordeaux'n potilaan tapauksessa. Nuoret pennut olisivat vieläkin herkempiä. Vaikka kissat näyttävät alttiilta, joillakin on oireettomia muotoja, kun taas toisilla on yskää, hengitysvaikeuksia, ruoansulatushäiriöitä, kuumetta ja jopa yhdellä potilaalla verenvuotohäiriöitä ja sydämen vajaatoimintaa. Eläinten SARS-CoV-2-infektioiden kliininen tutkimus on kuitenkin edelleen hyvin rajallinen. Vahvistetut tapaukset on lueteltu OIE: n verkkosivustolla:
SARS-CoV-2 on vaikuttanut muihin kissan lajeihin. Esimerkiksi New Yorkin eläintarhassa (Bronxin kaupunginosassa) parantajansa tartuttama neljä tiikeriä oli kuiva yskä ja ruokahaluttomuus. Lisäksi Intiassa havaittu kuumeinen villi tiikeri on saattanut kuolla koronavirukseen. Intian viranomaiset ovat toteuttaneet varotoimenpiteitä varastoissa, joissa tämä eläin elää, jo vaarassa sukupuuttoon. Kolme leijonaa on saanut positiivisen tuloksen samalla Bronxin eläintarhalla. Heillä oli kuiva yskä ja ruokahaluttomuus, lukuun ottamatta yhtä, joka oli oireeton.
Koirilla on todettu ensimmäinen luonnollinen infektio Hongkongissa, 28. helmikuuta 2020, koiralla, jolla ei ole oireita ja jolla on alhainen viruskuorma. Tämä eläin kuoli16. maaliskuuta, tietämättä syytä. Toinen koira oli positiivinen Hongkongissa20. maaliskuuta 2020. Saastunut mopsi puolestaan Yhdysvalloissahuhtikuu 2020, oli oireita (aivastelu, ruokahaluttomuus, kuiva yskä). Tämä rotu voi olla haavoittuvampi.
Monilla Alankomaissa Eindhovenista itään sijaitsevilla maatiloilla kasvatetuista 20 500 minkistä, jotka saivat SARS-CoV-2: n, kehittyi hengitysvaikeuksia. Myös kuolleisuuden kasvu on havaittu. Ensimmäiset sairastuneet eläimet olisivat olleet työntekijöiden saastuttamia, ja heillä olisi ollut oireita ilman, että niitä olisi testattu, ja röyhkeydellä olisi ollut merkitys viruksen jatkumisessa tiloilla. Viranomaiset ovat sulkeneet nämä kaksi maatilaa ja asettaneet ympärilleen 400 metrin turva-alueen , vaikkakaan minkään tartunnan tapausta minkistä ihmisiin ei ole todettu. Alankomaiden maatalousministeriö on päättänyt jatkaa6. kesäkuuta 2020 10000 minkin teurastus, jotta estetään niiden tuleminen ihmisten saastumisen lähteeksi.
Japanilainen tutkimus osoittaa, että kokeellinen siirto laboratoriossa kissasta kissaan on mahdollista ja kannustaa ennalta varautumiseen herättämällä mahdollisen ketjun saastumisen kissoista ihmisiin ja kissojen roolista kontaminaatioissa. Toisaalta tutkimus osoitti, että Wuhanissa 102 testatusta kissasta 15: llä oli kehittynyt vasta-aineita, mikä viittaa SARS-Cov-2 -infektioon. Koirat olisivat vähemmän herkkiä kissaeläimille SARS-CoV-2: lle, koska kiinalaisen kokemuksen mukaan koirat olisivat olleet nopeasti neutraloineet viruksen (aktiivisia aineita ei löydy) eikä heillä ollut oireita.
Lisäksi kiinalaiset tutkimukset ovat osoittaneet fretin herkkyyden koronavirukselle, ja oireet (kuiva yskä) ovat ilmeisempiä kuin kissoilla. Yksi näistä tutkimuksista vahvisti myös SARS-CoV-2-tartunnan mahdollisuuden frettien välillä. Hamsterilla on sama herkkyys virukselle kuin freteille. Niitä käytetään tieteellisessä tutkimuksessa immuunivasteen tutkimiseen virukselle, joka on samanlainen kuin ihmisen kehittämä Covid-19.
Tutkimuksen osana SARS-CoV-2: lla saastuneista reesusmakakkeista kehittyi hengitystiesairaus 8-16 päivän ajan, samanlainen kuin ihmisillä havaitut kohtalaiset Covid-19-muodot. Keuhkoinfiltraatit olivat näkyvissä rintakehän röntgensäteillä, kuten ihmissairaudessa. Suuria viruspainoja havaittiin kaikkien eläinten nenässä ja kurkussa sekä keuhkoputken alveolaarisissa peräruiskeissa. Yhdessä niistä havaittiin pitkittynyt rektaalinen purkautuminen. Luonnollista saastumista tai leviämistä makakien välillä ei kuitenkaan ole havaittu. Esijulkaisu paljasti, että tutkittuja eläimiä ei voitu saastuttaa uudelleen toipumisen jälkeen, mutta näytteen pieni koko ei salli lopullisten johtopäätösten tekemistä. Rokotekandidaattia testataan tällä hetkellä tällä eläinlajilla alkusoittona mahdollisille kokeille ihmislääketieteessä.
Kiinalaisten tutkimusten mukaan ankat, kanat ja siat eivät ole alttiita uudelle koronavirukselle (SARS-CoV-2), mukaan lukien suurilla inokuloiduilla annoksilla. Samoin laboratoriossa erittäin vaikeissa rokotusolosuhteissa hiiret näyttävät olevan heikkoja SARS-CoV -2 isäntää. Ottaen huomioon eläinmallin hyödyntämisen merkitys infektioprosessien tutkimisessa laboratoriossa, ACE2- reseptorin ihmismuotoa ilmentävät hiiret testattiin, ja niiden osoitettiin pystyvän lisääntymään viruksen keuhkoissaan, mikä avasi oven nopeutetulle tutkimukselle antiviraalinen terapia , rokotteet ja yleinen synnyssä .
On tieteellinen yksimielisyys , että tietyt luonnonvaraiset lajit ovat luonnostaan lähes jatkuvasti kantajia Koronavirusten (jonka kanssa heillä on yhteistyössä kehitetty tuhansia vuosia), ilman merkittäviä vaikutuksia.
Saatavilla olevat koronaviruksen genomisekvenssit ja luonnollisessa ympäristössä tehdyt tutkimukset osoittavat, että on vähintään kaksi isoa eläinryhmää (voisi olla muita, joita ei ole vielä testattu), jotka muodostavat CoV: n päävaraston yleensä;
Ensimmäinen vihje SARS-CoV-2 : n erityistapauksessa on, että se näyttää syntyneen (vuonna 2019 ) uuden zoonoosin syntymistä edistävässä yhteydessä .
Retrospektiiviset epidemiologiset tutkimukset osoittavat, että ensimmäisten kiinalaisten potilaiden joukossa monet olivat suoraan tai epäsuorasti altistuneet luonnonvaraisille riistoille , äyriäisille tai eläville linnuille ja nisäkkäille , joita myytiin Huanan Seafood Wholesale Market -markkinoilla (kunta sulki COVID-19- epidemian alkamisen jälkeen) päällä1. st tammikuu 2020 ; se on Keski-Kiinan suurin kala- ja äyriäismarkkinat, mutta se oli suosituin bushmeat-lihan ( kiinalaiset te wei ) ja erittäin kysyttyjen eksoottisten eläinten myynnin vuoksi Kiinassa. Näillä markkinoilla otettu valokuva näyttää 112 "tavaran" hinnan, mukaan lukien nisäkkäät ( sika , kameli , lammas , peura , kenguru , kani , majava , rotta , piikkisika , murmeli , mäyrä , saukko , sivetti , koira , kettu , pennut , siili ), linnut ( siipikarja , strutsi , riikinkukko , fasaani ), matelijat ( krokotiili , kilpikonna , erilaiset käärmeet, mukaan lukien bungarus multicinctus ), sammakkoeläimet ( sammakot , jättiläinen salamanteri ), niveljalkaiset ( kabadit , skorpionit , tuhatjalkaiset ) jne.
Näitä markkinoita kutsutaan märkämarkkinoiksi, koska ne myyvät perinteisesti eläviä ja kuolleita eläimiä ulkona, rottien, kärpästen, kissojen ja lintujen ulottuvilla, missä eri lajien veri ja muut kehon nesteet edustavat poikkeuksellista tautien leviämisen lähdettä. ja lajiesteet ja geneettisen rekombinaation taudinaiheuttajien, kuten bakteerien ja niiden aiheuttajien viruksia . Edellä olevassa luettelossa näillä markkinoilla myydyistä kameleista ja siviiteistä tiedetään olevan SARS: n ja MERS: n väli-isäntiä , molemmat pandemian alkaessa.
Ainakin 5 muuta väli-isäntiä ensin katsotaan mahdollisiksi "hosts" rekombinaatiota ja humanisointia virus: kaksi lajia lepakoiden , Pangolin , kämmen sivetti , dromedaari ja Homo sapiens itse. Dromedaari suljetaan pois tästä luettelosta viimeistäänToukokuu 2020.
Vihjeitä viruksen ja eläimen välisestä suhteesta tarjoaa tutkimus tietyillä lajeilla reseptoreista , joita virus käyttää kiinnittääkseen isäntänsä (keuhkosolut tai ruoansulatuskanava) solujen pintaan.
Näillä reseptoreilla on "lukko", jota varten viruksen "avain" on mukautettava; ne ovat siten merkittävä tekijä viruksen tartuntakyvyssä ja epidemia- tai pandemiariskissä.
Keski-maaliskuu 2020 tiesimme jo tältä osin, että:
SARS-CoV-2: n kirjekuoressa on "glykoproteiinin huippu" " S " hyvin erityinen alue, jota kutsutaan "moniemäksiseksi furiinipilkkomiseksi" (kirjain S tulee englanninkielisestä sanasta Spike ), joka näyttää selittävän sen patogeenisyyden ihmisille ja muut lajit (erityisesti jotkut suuret apinat).
Kaksi ensimmäistä ( genomityyppistä) tutkimusta, jotka Journal of Proteome Research -lehti julkaisi Guangzhoun (Kiina) tutkijoiden toimesta, päätyivät aluksi siihen, että oli suuri todennäköisyys, että välilajit, joihin SARS-CoV-2: n inhimillistäminen olisi asettanut joko Pangoliini (pitkä kuono ja vaa'oilla peitetty nisäkäs, jota käytetään laajasti perinteisessä kiinalaisessa lääketieteessä, metsästetään ja salametsästetään voimakkaasti Etelä-Kiinassa ja Afrikassa) eikä käärme tai kilpikonna , mutta se osoittautuu myöhemmin ( proteiinihomologian mallintamisen perusteella ), että Pangolin ACE2: ta ei ole konfiguroitu optimaalisesti sitoutumaan viruksen Spike-proteiiniin. Silti proteiinimallinnuksen perusteella välilajit voisivat kuulua sikojen sijaan Bovidae- ryhmään tai Cricetidae- ryhmän jyrsijöihin sikojen sijaan kolmen Shandongin yliopiston tutkijan mukaan (Luan & al;1. st huhtikuu 2020), jotka ACE2- proteiiniensa ominaisuuksien perusteella uskovat, että Bovidae- ja Cricetidae- ryhmien ( erityisesti kultainen hamsteri ) pitäisi olla SARS-CoV-2: n suhteen seulottavien väli-isäntien joukossa (tähän ryhmään kuuluvat erityisesti myyrät , rotat ja hiiret , monien muiden virusten ja muiden taudinaiheuttajien vektorit); Nämä samat kirjoittajat huomauttavat, että (kädellisten ACE2: n lisäksi) valaiden ACE2 on (edelleen mallin mukaan) "tunnustettu" myös SARS-CoV-2: n toimesta . Kuitenkin endeemisen, harvinaisia ja uhanalaisia alalajeja valaiden ( Neophocaena phocaenoides asiaeorientalis , joka tunnetaan nimellä Yangtze pyöriäinen), makean veden , asuu alajuoksulla Jangtse ja sen järvet, ei kaukana Wuhan ; kirjoittajat ehdottavat, onko hän saanut tartunnan SARS-CoV-2: lla tai siihen liittyvällä koronaviruksella.
Toinen tutkimus (Luonto,huhtikuu 2020) osoittaa, että Malesian Pangolin ( Manis javanica ) kuljettaa koronavirusta, joka on hyvin samanlainen kuin SARS-CoV-2, mutta se ei ole ainoa. Pangoliinien osoitettiin sitten kantavan kahta koronavirusten filogeneettistä linjaa lähellä SARS-CoV-2: ta (PCoV-GX ja PCoV-GD). PCoV-GD-linjan huippuproteiinilla on reseptoreihin sitoutumismotiivi, joka on melkein identtinen SARS-CoV-2: n kanssa, mutta näiden "Pangolin" -koronavirusten täydellä genomilla on vain 85,5% 92, 4%: n nukleotidihomologiassa SARS-CoV: n kanssa. -2 (kun taas SARS-CoV-1: llä ja MERS-CoV: llä oli 99,6% ja 99,9 %% homologia palmunydinsiibetillä ja genomin dromedaarisekvenssillä ihmisen vastineen kanssa. Siksi vuoden 2020 alussa testatut Pangolins eivät todennäköisesti ole välitön välitön isäntä On vielä selvitettävä, onko SARS-CoV-2 peräisin muista Pangolins tai muista lajeista.
Epidemiologiset ja patogeneettiset vahvistukset vievät aikaa, mutta vallitsee yksimielisyys siitä, että luonnonvaraisten eläinten tai näiden elävien jäänteiden esille tuominen eläimillä markkinoilla sekä niiden kuljettaminen ja kuluttaminen olisi "ehdottomasti kiellettävä".
Huhtikuun puoliväliin mennessä 14 nisäkäslajia oli tutkittu tarkemmin niiden ACE2- reseptorien ominaisuuksien kannalta . Useat näistä lajeista ovat alttiita SARS-CoV-2- virukselle ; herkimpiä lajeja olivat ihmiset ja reesusapinat ja vähiten herkkiä rotat ja hiiret ; ja muiden lajien joukossa kanin ACE2 ja Pangolin sitoutuivat voimakkaasti SARS-CoV-2 S -proteiinin S1-alayksikköön (lisäksi kokeellisesti havaittu infektio).
Kani , joka on jänikset hyvin metsästää ympäri maailmaa, mahdollinen saalista minkin (myös altis COVID-19 virus ), helposti joutuessaan lannan , lietteen ja jäteveden tähteet levittää pelloille tai niittyjä, ja joka on tehty esittelyt Ranskassa virkistysmetsästykseen ("keinotekoiset varusteet") ja monilla maatiloilla sen lihan, ihon tai angorahiusten vuoksi) on ACE2, joka voi tehdä siitä erittäin alttiita pandemiavirukselle. Kiinasta on tullut maailman johtava turkisten tuotantoa kaneista, myös kaupungin Daying ja Zhangjiakou (jonka pitäisi, jossa Peking , isäntä talviolympialaiset 2022) on tehnyt erikoisuus karjansa teollisissa hutches jotka usein naapurimaiden naapuritiloilla ( "edellisen keisarillisen Qing-dynastian aikana menestynyt nahkateollisuus työllistää edelleen alueella 70 000 ihmistä (...), minkä pitäisi tuottaa tänä vuonna yli 5 miljardia dollaria. yuania (734 miljoonaa euroa) tuloja , lääninhallituksen mukaan. ” Minkki on kuitenkin myös altis virukselle, kuten Alankomaissa käy ilmi, että virus on tartuttanut kaksi minkkitilaa (kaksi maatilaa. Lisäksi maatilat on tuomittu huonojen käytäntöjensä vuoksi (menevät niin pitkälle kuin mahdollista). elossa olevina nahoina)
Huolta SARS-CoV-2: n leviämisestä suurilla apinoillaHominidien kädellisistä , joihin kuuluvat ihmiset, simpansseilla, gorilloilla ja orangutaneilla on vahva geneettinen läheisyys ihmisiin (98,5% simpansseille ja gorilloille ja 96% orangutaneille -utanille). Tämä herättää huolta mahdollisesta tartunnasta jo hyvin heikoille populaatioille. Tiesimme, että gorilla oli jo herkkä muille ihmisen koronaviruksille, kuten HCoV-OC43, ja yleisemmin ihmisviruksille , kuten Ebola-virukselle , joka oli jo tappanut kolmanneksen gorilloista. Kongon demokraattisessa tasavallassa on toteutettu suojatoimenpiteitä erittäin uhanalaisten vuorigorillan lajien suojelemiseksi sulkemalla heidät vastaanottava Virungan luonnonpuisto , kunnes1. st kesäkuu 2020. Ruanda on toteuttanut vastaavia toimenpiteitä, mutta ne on jopa ulotettu koskemaan tieteellistä tutkimusta. Uganda ei puolestaan ole toteuttanut mitään erityistoimenpiteitä. Eläintarhat ovat yleensä olleet suljettuja yleisölle, ja talonmiehet ovat omaksuneet ennalta varautumisen käytäntöjä. Sisäänmaaliskuu 2020Tutkijat pitivät komplikaatioiden riskiä suurena, varsinkin kun hengityssuojaimen asettaminen mahdottomaksi ja kädellisten fyysinen etäisyys on vaikeaa. Kaksi ensimmäistä eläintarhassa testattua gorillatapausta raportoitiin vuoden 2021 alussa San Diegossa (karanteenissa, yskä ja vähäinen ruuhkautuminen).
2000- luvun alusta lähtien monet ekologit , virologit ja eläinlääkärit ovat varoittaneet, että vakavan zoonoosin pandemian ehdot ovat täyttyneet. Influenssapandemia oli kaikkein julkisuutta ehdokas mutta kolme emergences koronaviruksesta "humanisoidut" 20 vuodessa Myös antoi ymmärtää, että nämä virukset on myös seurattava tiiviimmin rajapintoja ihmisten ja eläinten terveydelle .
Toistuvista varoituksista huolimatta "ei ole toteutettu merkittäviä toimenpiteitä ihmisen ja eläimistön tiukan ja toistuvan kosketuksen rajojen poistamiseksi (...) Vaikka viruksen evoluution taustalla olevat biologiset mekanismit eivät ole ihmisen hallinnassa, sosiaaliset ja kulttuuriset tavat muutetaan vastaavasti syvällisten ja vaikuttavien tiedotuskampanjoiden avulla. Jos tiivistämme ihmisten tottumusten mukaisesti nykyaikaisen maatalouskäytännön ja kaupungistumisen vaikutukset ja villieläinten elintilojen vähenemisen, on tarpeeksi helppoa ymmärtää, että ellei vastatoimenpiteitä toteuteta, kohtaamme edelleen vakavia eläinten terveydellisiä hätätilanteita seuraavissa tapauksissa: vuosia, joilla on valtava sosiaalinen ja taloudellinen vaikutus elämäämme. Kuten SARS-CoV-2: n ilmaantuminen selvästi osoittaa , CoV: t ovat tärkeimmät toimijat tässä monimutkaisessa palapelissä, jolle on ominaista virusbiologisten mekanismien ja ihmisen tottumusten vuorovaikutus " .Toukokuu 2020Decaro ja Lorusso. Heidän mukaansa yksilöiden ja kollektiivisten reaktioiden aktiivinen valmistelu virusten aiheuttaman lajiesteen tulevista läpäisemisistä eläimistä ihmisiin on edelleen kansanterveyden prioriteetti . Näiden kahden tartuntatautiasiantuntijan mukaan "massiivinen" genomiseuranta on siksi välttämätöntä villieläimille (eikä vain CoV: lle), samoin kuin luonnonvaraisissa eläimissä ja potilaissa havaittujen SARS-CoV-2-kantojen massiivinen ja jaettu sekvensointi. ovat kehittäneet COVID-19: n ymmärtääkseen COVID-19: n alkuperän ja välttääkseen paremmin muita samanlaisia tai vakavampia pandemioita. Ennen sitä on kiireellistä;
Tutkimus on kiinnostunut myös muiden mahdollisten uusien pandemisten CoV: iden mahdollisesta syntymisestä, koska ne kykenevät lajien välisiin hyppyihin ja / tai virusten rekombinaatioon . Vertailevalla analyysillä täydellisen proteiinisekvenssin ja kuumien pisteiden (ligandia sitova domeeni) vaihtelevuudesta, joka mahdollistaa ihmisen SARS-CoV-2-viruksen vaipan (hACE2) Spike-proteiinin sitoutumisen eläinlajin ACE2: een, bioinformatiikka voi pystyy ennustamaan lajin alttiuden SARS-CoV-2: n tarttumiselle. Se voi siten ohjata seulonnan lajeihin, joilla on suurempi riski saada COVID-19-virus. Tätä varten ehdotettiin ensimmäisiä eläinten herkkyyspisteitä virukselle syyskuussa ja sitten vuonnalokakuu 2020.